MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013525	AGCTAA	2	12	70634	70645	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_013525	AAGGGG	2	12	149174	149185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013525	CCCCTT	2	12	149188	149199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013525	TAAAGA	2	12	149203	149214	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013525	CACATG	2	12	192447	192458	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013525	GATGAG	2	12	336614	336625	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013525	TAATGC	2	12	376272	376283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013525	TAATTG	2	12	437596	437607	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013525	TGCCTT	2	12	445089	445100	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013525	CCCCCA	2	12	462279	462290	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
11	NC_013525	AGGGAG	2	12	462303	462314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013525	CCCTGG	2	12	569454	569465	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013525	AGGGAG	2	12	578889	578900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013525	AACCTT	2	12	630926	630937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013525	TCTAAT	2	12	693888	693899	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013525	TGCTAT	2	12	703857	703868	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013525	AACTCC	2	12	717929	717940	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013525	AGTTAC	2	12	751301	751312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013525	TTCCAC	2	12	813268	813279	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013525	GATTGG	2	12	836303	836314	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013525	GAGGTT	2	12	859455	859466	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013525	AATGGA	2	12	871847	871858	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013525	TGCTCT	2	12	907970	907981	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013525	GGAAGG	2	12	959369	959380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013525	CAGGGG	2	12	983654	983665	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013525	CGATTT	2	12	1029800	1029811	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013525	GTAGAT	2	12	1105104	1105115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013525	TTCCAC	2	12	1139491	1139502	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013525	CTAGTG	2	12	1164349	1164360	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_013525	GGATAC	2	12	1235356	1235367	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013525	CCCACC	2	12	1247494	1247505	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
32	NC_013525	ACGCCC	2	12	1247520	1247531	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013525	TACCTG	2	12	1250097	1250108	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013525	CTGCCC	2	12	1250367	1250378	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_013525	CATGGC	2	12	1251190	1251201	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013525	CCAGCA	2	12	1252058	1252069	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013525	TCTTTG	2	12	1294633	1294644	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013525	GAGAGC	2	12	1424172	1424183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013525	CCTGTT	2	12	1446825	1446836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013525	TATAGC	2	12	1548077	1548088	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013525	CTGGTA	2	12	1564486	1564497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013525	AAATAT	2	12	1584222	1584233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013525	CTTCAC	2	12	1619953	1619964	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013525	ACAAAC	2	12	1636434	1636445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013525	GGGGCA	2	12	1701794	1701805	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013525	TACTAT	2	12	1704253	1704264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013525	ACCTAC	2	12	1730811	1730822	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013525	TGATTT	2	12	1775908	1775919	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013525	ATTGCA	2	12	1803691	1803702	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013525	TACTTT	2	12	1823277	1823288	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013525	TAAAGA	2	12	1855557	1855568	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013525	GATCGT	2	12	1901931	1901942	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013525	AGCCCC	2	12	1923339	1923350	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_013525	CCTGTC	2	12	1934346	1934357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013525	GGGGAG	2	12	1997606	1997617	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.