MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Veillonella parvula DSM 2008 chromosome

Total Repeats: 1505

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013520	CGTCA	2	10	340	349	20 %	20 %	20 %	40 %	269797070
2	NC_013520	TTACA	2	10	2554	2563	40 %	40 %	0 %	20 %	269797071
3	NC_013520	CACAG	2	10	3225	3234	40 %	0 %	20 %	40 %	269797071
4	NC_013520	ATCAA	2	10	7762	7771	60 %	20 %	0 %	20 %	269797076
5	NC_013520	ACTGA	2	10	8746	8755	40 %	20 %	20 %	20 %	269797077
6	NC_013520	GTATT	2	10	9651	9660	20 %	60 %	20 %	0 %	269797078
7	NC_013520	TATCT	2	10	9975	9984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013520	TGTCT	2	10	9985	9994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013520	AATAG	2	10	10517	10526	60 %	20 %	20 %	0 %	269797079
10	NC_013520	TGGTT	2	10	10795	10804	0 %	60 %	40 %	0 %	269797079
11	NC_013520	GAAGA	2	10	18128	18137	60 %	0 %	40 %	0 %	269797083
12	NC_013520	ATGGA	2	10	20904	20913	40 %	20 %	40 %	0 %	269797085
13	NC_013520	TTGTT	2	10	21358	21367	0 %	80 %	20 %	0 %	269797085
14	NC_013520	TTACT	2	10	23456	23465	20 %	60 %	0 %	20 %	269797087
15	NC_013520	AATAT	2	10	23896	23905	60 %	40 %	0 %	0 %	269797088
16	NC_013520	TTATT	2	10	25379	25388	20 %	80 %	0 %	0 %	269797089
17	NC_013520	TGGTT	2	10	25895	25904	0 %	60 %	40 %	0 %	269797089
18	NC_013520	CTAGT	2	10	30604	30613	20 %	40 %	20 %	20 %	269797094
19	NC_013520	TATTT	2	10	30637	30646	20 %	80 %	0 %	0 %	269797094
20	NC_013520	AAGGT	2	10	31769	31778	40 %	20 %	40 %	0 %	269797095
21	NC_013520	ATATT	2	10	32031	32040	40 %	60 %	0 %	0 %	269797095
22	NC_013520	GATAT	2	10	34108	34117	40 %	40 %	20 %	0 %	269797097
23	NC_013520	ACAGG	2	10	35612	35621	40 %	0 %	40 %	20 %	269797099
24	NC_013520	ATAGT	2	10	35670	35679	40 %	40 %	20 %	0 %	269797099
25	NC_013520	TATTC	2	10	36388	36397	20 %	60 %	0 %	20 %	269797100
26	NC_013520	TGTTT	2	10	37351	37360	0 %	80 %	20 %	0 %	269797100
27	NC_013520	TTGGT	2	10	40182	40191	0 %	60 %	40 %	0 %	269797103
28	NC_013520	TATTC	2	10	40382	40391	20 %	60 %	0 %	20 %	269797103
29	NC_013520	CTTTT	2	10	41381	41390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013520	TTATA	2	10	41509	41518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013520	TAATG	2	10	41806	41815	40 %	40 %	20 %	0 %	269797105
32	NC_013520	CAGTA	2	10	43879	43888	40 %	20 %	20 %	20 %	269797106
33	NC_013520	TAGAT	2	10	44657	44666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013520	ATTGT	2	10	45295	45304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013520	TTGGT	2	10	46428	46437	0 %	60 %	40 %	0 %	269797109
36	NC_013520	TTATC	2	10	49281	49290	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013520	TCGTA	2	10	49558	49567	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013520	GGTAA	2	10	49783	49792	40 %	20 %	40 %	0 %	269797111
39	NC_013520	TCGTA	2	10	53478	53487	20 %	40 %	20 %	20 %	269797111
40	NC_013520	GGCAT	2	10	54706	54715	20 %	20 %	40 %	20 %	269797111
41	NC_013520	AAACT	2	10	54791	54800	60 %	20 %	0 %	20 %	269797111
42	NC_013520	ACGTA	2	10	57661	57670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_013520	GTAAT	2	10	63527	63536	40 %	40 %	20 %	0 %	269797115
44	NC_013520	ACAAA	2	10	63997	64006	80 %	0 %	0 %	20 %	269797115
45	NC_013520	TAGTC	2	10	65745	65754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013520	GTAGC	2	10	67504	67513	20 %	20 %	40 %	20 %	269797117
47	NC_013520	AGGCA	2	10	68444	68453	40 %	0 %	40 %	20 %	269797117
