MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 1320

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	TGGGG	3	15	550	564	0 %	20 %	80 %	0 %	269791620
2	NC_013522	CGGGG	2	10	2913	2922	0 %	0 %	80 %	20 %	269791622
3	NC_013522	GTGAG	2	10	5791	5800	20 %	20 %	60 %	0 %	269791624
4	NC_013522	GGTCC	2	10	7118	7127	0 %	20 %	40 %	40 %	269791625
5	NC_013522	CGGGG	2	10	8395	8404	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6	NC_013522	CCCCG	2	10	8411	8420	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_013522	GTGGC	2	10	9421	9430	0 %	20 %	60 %	20 %	269791627
8	NC_013522	GTGGC	2	10	11272	11281	0 %	20 %	60 %	20 %	269791628
9	NC_013522	TGGGT	2	10	11804	11813	0 %	40 %	60 %	0 %	269791628
10	NC_013522	AGGGG	2	10	12139	12148	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013522	GGGCT	2	10	17417	17426	0 %	20 %	60 %	20 %	269791634
12	NC_013522	TCGGA	2	10	19266	19275	20 %	20 %	40 %	20 %	269791635
13	NC_013522	GCTGG	2	10	20317	20326	0 %	20 %	60 %	20 %	269791636
14	NC_013522	GGGTT	2	10	20756	20765	0 %	40 %	60 %	0 %	269791637
15	NC_013522	CAAGG	2	10	21036	21045	40 %	0 %	40 %	20 %	269791637
16	NC_013522	AAGAT	2	10	21301	21310	60 %	20 %	20 %	0 %	269791637
17	NC_013522	CAGGG	2	10	23598	23607	20 %	0 %	60 %	20 %	269791638
18	NC_013522	GGCTT	2	10	27344	27353	0 %	40 %	40 %	20 %	269791641
19	NC_013522	TGGTG	2	10	28241	28250	0 %	40 %	60 %	0 %	269791642
20	NC_013522	CGGGA	2	10	29094	29103	20 %	0 %	60 %	20 %	269791642
21	NC_013522	GGGTG	2	10	30566	30575	0 %	20 %	80 %	0 %	269791644
22	NC_013522	TTCGG	2	10	30580	30589	0 %	40 %	40 %	20 %	269791644
23	NC_013522	CCTGA	2	10	30861	30870	20 %	20 %	20 %	40 %	269791644
24	NC_013522	AGTCG	2	10	32099	32108	20 %	20 %	40 %	20 %	269791645
25	NC_013522	CCGGG	2	10	35351	35360	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_013522	GGGCT	2	10	35377	35386	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_013522	ATAAA	2	10	35405	35414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013522	TCCCC	2	10	35626	35635	0 %	20 %	0 %	80 %	269791648
29	NC_013522	CCACC	2	10	35708	35717	20 %	0 %	0 %	80 %	269791648
30	NC_013522	ACCGC	2	10	40015	40024	20 %	0 %	20 %	60 %	269791650
31	NC_013522	CGATC	2	10	40208	40217	20 %	20 %	20 %	40 %	269791650
32	NC_013522	CAGGG	2	10	41182	41191	20 %	0 %	60 %	20 %	269791651
33	NC_013522	GGAGG	2	10	44395	44404	20 %	0 %	80 %	0 %	269791654
34	NC_013522	AACCT	2	10	44543	44552	40 %	20 %	0 %	40 %	269791654
35	NC_013522	CCTGG	2	10	45793	45802	0 %	20 %	40 %	40 %	269791655
36	NC_013522	CCGAA	2	10	47592	47601	40 %	0 %	20 %	40 %	269791657
37	NC_013522	CCTGG	2	10	54330	54339	0 %	20 %	40 %	40 %	269791662
38	NC_013522	GGGAG	2	10	55210	55219	20 %	0 %	80 %	0 %	269791664
39	NC_013522	GTGAC	2	10	55235	55244	20 %	20 %	40 %	20 %	269791664
40	NC_013522	CCAGG	2	10	56076	56085	20 %	0 %	40 %	40 %	269791665
41	NC_013522	GAGTA	2	10	56251	56260	40 %	20 %	40 %	0 %	269791665
42	NC_013522	GCCTC	2	10	56573	56582	0 %	20 %	20 %	60 %	269791665
43	NC_013522	AATCC	2	10	57313	57322	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_013522	CCGGG	2	10	58263	58272	0 %	0 %	60 %	40 %	269791667
45	NC_013522	CGGAT	2	10	59155	59164	20 %	20 %	40 %	20 %	269791667
46	NC_013522	ACCCC	2	10	59191	59200	20 %	0 %	0 %	80 %	269791667
