MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589 chromosome

Total Repeats: 1823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013522	GGA	2	6	85	90	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013522	CGG	2	6	1444	1449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013522	GAG	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013522	TCT	2	6	1537	1542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013522	AGA	2	6	1652	1657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013522	AGA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013522	TAA	2	6	6285	6290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013522	CCA	2	6	6389	6394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_013522	TGA	2	6	6488	6493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013522	GGA	2	6	6548	6553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013522	GGA	2	6	6562	6567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013522	TGG	3	9	6582	6590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013522	CGC	2	6	6632	6637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_013522	TGC	2	6	6719	6724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013522	GGC	2	6	6879	6884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013522	CGT	2	6	8528	8533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013522	TTG	2	6	10337	10342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013522	GGT	2	6	10411	10416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013522	TCA	2	6	10451	10456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_013522	GTA	2	6	10485	10490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013522	CGG	2	6	16052	16057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_013522	CCG	2	6	16075	16080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_013522	TGG	2	6	21499	21504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013522	AGG	2	6	21508	21513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013522	GGT	2	6	21583	21588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013522	GAC	2	6	21749	21754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013522	TTG	2	6	21780	21785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013522	CCG	2	6	21859	21864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_013522	GTG	2	6	21986	21991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013522	GGA	2	6	22087	22092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013522	GAT	2	6	22130	22135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013522	CTT	2	6	22243	22248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013522	CGG	2	6	22346	22351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_013522	ATG	2	6	22373	22378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013522	GCG	2	6	22710	22715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_013522	CCT	2	6	22784	22789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_013522	GGC	2	6	24875	24880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013522	TGA	2	6	25012	25017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013522	TCG	2	6	29150	29155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013522	GCG	2	6	29169	29174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_013522	GCC	2	6	29189	29194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_013522	TAT	2	6	30913	30918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013522	TGA	2	6	30940	30945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013522	CCT	2	6	32109	32114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_013522	CTT	2	6	32151	32156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_013522	ATG	3	9	33721	33729	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013522	TGG	2	6	33746	33751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013522	TAT	2	6	33906	33911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013522	CGC	2	6	33950	33955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013522	CGC	2	6	34027	34032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013522	GGA	2	6	34060	34065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013522	GGA	2	6	34095	34100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013522	TTG	2	6	35495	35500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013522	AAG	2	6	35590	35595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013522	GGT	2	6	40001	40006	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013522	CTT	2	6	43669	43674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013522	TAG	2	6	43728	43733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013522	CCG	2	6	43781	43786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_013522	GGT	2	6	43826	43831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013522	ACT	2	6	43862	43867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013522	GAA	2	6	43995	44000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013522	CCT	2	6	45261	45266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_013522	TCG	2	6	63851	63856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013522	TGT	2	6	65470	65475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013522	CGG	2	6	65619	65624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_013522	TCG	2	6	65627	65632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013522	TTG	2	6	67465	67470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013522	CGG	2	6	67524	67529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013522	CCG	2	6	67533	67538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_013522	TCC	2	6	76825	76830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_013522	CCT	2	6	80278	80283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_013522	GTA	2	6	81196	81201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013522	GCC	2	6	81377	81382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_013522	GCG	2	6	81435	81440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_013522	GAT	2	6	81444	81449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013522	CGG	2	6	81471	81476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013522	CGG	2	6	81551	81556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_013522	AGG	2	6	82979	82984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013522	GCG	2	6	86573	86578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013522	CGA	2	6	86604	86609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013522	GCG	2	6	86923	86928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013522	CAT	2	6	96031	96036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013522	GGT	2	6	96084	96089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013522	CCT	2	6	96906	96911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_013522	TAT	2	6	96973	96978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013522	TCC	2	6	102900	102905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_013522	ATC	2	6	103730	103735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_013522	CTC	2	6	103736	103741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_013522	AAC	2	6	103819	103824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_013522	TCC	2	6	111500	111505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_013522	ACC	2	6	111545	111550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_013522	CCA	2	6	111618	111623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_013522	GTG	2	6	111631	111636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013522	CCA	3	9	111655	111663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013522	GGA	2	6	111718	111723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013522	GGA	2	6	111739	111744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013522	GCA	2	6	112442	112447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_013522	GGT	2	6	112478	112483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013522	CGT	2	6	114196	114201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013522	GGT	2	6	114708	114713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013522	CCG	2	6	115265	115270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_013522	CGG	2	6	115282	115287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_013522	CAC	2	6	115470	115475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_013522	CTC	2	6	115476	115481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_013522	TCT	2	6	115486	115491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_013522	GGT	2	6	115548	115553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013522	GTC	2	6	116296	116301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013522	AGA	2	6	116575	116580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013522	GAA	2	6	119757	119762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013522	TCA	2	6	123208	123213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_013522	TTC	2	6	124524	124529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013522	CGG	2	6	124554	124559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013522	GGC	2	6	124582	124587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013522	GCC	2	6	124601	124606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013522	GGT	2	6	124650	124655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013522	CCT	2	6	124772	124777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_013522	CGG	2	6	124803	124808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_013522	CGG	2	6	124921	124926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013522	ATA	2	6	125010	125015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013522	GAG	2	6	125898	125903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013522	GGC	2	6	126444	126449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013522	GCC	2	6	126455	126460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_013522	GAA	2	6	126495	126500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013522	CGG	2	6	127875	127880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013522	GCG	2	6	127944	127949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013522	TGC	2	6	127957	127962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013522	AGG	2	6	129234	129239	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013522	TCC	2	6	133595	133600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013522	GGC	2	6	133601	133606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_013522	CCT	2	6	135889	135894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_013522	GCG	2	6	137497	137502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013522	GCC	2	6	137504	137509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_013522	TAA	2	6	137510	137515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013522	CCG	2	6	138075	138080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_013522	AGG	2	6	146413	146418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013522	CTT	2	6	148158	148163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013522	TTC	2	6	153598	153603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013522	CGC	2	6	155098	155103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_013522	AGT	2	6	157925	157930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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141	NC_013522	GGA	2	6	160739	160744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013522	CGC	2	6	164583	164588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
143	NC_013522	TGG	2	6	164621	164626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_013522	AGG	2	6	176422	176427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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411	NC_013522	CGG	2	6	409733	409738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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452	NC_013522	CCG	2	6	417573	417578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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