MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM02

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013519	ATA	2	6	59	64	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013519	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796559
3	NC_013519	AGA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796559
4	NC_013519	TAA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013519	AAT	2	6	495	500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013519	ATA	2	6	544	549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013519	GGA	2	6	587	592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013519	AAT	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013519	AGG	2	6	690	695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013519	TAA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
11	NC_013519	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796560
12	NC_013519	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796560
13	NC_013519	AAT	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
14	NC_013519	GAA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
15	NC_013519	GAA	2	6	983	988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
16	NC_013519	TGA	2	6	1138	1143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013519	AAG	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796561
18	NC_013519	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796561
19	NC_013519	AAT	2	6	1582	1587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796561
20	NC_013519	AAG	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796562
21	NC_013519	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796562
22	NC_013519	TAA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796562
23	NC_013519	TAC	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_013519	ATA	2	6	2240	2245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013519	TTG	2	6	2310	2315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013519	TGT	2	6	2398	2403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013519	TTA	2	6	2427	2432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013519	CTA	2	6	2469	2474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013519	AAT	3	9	2869	2877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013519	TAT	2	6	2894	2899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013519	ATA	2	6	2965	2970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013519	AGA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796563
33	NC_013519	TAT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796563
34	NC_013519	ATC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796563
35	NC_013519	TAA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
36	NC_013519	AAT	2	6	3609	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
37	NC_013519	AAC	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796563
38	NC_013519	AGG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796563
39	NC_013519	GAT	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
40	NC_013519	TAT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796564
41	NC_013519	GAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
42	NC_013519	TGA	2	6	4160	4165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
43	NC_013519	AGA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
44	NC_013519	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
45	NC_013519	AAG	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
46	NC_013519	CCT	2	6	4324	4329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013519	GTC	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_013519	TAT	2	6	4791	4796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013519	AGA	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
50	NC_013519	TGA	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
51	NC_013519	TGG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268796565
52	NC_013519	GAA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
53	NC_013519	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796565
54	NC_013519	ATT	2	6	5263	5268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
55	NC_013519	GTC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268796565
56	NC_013519	ATG	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
57	NC_013519	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
58	NC_013519	AGA	3	9	5492	5500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
59	NC_013519	ATT	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
60	NC_013519	AGG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796565
61	NC_013519	GAA	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
62	NC_013519	AGA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
63	NC_013519	TGA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796566
64	NC_013519	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
65	NC_013519	GAA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
66	NC_013519	CAA	2	6	5829	5834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
67	NC_013519	TAA	2	6	6044	6049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
68	NC_013519	TAA	2	6	6155	6160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
69	NC_013519	CAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
70	NC_013519	TAA	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
71	NC_013519	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
72	NC_013519	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796566
73	NC_013519	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
74	NC_013519	AAT	2	6	6669	6674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013519	AGT	2	6	6713	6718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013519	AAT	2	6	6823	6828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013519	AAT	2	6	6844	6849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013519	AAT	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013519	TAA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
80	NC_013519	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796567
81	NC_013519	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
82	NC_013519	TGA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
83	NC_013519	GAA	3	9	7390	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
84	NC_013519	ATG	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
85	NC_013519	GAT	2	6	7669	7674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
86	NC_013519	ATG	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
87	NC_013519	GAC	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268796567
88	NC_013519	GAT	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
89	NC_013519	GGA	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796567
90	NC_013519	AAC	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796567
91	NC_013519	TGA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
92	NC_013519	ATG	2	6	8333	8338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
93	NC_013519	GAA	2	6	8363	8368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
94	NC_013519	AAT	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
95	NC_013519	AAT	2	6	8553	8558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
96	NC_013519	ATT	2	6	8651	8656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796567
97	NC_013519	ATA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
98	NC_013519	AAT	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
99	NC_013519	TGT	2	6	8763	8768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796567
100	NC_013519	TAA	2	6	9127	9132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013519	ATT	2	6	9170	9175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796568
102	NC_013519	TTA	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796568
103	NC_013519	CAG	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268796568
104	NC_013519	AAG	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796568
105	NC_013519	ATA	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796568
106	NC_013519	ATG	2	6	9682	9687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796568
107	NC_013519	AAT	2	6	9723	9728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013519	GTT	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796569
109	NC_013519	ATT	2	6	9897	9902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796569
110	NC_013519	TAT	2	6	9919	9924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796569
111	NC_013519	TGG	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268796569
112	NC_013519	AAG	2	6	10014	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796569
113	NC_013519	ATA	2	6	10028	10033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796569
114	NC_013519	AGT	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796569
115	NC_013519	AGA	2	6	10191	10196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796569
116	NC_013519	ATA	2	6	10262	10267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796570
117	NC_013519	TGA	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796570
118	NC_013519	GAT	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796570
119	NC_013519	TAC	2	6	10427	10432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796570
120	NC_013519	CGT	2	6	10657	10662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013519	ACG	2	6	10668	10673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013519	ATA	2	6	10700	10705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013519	TGT	2	6	10752	10757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796571
124	NC_013519	TCC	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268796571
125	NC_013519	ATG	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796571
126	NC_013519	TAA	2	6	10902	10907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796571
127	NC_013519	ATA	2	6	10945	10950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796571
128	NC_013519	CCT	2	6	10956	10961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_013519	TAT	2	6	10975	10980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013519	TAT	2	6	11007	11012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013519	TTA	2	6	11335	11340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013519	AGT	2	6	11352	11357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013519	TAG	2	6	11546	11551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796572
134	NC_013519	CAA	2	6	11578	11583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796572
135	NC_013519	GAT	2	6	11620	11625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796572
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.