MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 58

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	AGGGGA	2	12	1669	1680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013522	GGCCGG	2	12	21923	21934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013522	GTATAT	2	12	43745	43756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013522	CAAGGG	2	12	65491	65502	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013522	CAACCC	2	12	133516	133527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_013522	GAGGGG	2	12	153651	153662	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013522	TCCGGG	2	12	212990	213001	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013522	GGAAGG	2	12	232571	232582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013522	GGGGCG	2	12	239917	239928	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013522	GGAGGC	2	12	259210	259221	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013522	CGAAGG	2	12	259812	259823	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013522	CCCATC	2	12	268948	268959	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_013522	CAGCAC	2	12	269103	269114	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013522	GGTCCA	2	12	279342	279353	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013522	CCTCCC	2	12	279597	279608	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
16	NC_013522	CTCAAA	2	12	305364	305375	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013522	CCTCCC	2	12	317016	317027	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
18	NC_013522	GGTCAA	2	12	321530	321541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013522	GCCCCT	2	12	327625	327636	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_013522	CTTTGC	2	12	395031	395042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_013522	CTGAAA	2	12	397322	397333	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013522	TATTGA	2	12	417662	417673	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013522	CTATAG	2	12	419024	419035	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013522	ATTATC	2	12	419036	419047	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_013522	CGGAGC	2	12	474953	474964	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013522	ATCTAG	2	12	533728	533739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013522	CATGAC	2	12	606233	606244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013522	ATAGAG	2	12	644292	644303	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013522	CCAGTT	2	12	745468	745479	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013522	TTAATA	2	12	746852	746863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013522	GATCCG	2	12	753742	753753	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_013522	TAATTT	2	12	785498	785509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013522	CCTGGC	2	12	952665	952676	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013522	GATAGA	2	12	952911	952922	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013522	TAAAAA	2	12	1002762	1002773	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013522	TCCAAT	2	12	1004441	1004452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013522	CGAAAT	2	12	1046980	1046991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013522	CTCGGC	2	12	1103202	1103213	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
39	NC_013522	ACAGGA	2	12	1283282	1283293	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013522	TTGAAC	2	12	1440499	1440510	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013522	GTTGAA	2	12	1440618	1440629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013522	CCTGGC	2	12	1538478	1538489	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013522	CCTATA	2	12	1543699	1543710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_013522	CGTTCT	2	12	1546821	1546832	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013522	GGTCAC	2	12	1569992	1570003	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013522	AGAGCC	2	12	1579681	1579692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_013522	CCCCCA	2	12	1579912	1579923	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
48	NC_013522	CTCGGC	2	12	1622561	1622572	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_013522	CCCGCC	2	12	1663899	1663910	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
50	NC_013522	TGGAGG	2	12	1701742	1701753	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013522	TCCGGC	2	12	1709289	1709300	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013522	AAAGTA	2	12	1709440	1709451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013522	CTCGGC	2	12	1726789	1726800	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
54	NC_013522	CGGGGG	2	12	1776791	1776802	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_013522	GAAGGG	2	12	1810435	1810446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013522	AACATC	2	12	1811344	1811355	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013522	ATTTTT	2	12	1812066	1812077	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013522	GTCTTC	2	12	1840077	1840088	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.