47	NC_013522	CCAGG	2	10	59513	59522	20 %	0 %	40 %	40 %	269791667
48	NC_013522	GCTTC	2	10	61464	61473	0 %	40 %	20 %	40 %	269791669
49	NC_013522	GCCCC	2	10	61763	61772	0 %	0 %	20 %	80 %	269791669
50	NC_013522	AAGCT	2	10	62178	62187	40 %	20 %	20 %	20 %	269791670
51	NC_013522	CTTCC	2	10	63798	63807	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_013522	GTCCT	2	10	64246	64255	0 %	40 %	20 %	40 %	269791672
53	NC_013522	CATGA	2	10	64805	64814	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013522	CCTTC	2	10	65542	65551	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_013522	GCGGA	2	10	66545	66554	20 %	0 %	60 %	20 %	269791675
56	NC_013522	CCCCT	2	10	66830	66839	0 %	20 %	0 %	80 %	269791675
57	NC_013522	GGTCC	2	10	69799	69808	0 %	20 %	40 %	40 %	269791677
58	NC_013522	TGGGA	2	10	70571	70580	20 %	20 %	60 %	0 %	269791677
59	NC_013522	CCTAC	2	10	71593	71602	20 %	20 %	0 %	60 %	269791678
60	NC_013522	TACCG	2	10	71971	71980	20 %	20 %	20 %	40 %	269791679
61	NC_013522	TTCCA	2	10	72052	72061	20 %	40 %	0 %	40 %	269791679
62	NC_013522	GCGGG	2	10	73632	73641	0 %	0 %	80 %	20 %	269791679
63	NC_013522	GGTGC	2	10	74880	74889	0 %	20 %	60 %	20 %	269791680
64	NC_013522	AATAG	2	10	76854	76863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013522	GGCGC	2	10	78617	78626	0 %	0 %	60 %	40 %	269791685
66	NC_013522	ATGGT	2	10	79025	79034	20 %	40 %	40 %	0 %	269791686
67	NC_013522	GATCC	2	10	79432	79441	20 %	20 %	20 %	40 %	269791686
68	NC_013522	AGCCC	2	10	80477	80486	20 %	0 %	20 %	60 %	269791687
69	NC_013522	ATTTT	2	10	81171	81180	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013522	AGCCC	2	10	83060	83069	20 %	0 %	20 %	60 %	269791689
71	NC_013522	AGGCT	2	10	83934	83943	20 %	20 %	40 %	20 %	269791690
72	NC_013522	GGGGC	2	10	86217	86226	0 %	0 %	80 %	20 %	269791692
73	NC_013522	TTGGA	2	10	88397	88406	20 %	40 %	40 %	0 %	269791695
74	NC_013522	GGTGA	2	10	88410	88419	20 %	20 %	60 %	0 %	269791695
75	NC_013522	GCTGG	2	10	88734	88743	0 %	20 %	60 %	20 %	269791696
76	NC_013522	GGAGT	2	10	89056	89065	20 %	20 %	60 %	0 %	269791696
77	NC_013522	GGGAC	2	10	89278	89287	20 %	0 %	60 %	20 %	269791697
78	NC_013522	GAGGT	2	10	89386	89395	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013522	GGCCA	2	10	90498	90507	20 %	0 %	40 %	40 %	269791698
80	NC_013522	GGTGG	2	10	92679	92688	0 %	20 %	80 %	0 %	269791701
81	NC_013522	GGCTG	2	10	92977	92986	0 %	20 %	60 %	20 %	269791701
82	NC_013522	GGTCA	2	10	93110	93119	20 %	20 %	40 %	20 %	269791701
83	NC_013522	CCTTG	2	10	95984	95993	0 %	40 %	20 %	40 %	269791705
84	NC_013522	CCCCG	2	10	100167	100176	0 %	0 %	20 %	80 %	269791709
85	NC_013522	ACCTC	2	10	102872	102881	20 %	20 %	0 %	60 %	269791712
86	NC_013522	ACGGT	2	10	104438	104447	20 %	20 %	40 %	20 %	269791714
87	NC_013522	CACCT	2	10	104449	104458	20 %	20 %	0 %	60 %	269791714
88	NC_013522	TCCGC	2	10	104594	104603	0 %	20 %	20 %	60 %	269791714
89	NC_013522	CGGGG	2	10	107328	107337	0 %	0 %	80 %	20 %	269791716
90	NC_013522	ATGTC	2	10	107632	107641	20 %	40 %	20 %	20 %	269791717
91	NC_013522	ATGGG	2	10	107667	107676	20 %	20 %	60 %	0 %	269791717
92	NC_013522	GAAGC	2	10	110219	110228	40 %	0 %	40 %	20 %	269791718
93	NC_013522	GTCCC	2	10	110978	110987	0 %	20 %	20 %	60 %	269791719
94	NC_013522	GATCC	2	10	114912	114921	20 %	20 %	20 %	40 %	269791723
