MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sphaerobacter thermophilus DSM 20745 chromosome 2

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013524	AGGGGG	2	12	81070	81081	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013524	CGCGTG	2	12	83755	83766	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013524	CCCGTC	2	12	109428	109439	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_013524	AGGCGC	2	12	129824	129835	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013524	CTCGAC	2	12	129949	129960	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013524	GCGGAC	2	12	131102	131113	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013524	CGCCGA	2	12	153361	153372	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
8	NC_013524	TGACGT	2	12	174995	175006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013524	GCGAAC	2	12	277962	277973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_013524	GCGCTC	2	12	281346	281357	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11	NC_013524	CATCTG	2	12	306809	306820	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_013524	CCTTCC	2	12	361392	361403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013524	GGCAGG	2	12	364471	364482	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013524	CGGGCG	2	12	371457	371468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013524	CGGGCG	2	12	371613	371624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013524	GAGGGG	2	12	427157	427168	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013524	TTCTCA	2	12	440057	440068	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013524	CGGCCA	2	12	440196	440207	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013524	GCGCCT	2	12	461300	461311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013524	GACCTC	2	12	464312	464323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_013524	TCCCGA	2	12	466841	466852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_013524	CTCCAC	2	12	468389	468400	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013524	GCAGCG	2	12	533778	533789	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013524	TGCTAG	2	12	544665	544676	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013524	CCAGGC	2	12	544870	544881	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
26	NC_013524	GTGCTT	2	12	545114	545125	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013524	TCCCGG	2	12	545283	545294	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
28	NC_013524	GCTCCG	2	12	553380	553391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013524	CGCCGG	2	12	556482	556493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013524	GATCCT	2	12	582853	582864	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013524	TACGAA	2	12	585814	585825	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013524	TCCCAG	2	12	590837	590848	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_013524	CGGACG	2	12	593442	593453	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013524	GGCGCG	2	12	611789	611800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_013524	TGAGCA	2	12	611866	611877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013524	CGCCTG	2	12	612178	612189	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013524	GGCGCG	2	12	612319	612330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013524	TCCCCT	2	12	616196	616207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_013524	TCGGCG	2	12	627506	627517	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013524	ACGCAC	2	12	639153	639164	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013524	GTGGGG	2	12	674123	674134	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013524	CGGACG	2	12	704957	704968	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_013524	TCGCCC	2	12	727768	727779	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013524	CGCGGC	2	12	742497	742508	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_013524	CCCCCA	2	12	746776	746787	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
46	NC_013524	GACCAC	2	12	755686	755697	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013524	CGCGGC	2	12	762865	762876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013524	GGCCCC	2	12	770192	770203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_013524	GGGCCG	2	12	770208	770219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013524	GCGGTC	2	12	773586	773597	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013524	CCGCGC	2	12	789494	789505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013524	GCAGAC	2	12	873957	873968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_013524	ATCGGA	2	12	881713	881724	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_013524	ACACGA	2	12	912267	912278	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013524	ACGGCT	2	12	931363	931374	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_013524	CCGCGC	2	12	950318	950329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_013524	CGCAGC	2	12	985974	985985	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013524	CTCTCC	2	12	1022126	1022137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013524	AGTGGG	2	12	1028267	1028278	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013524	CTGTGG	2	12	1053090	1053101	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_013524	TGGTCC	2	12	1069983	1069994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_013524	CGGGTG	2	12	1077807	1077818	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_013524	GTTCAG	2	12	1133835	1133846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_013524	GTCGGC	2	12	1144133	1144144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_013524	TCCCGC	2	12	1196660	1196671	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_013524	CGGCCC	2	12	1199522	1199533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_013524	ATCCGA	2	12	1200780	1200791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013524	AGGCGG	2	12	1230580	1230591	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013524	CGTCAT	2	12	1239237	1239248	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.