MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Veillonella parvula DSM 2008 chromosome

Total Repeats: 361

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013520	TATCT	2	10	9975	9984	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013520	TGTCT	2	10	9985	9994	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013520	CTTTT	2	10	41381	41390	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013520	TTATA	2	10	41509	41518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013520	TAGAT	2	10	44657	44666	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013520	ATTGT	2	10	45295	45304	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013520	TTATC	2	10	49281	49290	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_013520	TCGTA	2	10	49558	49567	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013520	ACGTA	2	10	57661	57670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013520	TAGTC	2	10	65745	65754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_013520	GTATT	2	10	73105	73114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013520	AAAAT	2	10	73981	73990	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013520	TGTAA	2	10	80314	80323	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013520	ATATG	2	10	80521	80530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013520	TAATA	2	10	80533	80542	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013520	GATGG	2	10	104276	104285	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013520	TCGTG	2	10	104717	104726	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013520	CATAG	2	10	105945	105954	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013520	AAACA	2	10	108727	108736	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_013520	GAAAA	2	10	109286	109295	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013520	TATAG	2	10	153521	153530	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013520	ATTTT	2	10	154038	154047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013520	GAAAC	2	10	157748	157757	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013520	GTTTC	2	10	157803	157812	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013520	TTAAT	2	10	161829	161838	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013520	ATTGT	2	10	162006	162015	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013520	ATTGT	2	10	163942	163951	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013520	ATAAA	2	10	183464	183473	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013520	TAGTA	2	10	187473	187482	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013520	TTTTA	2	10	196418	196427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013520	GATAC	2	10	197303	197312	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013520	ATATT	2	10	202023	202032	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013520	AAGAA	2	10	202119	202128	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013520	AAATT	2	10	202725	202734	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013520	AATGA	2	10	204826	204835	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013520	TGGAT	3	15	206825	206839	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013520	TAAAT	2	10	206964	206973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013520	TATGA	2	10	207522	207531	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013520	AATTA	2	10	212697	212706	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013520	TAATA	2	10	215444	215453	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013520	ATAGC	2	10	222343	222352	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_013520	ATAAA	2	10	223787	223796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013520	TGCAT	2	10	224904	224913	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013520	TTAAT	2	10	227393	227402	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013520	AAAGT	2	10	235063	235072	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013520	TAAAG	2	10	235083	235092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013520	TTTAA	2	10	235108	235117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013520	GTGTT	2	10	235222	235231	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013520	TTAAT	2	10	235541	235550	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013520	TAATA	2	10	235838	235847	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013520	ACTTC	2	10	243668	243677	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
52	NC_013520	AATGA	2	10	252996	253005	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013520	ATTAC	2	10	276883	276892	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013520	TTGTT	2	10	283489	283498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013520	CTTAT	2	10	286282	286291	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013520	AGTTT	2	10	286319	286328	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013520	TAGTA	2	10	294379	294388	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013520	TACTG	2	10	295399	295408	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_013520	TTATT	2	10	305564	305573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013520	CTATT	2	10	311010	311019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_013520	TTATT	2	10	325718	325727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013520	ACACA	2	10	327356	327365	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_013520	TGGAT	2	10	327429	327438	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013520	TTTTA	2	10	328798	328807	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013520	AATTC	2	10	330752	330761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013520	TTTCT	2	10	336442	336451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_013520	ATTTA	2	10	337535	337544	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013520	GCCTT	2	10	338297	338306	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_013520	TAAGA	2	10	338666	338675	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013520	AATAA	2	10	341703	341712	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013520	TATTG	2	10	342264	342273	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013520	ATATT	2	10	342344	342353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013520	ATATA	2	10	344160	344169	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013520	TGATA	2	10	344174	344183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013520	AACTT	2	10	345199	345208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013520	ATTTT	2	10	348777	348786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013520	TACTA	2	10	348911	348920	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_013520	TTAAT	2	10	361280	361289	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013520	AATTT	2	10	361312	361321	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013520	TAAAA	2	10	366013	366022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_013520	ATAAC	2	10	379174	379183	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013520	ATTTT	2	10	382213	382222	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013520	ATATG	2	10	393510	393519	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013520	CCATT	2	10	396635	396644	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_013520	GAATA	2	10	399599	399608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013520	