MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798 chromosome 1

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013525	CTTTT	2	10	8409	8418	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013525	ACAAA	2	10	38374	38383	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013525	AAAAT	2	10	45024	45033	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013525	AGGAA	2	10	54836	54845	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013525	CTACC	2	10	69218	69227	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
6	NC_013525	TGCAA	2	10	115356	115365	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013525	CTACC	2	10	185422	185431	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013525	TCATA	2	10	246738	246747	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013525	TTTCC	2	10	274953	274962	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013525	AGATA	2	10	293254	293263	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013525	AGAGG	2	10	294507	294516	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013525	AAATA	2	10	320134	320143	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013525	AGGGA	2	10	323573	323582	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013525	TCCGT	2	10	353320	353329	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_013525	CTCCC	2	10	401395	401404	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
16	NC_013525	ATAAA	2	10	401465	401474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013525	CCCTT	2	10	444369	444378	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_013525	TCGAC	2	10	446485	446494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013525	GGGGA	2	10	468843	468852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013525	ACCTC	2	10	476519	476528	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
21	NC_013525	ACTAG	2	10	493779	493788	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013525	CTGCC	2	10	511360	511369	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_013525	GGCAG	2	10	511385	511394	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013525	GTGAG	2	10	545720	545729	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013525	GAACA	2	10	550635	550644	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_013525	CAGGC	2	10	571370	571379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_013525	CAGGC	2	10	574085	574094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_013525	GGGAT	2	10	578855	578864	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013525	CACTC	2	10	583179	583188	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_013525	TCTTA	2	10	589069	589078	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013525	GAATA	2	10	629772	629781	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013525	TTTTA	2	10	634002	634011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013525	GTTTT	2	10	698750	698759	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013525	CCTTT	2	10	714221	714230	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_013525	GGTGT	2	10	810598	810607	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013525	CCCCT	2	10	811797	811806	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_013525	TCTGG	2	10	812052	812061	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013525	CGTGA	2	10	814149	814158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013525	TTTCG	2	10	890574	890583	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_013525	TTTAC	2	10	944033	944042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_013525	TTTGT	2	10	962187	962196	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013525	CTTGC	2	10	980914	980923	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_013525	GATTG	2	10	993818	993827	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013525	TAGCA	2	10	999809	999818	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013525	TTGCC	2	10	999951	999960	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013525	TTGTA	2	10	1038376	1038385	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013525	CGGAA	2	10	1038495	1038504	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
48	NC_013525	GTAAG	2	10	1047224	1047233	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013525	GCCAT	2	10	1047294	1047303	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_013525	CTTAG	2	10	1098007	1098016	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013525	GTAAA	2	10	1127461	1127470	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013525	GGTGT	2	10	1136821	1136830	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013525	CCCCT	2	10	1138020	1138029	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
54	NC_013525	TCTGG	2	10	1138275	1138284	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_013525	CGTGA	2	10	1140372	1140381	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013525	AAAAT	2	10	1153371	1153380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013525	TAAGA	2	10	1181911	1181920	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013525	GCAGT	2	10	1192589	1192598	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013525	TATAT	2	10	1193340	1193349	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013525	GCTTA	2	10	1225044	1225053	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013525	AAATG	2	10	1231493	1231502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013525	CGTTC	2	10	1234840	1234849	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013525	TTTGT	2	10	1235211	1235220	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013525	GCTTT	2	10	1244320	1244329	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_013525	TATAA	2	10	1244517	1244526	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013525	TGTAG	2	10	1245287	1245296	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013525	ATGGT	2	10	1246279	1246288	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013525	GATGC	2	10	1247699	1247708	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013525	TCCCT	2	10	1250727	1250736	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013525	CTCGG	2	10	1250786	1250795	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_013525	CTCCC	2	10	1251859	1251868	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
72	NC_013525	TATGT	2	10	1315148	1315157	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013525	TGCTA	2	10	1352189	1352198	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_013525	CTAAC	2	10	1370307	1370316	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_013525	CGTCC	2	10	1407430	1407439	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_013525	GTTTT	2	10	1414911	1414920	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013525	GATTT	2	10	1421089	1421098	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013525	ATGGT	2	10	1422264	1422273	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013525	ACTAT	2	10	1423290	1423299	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013525	AAAGG	2	10	1428306	1428315	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013525	CCTTG	2	10	1493023	1493032	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_013525	AAAGT	2	10	1504134	1504143	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013525	AAGTA	2	10	1504171	1504180	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013525	ATTAG	2	10	1509230	1509239	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013525	AGATG	2	10	1518738	1518747	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013525	AGTAT	2	10	1557902	1557911	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013525	ATTCT	2	10	1573419	1573428	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_013525	AGATT	2	10	1586531	1586540	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013525	GTTTT	2	10	1606596	1606605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013525	AAGGA	2	10	1625316	1625325	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013525	TACAG	2	10	1694845	1694854	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013525	GTAAG	2	10	1709504	1709513	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013525	GTTTT	2	10	1714524	1714533	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013525	AATAT	2	10	1771694	1771703	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013525	GATTT	2	10	1803647	1803656	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013525	AACAT	2	10	1816070	1816079	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_013525	ACTCC	2	10	1837991	1838000	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_013525	CCTCT	2	10	1900475	1900484	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_013525	ACCTC	2	10	1900818	1900827	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_013525	GGGTG	2	10	1901012	1901021	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013525	GGGGA	2	10	1901038	1901047	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013525	TGGGG	2	10	1901107	1901116	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013525	GCCAC	2	10	1901583	1901592	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
104	NC_013525	CCGGT	2	10	1901829	1901838	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
105	NC_013525	TGGGT	2	10	1918410	1918419	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013525	CTCCA	2	10	1924502	1924511	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
107	NC_013525	TGGAG	2	10	1925175	1925184	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013525	CGTGG	2	10	1925514	1925523	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013525	AGAGG	2	10	1927005	1927014	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013525	ACCAA	2	10	1936153	1936162	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_013525	AAACA	2	10	1940748	1940757	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_013525	GAGCT	2	10	1964077	1964086	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013525	TCTCC	2	10	2017250	2017259	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.