48	NC_013520	TTAAA	2	10	69901	69910	60 %	40 %	0 %	0 %	269797117
49	NC_013520	TCCGA	2	10	71094	71103	20 %	20 %	20 %	40 %	269797117
50	NC_013520	GTATT	2	10	73105	73114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013520	AAAAT	2	10	73981	73990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013520	ACAAA	2	10	78548	78557	80 %	0 %	0 %	20 %	269797120
53	NC_013520	TGTAA	2	10	80314	80323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013520	ATATG	2	10	80521	80530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013520	TAATA	2	10	80533	80542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013520	TTAAA	2	10	84860	84869	60 %	40 %	0 %	0 %	269797121
57	NC_013520	GTGTC	2	10	85211	85220	0 %	40 %	40 %	20 %	269797121
58	NC_013520	GAAAT	2	10	89057	89066	60 %	20 %	20 %	0 %	269797121
59	NC_013520	GGCAT	2	10	89128	89137	20 %	20 %	40 %	20 %	269797121
60	NC_013520	AGCAA	2	10	93461	93470	60 %	0 %	20 %	20 %	269797122
61	NC_013520	AAGTT	2	10	94476	94485	40 %	40 %	20 %	0 %	269797122
62	NC_013520	GGTAA	2	10	100226	100235	40 %	20 %	40 %	0 %	269797122
63	NC_013520	ATGCA	2	10	102111	102120	40 %	20 %	20 %	20 %	269797122
64	NC_013520	ATGCT	2	10	102900	102909	20 %	40 %	20 %	20 %	269797123
65	NC_013520	GTTTG	2	10	102977	102986	0 %	60 %	40 %	0 %	269797123
66	NC_013520	ACAAA	2	10	102989	102998	80 %	0 %	0 %	20 %	269797123
67	NC_013520	GATGG	2	10	104276	104285	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013520	TCGTG	2	10	104717	104726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_013520	CATAG	2	10	105945	105954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_013520	AAACA	2	10	108727	108736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_013520	GAAAA	2	10	109286	109295	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013520	TATTT	2	10	113083	113092	20 %	80 %	0 %	0 %	269797127
73	NC_013520	AAGAA	2	10	114180	114189	80 %	0 %	20 %	0 %	269797129
74	NC_013520	AAAAC	2	10	116299	116308	80 %	0 %	0 %	20 %	269797130
75	NC_013520	ATCGT	2	10	117594	117603	20 %	40 %	20 %	20 %	269797131
76	NC_013520	GCAAG	2	10	118006	118015	40 %	0 %	40 %	20 %	269797131
77	NC_013520	GTACA	2	10	118473	118482	40 %	20 %	20 %	20 %	269797132
78	NC_013520	TATTT	2	10	118735	118744	20 %	80 %	0 %	0 %	269797132
79	NC_013520	AGATA	2	10	120945	120954	60 %	20 %	20 %	0 %	269797134
80	NC_013520	CAAAA	2	10	121832	121841	80 %	0 %	0 %	20 %	269797134
81	NC_013520	ATCAA	2	10	123490	123499	60 %	20 %	0 %	20 %	269797135
82	NC_013520	ATGAA	2	10	127274	127283	60 %	20 %	20 %	0 %	269797139
83	NC_013520	CCAGC	2	10	127771	127780	20 %	0 %	20 %	60 %	269797139
84	NC_013520	ATTGT	2	10	130051	130060	20 %	60 %	20 %	0 %	269797140
85	NC_013520	AGCTC	2	10	132526	132535	20 %	20 %	20 %	40 %	269797141
86	NC_013520	CCGAG	2	10	134020	134029	20 %	0 %	40 %	40 %	269797142
87	NC_013520	GTATT	2	10	135080	135089	20 %	60 %	20 %	0 %	269797143
88	NC_013520	AAACT	2	10	135267	135276	60 %	20 %	0 %	20 %	269797143
89	NC_013520	ATGTA	2	10	135510	135519	40 %	40 %	20 %	0 %	269797143
90	NC_013520	GCAAA	2	10	136290	136299	60 %	0 %	20 %	20 %	269797143
91	NC_013520	AAATT	2	10	137098	137107	60 %	40 %	0 %	0 %	269797144
92	NC_013520	TTATG	2	10	137856	137865	20 %	60 %	20 %	0 %	269797144
93	NC_013520	AATAT	2	10	138917	138926	60 %	40 %	0 %	0 %	269797145
94	NC_013520	AATGA	2	10	139619	139628	60 %	20 %	20 %	0 %	269797146
95	NC_013520	TGTAT	2	10	145683	145692	20 %	60 %	20 %	0 %	269797153