GAATA	2	10	400426	400435	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013520	TATAA	2	10	406338	406347	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013520	AGGAA	2	10	406530	406539	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013520	TAAAT	2	10	410807	410816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013520	GTATG	2	10	426427	426436	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013520	TAAAA	2	10	437954	437963	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013520	TGAAT	2	10	441458	441467	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013520	TCAAT	2	10	441604	441613	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_013520	GTATA	2	10	443890	443899	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013520	AAAAG	2	10	444045	444054	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013520	TATAT	2	10	450477	450486	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013520	TTATA	2	10	450559	450568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013520	TATTT	2	10	460199	460208	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013520	TATTT	2	10	483731	483740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013520	TATAA	2	10	495856	495865	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013520	TGTAT	2	10	496851	496860	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013520	TATAC	2	10	496884	496893	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_013520	AGGTG	2	10	497010	497019	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013520	TCGAG	2	10	503267	503276	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013520	AAAGT	2	10	506446	506455	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013520	GAAAA	2	10	506519	506528	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013520	ATATA	2	10	518381	518390	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013520	AAGGG	2	10	526083	526092	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013520	ATTAT	2	10	532886	532895	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013520	TAATT	2	10	560932	560941	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013520	ATGTA	2	10	561002	561011	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013520	TTTAA	2	10	569729	569738	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013520	GATGG	2	10	579735	579744	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013520	TCGTG	2	10	580176	580185	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013520	CCAAG	2	10	580665	580674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_013520	CATAG	2	10	581596	581605	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013520	ATATA	2	10	614696	614705	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013520	AAATT	2	10	672497	672506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013520	GCTAC	2	10	672635	672644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_013520	TAATC	2	10	674388	674397	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_013520	ATTTT	2	10	676379	676388	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013520	TGTAT	2	10	693691	693700	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013520	TATTT	2	10	695984	695993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013520	TAAGA	2	10	696094	696103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013520	GGTTA	2	10	699188	699197	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013520	GTTTT	2	10	704042	704051	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013520	AGAAA	2	10	717819	717828	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013520	GATGG	2	10	723411	723420	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013520	TCGTG	2	10	723852	723861	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013520	CATAG	2	10	725080	725089	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_013520	GAAAA	2	10	728202	728211	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013520	CTTTT	2	10	728231	728240	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_013520	AGTTG	2	10	728542	728551	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013520	TGTAT	2	10	729178	729187	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013520	ACATA	2	10	752169	752178	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_013520	TTTTA	2	10	753565	753574	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013520	TAAAA	2	10	759682	759691	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013520	TTTAG	2	10	764310	764319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013520	TTGAT	2	10	766081	766090	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013520	ATAAA	2	10	773969	773978	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013520	GTATA	2	10	774207	774216	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_013520	ATTAA	2	10	780736	780745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013520	GAAAA	2	10	822350	822359	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_013520	ATATA	2	10	827604	827613	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013520	ATTTT	2	10	829268	829277	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_013520	TCTCT	2	10	829387	829396	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
147	NC_013520	TAAAA	2	10	829498	829507	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013520	CATGT	2	10	829939	829948	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_013520	AAGGA	2	10	851123	851132	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013520	TACCA	2	10	854520	854529	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
151	NC_013520	TTAAT	2	10	854539	854548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_013520	AAAAG	2	10	859729	859738	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_013520	AATAT	2	10	935518	935527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_013520	ATTAG	2	10	975160	975169	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013520	CCTTA	2	10	1000358	1000367	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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166	NC_013520	TAAAA	2	10	1037461	1037470	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_013520	AAATA	2	10	1037912	1037921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_013520	ATAAA	2	10	1120888	1120897	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_013520	TAAAA	2	10	1176608	1176617	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_013520	CTCAT	2	10	1176625	1176634	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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191	NC_013520	TAAAA	2	10	1258218	1258227	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_013520	TTGTA	2	10	1258242	1258251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_013520	CTATT	2	10	1285798	1285807	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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227	NC_013520	CATGA	2	10	1469881	1469890	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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321	NC_013520	TAGCA	2	10	1980695	1980704	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
322	NC_013520	TAAAA	2	10	1983737	1983746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_013520	TATAA	2	10	1984726	1984735	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_013520	CTATA	2	10	1985649	1985658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.