95	NC_013522	ATCCC	2	10	115054	115063	20 %	20 %	0 %	60 %	269791723
96	NC_013522	CTCCA	2	10	119003	119012	20 %	20 %	0 %	60 %	269791729
97	NC_013522	TCCTC	2	10	119211	119220	0 %	40 %	0 %	60 %	269791729
98	NC_013522	GATCT	2	10	119990	119999	20 %	40 %	20 %	20 %	269791730
99	NC_013522	CAGGG	2	10	121049	121058	20 %	0 %	60 %	20 %	269791730
100	NC_013522	CAGGC	2	10	121368	121377	20 %	0 %	40 %	40 %	269791730
101	NC_013522	TCCGC	2	10	121819	121828	0 %	20 %	20 %	60 %	269791731
102	NC_013522	CGATC	2	10	121922	121931	20 %	20 %	20 %	40 %	269791731
103	NC_013522	GTGGA	2	10	122439	122448	20 %	20 %	60 %	0 %	269791731
104	NC_013522	TGCGG	2	10	122466	122475	0 %	20 %	60 %	20 %	269791731
105	NC_013522	TCACG	2	10	123246	123255	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_013522	AAACA	2	10	124571	124580	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013522	AGGCC	2	10	132974	132983	20 %	0 %	40 %	40 %	269791741
108	NC_013522	TACCG	2	10	133479	133488	20 %	20 %	20 %	40 %	269791742
109	NC_013522	GGTGA	2	10	137547	137556	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013522	CATTC	2	10	139992	140001	20 %	40 %	0 %	40 %	269791748
111	NC_013522	GCCCT	2	10	140802	140811	0 %	20 %	20 %	60 %	269791750
112	NC_013522	CCGGA	2	10	142337	142346	20 %	0 %	40 %	40 %	269791751
113	NC_013522	CCCCG	2	10	145374	145383	0 %	0 %	20 %	80 %	269791755
114	NC_013522	ATGTC	2	10	146348	146357	20 %	40 %	20 %	20 %	269791755
115	NC_013522	GGTAC	2	10	146855	146864	20 %	20 %	40 %	20 %	269791756
116	NC_013522	TCTAG	2	10	148136	148145	20 %	40 %	20 %	20 %	269791756
117	NC_013522	CGGGG	2	10	150653	150662	0 %	0 %	80 %	20 %	269791759
118	NC_013522	GGGGA	2	10	154020	154029	20 %	0 %	80 %	0 %	269791761
119	NC_013522	CCGGG	2	10	155227	155236	0 %	0 %	60 %	40 %	269791763
120	NC_013522	GGGAT	2	10	157038	157047	20 %	20 %	60 %	0 %	269791764
121	NC_013522	AGCGG	2	10	157737	157746	20 %	0 %	60 %	20 %	269791764
122	NC_013522	AGTCC	2	10	161142	161151	20 %	20 %	20 %	40 %	269791768
123	NC_013522	CCCTG	2	10	161172	161181	0 %	20 %	20 %	60 %	269791768
124	NC_013522	TCCGA	2	10	164384	164393	20 %	20 %	20 %	40 %	269791770
125	NC_013522	TAAAA	2	10	166910	166919	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013522	CAGGC	2	10	167510	167519	20 %	0 %	40 %	40 %	269791773
127	NC_013522	CAGGC	2	10	169005	169014	20 %	0 %	40 %	40 %	269791774
128	NC_013522	CCTGG	2	10	169363	169372	0 %	20 %	40 %	40 %	269791775
129	NC_013522	GGCGG	2	10	169855	169864	0 %	0 %	80 %	20 %	269791775
130	NC_013522	CCGGA	2	10	169982	169991	20 %	0 %	40 %	40 %	269791775
131	NC_013522	GGGGA	2	10	170088	170097	20 %	0 %	80 %	0 %	269791775
132	NC_013522	TGACC	2	10	171256	171265	20 %	20 %	20 %	40 %	269791775
133	NC_013522	CTCTC	2	10	173062	173071	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
134	NC_013522	CGTGG	2	10	173875	173884	0 %	20 %	60 %	20 %	269791777
135	NC_013522	CCAGG	2	10	175183	175192	20 %	0 %	40 %	40 %	269791778
136	NC_013522	GGTGG	2	10	176397	176406	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013522	TCCTC	2	10	177029	177038	0 %	40 %	0 %	60 %	269791779
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385	NC_013522	CAATG	2	10	530762	530771	40 %	20 %	20 %	20 %	269792112
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