MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Veillonella parvula DSM 2008 chromosome

Total Repeats: 113

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013520	TTGAGA	2	12	26265	26276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013520	CCAGCG	2	12	43166	43177	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013520	TAGGAT	2	12	44304	44315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013520	TTAAAA	2	12	49413	49424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013520	CTCTAT	2	12	58132	58143	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_013520	ATCATA	2	12	58511	58522	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013520	TATACT	2	12	106750	106761	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013520	CTTTTT	2	12	109316	109327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013520	TAGGTA	2	12	136823	136834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013520	ATAATG	2	12	145583	145594	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013520	AATATA	2	12	145643	145654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013520	AATTTT	2	12	202036	202047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013520	TAATCA	2	12	206942	206953	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_013520	AATTAA	2	12	210086	210097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013520	GTACGG	2	12	212944	212955	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_013520	AATATA	2	12	218010	218021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013520	TATGTA	2	12	222458	222469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013520	TTTTTG	2	12	234917	234928	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013520	ATAAAA	2	12	235009	235020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013520	TTTTGC	2	12	249855	249866	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013520	GTATTG	2	12	269778	269789	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013520	TATTTT	2	12	278829	278840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013520	ATGATA	2	12	305496	305507	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013520	TTATTT	2	12	305549	305560	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013520	ACTATA	2	12	319867	319878	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013520	GCAACT	2	12	319898	319909	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013520	TGATTT	2	12	341648	341659	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013520	TTAGTA	2	12	366111	366122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013520	AAATAT	2	12	385980	385991	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013520	AATCTA	2	12	386136	386147	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013520	TAGTTT	2	12	392250	392261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013520	ATATGT	2	12	392481	392492	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013520	TATAAA	2	12	406307	406318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013520	TTTATA	2	12	407800	407811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013520	ATTTAT	2	12	498851	498862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013520	ATTAAT	2	12	561308	561319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013520	AATACT	2	12	569787	569798	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013520	ATATTT	2	12	570233	570244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013520	TATACT	2	12	582401	582412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013520	TTATAT	2	12	593796	593807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013520	AAGGGA	2	12	637630	637641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013520	GAATGT	2	12	676354	676365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013520	GTTTAT	2	12	695751	695762	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013520	ATATTA	2	12	700597	700608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013520	TATACT	2	12	725885	725896	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013520	TTATAT	2	12	733200	733211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013520	ATTTTT	2	12	830833	830844	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013520	GACGAA	2	12	857853	857864	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013520	CTATTA	2	12	859952	859963	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013520	TAAAAA	2	12	863123	863134	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013520	ATTTTT	2	12	885319	885330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013520	TTTAAT	2	12	885369	885380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013520	ATTTAT	2	12	912908	912919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013520	AAATAT	2	12	937035	937046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013520	TGTCAT	2	12	958424	958435	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_013520	CTATAC	2	12	1034513	1034524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013520	TCTTTT	2	12	1035513	1035524	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013520	ATTCAA	2	12	1038841	1038852	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013520	ATTTAA	2	12	1091811	1091822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013520	TATATT	2	12	1122694	1122705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013520	AAATTT	2	12	1123865	1123876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013520	TTTATA	2	12	1139346	1139357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013520	ATTATA	2	12	1139503	1139514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013520	AAAATG	2	12	1189013	1189024	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013520	TATTAA	2	12	1194927	1194938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013520	ACTATA	2	12	1221887	1221898	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013520	AATTGC	3	18	1292973	1292990	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013520	GTAAAA	2	12	1296227	1296238	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013520	TATATT	2	12	1299350	1299361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013520	TAGTTA	2	12	1299784	1299795	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013520	TTTACT	2	12	1323071	1323082	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013520	AAAATA	2	12	1349043	1349054	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013520	ACACTA	2	12	1411386	1411397	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013520	AAATGA	2	12	1415174	1415185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013520	TATATG	2	12	1421273	1421284	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013520	AGATAT	2	12	1426770	1426781	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013520	AGATAA	2	12	1458134	1458145	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013520	AGTAAA	2	12	1483066	1483077	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013520	TATTTA	2	12	1504789	1504800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013520	TATAAA	2	12	1538576	1538587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013520	TCTAAA	2	12	1558894	1558905	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_013520	AGTATA	2	12	1570642	1570653	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013520	CATGTT	2	12	1627210	1627221	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013520	AATATA	2	12	1639311	1639322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013520	TTTCAT	2	12	1714359	1714370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_013520	TCGAAG	2	12	1725673	1725684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_013520	ATTTTT	2	12	1761779	1761790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013520	TATAAA	2	12	1770831	1770842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013520	TTTTAT	2	12	1771978	1771989	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013520	TATCAA	2	12	1788057	1788068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_013520	ATATCT	2	12	1802145	1802156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_013520	TATATT	2	12	1814479	1814490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013520	GTATAA	2	12	1814508	1814519	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013520	AATCAA	2	12	1827076	1827087	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013520	TAAAAC	2	12	1846919	1846930	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_013520	TTTATA	2	12	1857005	1857016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013520	ATTACA	2	12	1884766	1884777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013520	GCATCA	5	30	1910653	1910682	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013520	ATATTA	2	12	1944879	1944890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013520	ATCAAA	2	12	1956745	1956756	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013520	CTATTA	3	18	1956852	1956869	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013520	AAATAT	2	12	1968968	1968979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013520	GTAAAA	2	12	1972684	1972695	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013520	CTGTTT	6	36	1979905	1979940	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013520	TAATAT	2	12	2032856	2032867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013520	TTCAAT	2	12	2062008	2062019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013520	TAAAAT	2	12	2079249	2079260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013520	TGCGGC	2	12	2080612	2080623	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013520	TTATGT	2	12	2081145	2081156	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013520	GCGGCC	2	12	2082727	2082738	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013520	CTTTTG	4	24	2117486	2117509	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_013520	CTATAT	2	12	2120052	2120063	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013520	ATTTTA	2	12	2121050	2121061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.