96	NC_013520	TATTT	2	10	145728	145737	20 %	80 %	0 %	0 %	269797153
97	NC_013520	TGCCT	2	10	145974	145983	0 %	40 %	20 %	40 %	269797153
98	NC_013520	TTGGT	2	10	147625	147634	0 %	60 %	40 %	0 %	269797155
99	NC_013520	TGCTA	2	10	149943	149952	20 %	40 %	20 %	20 %	269797157
100	NC_013520	TCCAT	2	10	149996	150005	20 %	40 %	0 %	40 %	269797157
101	NC_013520	GATTT	2	10	150699	150708	20 %	60 %	20 %	0 %	269797158
102	NC_013520	TATAT	2	10	151089	151098	40 %	60 %	0 %	0 %	269797158
103	NC_013520	TATAG	2	10	153521	153530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013520	ATTTT	2	10	154038	154047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013520	AAGGT	2	10	154840	154849	40 %	20 %	40 %	0 %	269797163
106	NC_013520	GAAAC	2	10	157748	157757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_013520	GTTTC	2	10	157803	157812	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_013520	CTGGT	2	10	161215	161224	0 %	40 %	40 %	20 %	269797168
109	NC_013520	TTAAT	2	10	161829	161838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013520	ATTGT	2	10	162006	162015	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013520	ATTGT	2	10	163942	163951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013520	CACTG	2	10	169050	169059	20 %	20 %	20 %	40 %	269797175
113	NC_013520	AATGT	2	10	169710	169719	40 %	40 %	20 %	0 %	269797176
114	NC_013520	TTGTT	2	10	170897	170906	0 %	80 %	20 %	0 %	269797177
115	NC_013520	TAATG	2	10	171841	171850	40 %	40 %	20 %	0 %	269797178
116	NC_013520	TACGT	2	10	172922	172931	20 %	40 %	20 %	20 %	269797180
117	NC_013520	TAATG	2	10	173240	173249	40 %	40 %	20 %	0 %	269797180
118	NC_013520	TAATT	2	10	173440	173449	40 %	60 %	0 %	0 %	269797181
119	NC_013520	CATTT	2	10	173459	173468	20 %	60 %	0 %	20 %	269797181
120	NC_013520	TCTTT	2	10	173503	173512	0 %	80 %	0 %	20 %	269797181
121	NC_013520	AGGAT	2	10	173518	173527	40 %	20 %	40 %	0 %	269797181
122	NC_013520	ACAAG	2	10	175478	175487	60 %	0 %	20 %	20 %	269797183
123	NC_013520	CAAGG	2	10	178118	178127	40 %	0 %	40 %	20 %	269797185
124	NC_013520	GCTTT	2	10	179573	179582	0 %	60 %	20 %	20 %	269797186
125	NC_013520	ATTAT	2	10	181504	181513	40 %	60 %	0 %	0 %	269797187
126	NC_013520	CAACA	2	10	181836	181845	60 %	0 %	0 %	40 %	269797187
127	NC_013520	ATAAA	2	10	183464	183473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013520	TAGTA	2	10	187473	187482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013520	ATTTA	2	10	188767	188776	40 %	60 %	0 %	0 %	269797193
130	NC_013520	AGCTG	2	10	195121	195130	20 %	20 %	40 %	20 %	269797200
131	NC_013520	ATTTT	2	10	196219	196228	20 %	80 %	0 %	0 %	269797201
132	NC_013520	TTTTA	2	10	196418	196427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013520	AGGTA	2	10	196769	196778	40 %	20 %	40 %	0 %	269797202
134	NC_013520	GATAC	2	10	197303	197312	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013520	TGCAT	2	10	197836	197845	20 %	40 %	20 %	20 %	269797203
136	NC_013520	TGCAT	2	10	198430	198439	20 %	40 %	20 %	20 %	269797203
137	NC_013520	TCTGG	2	10	200622	200631	0 %	40 %	40 %	20 %	269797204
138	NC_013520	TTTCT	2	10	201318	201327	0 %	80 %	0 %	20 %	269797205
139	NC_013520	ATATT	2	10	202023	202032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013520	AAGAA	2	10	202119	202128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013520	AAATT	2	10	202725	202734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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