MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM02

Total Repeats: 106

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013519	ATT	2	6	208	213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796559
2	NC_013519	AGA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796559
3	NC_013519	TAA	2	6	727	732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
4	NC_013519	ATT	2	6	754	759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796560
5	NC_013519	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796560
6	NC_013519	AAT	2	6	880	885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796560
7	NC_013519	GAA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
8	NC_013519	GAA	2	6	983	988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796560
9	NC_013519	AAG	2	6	1256	1261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796561
10	NC_013519	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796561
11	NC_013519	AAT	2	6	1582	1587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796561
12	NC_013519	AAG	2	6	1694	1699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796562
13	NC_013519	AAC	2	6	1765	1770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796562
14	NC_013519	TAA	2	6	1779	1784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796562
15	NC_013519	AGA	2	6	3197	3202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796563
16	NC_013519	TAT	2	6	3438	3443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796563
17	NC_013519	ATC	2	6	3444	3449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796563
18	NC_013519	TAA	2	6	3577	3582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
19	NC_013519	AAT	2	6	3609	3614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796563
20	NC_013519	AAC	2	6	3780	3785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796563
21	NC_013519	AGG	2	6	3892	3897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796563
22	NC_013519	GAT	2	6	3924	3929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
23	NC_013519	TAT	2	6	3986	3991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796564
24	NC_013519	GAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
25	NC_013519	TGA	2	6	4160	4165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796564
26	NC_013519	AGA	2	6	4181	4186	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
27	NC_013519	GAA	2	6	4204	4209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
28	NC_013519	AAG	2	6	4249	4254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796564
29	NC_013519	AGA	2	6	4952	4957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
30	NC_013519	TGA	2	6	5080	5085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
31	NC_013519	TGG	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268796565
32	NC_013519	GAA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
33	NC_013519	TTG	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796565
34	NC_013519	ATT	2	6	5263	5268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
35	NC_013519	GTC	2	6	5334	5339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268796565
36	NC_013519	ATG	2	6	5346	5351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796565
37	NC_013519	ATT	2	6	5394	5399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
38	NC_013519	AGA	3	9	5492	5500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796565
39	NC_013519	ATT	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796565
40	NC_013519	AGG	2	6	5604	5609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796565
41	NC_013519	GAA	2	6	5644	5649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
42	NC_013519	AGA	2	6	5718	5723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
43	NC_013519	TGA	2	6	5735	5740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796566
44	NC_013519	ATT	2	6	5778	5783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
45	NC_013519	GAA	2	6	5809	5814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796566
46	NC_013519	CAA	2	6	5829	5834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
47	NC_013519	TAA	2	6	6044	6049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
48	NC_013519	TAA	2	6	6155	6160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
49	NC_013519	CAA	2	6	6321	6326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796566
50	NC_013519	TAA	2	6	6368	6373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
51	NC_013519	TTA	2	6	6386	6391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796566
52	NC_013519	TTC	2	6	6411	6416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268796566
53	NC_013519	AAT	2	6	6529	6534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796566
54	NC_013519	TAA	2	6	7073	7078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
55	NC_013519	ATT	2	6	7106	7111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796567
56	NC_013519	ATG	2	6	7298	7303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
57	NC_013519	TGA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
58	NC_013519	GAA	3	9	7390	7398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
59	NC_013519	ATG	2	6	7451	7456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
60	NC_013519	GAT	2	6	7669	7674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
61	NC_013519	ATG	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
62	NC_013519	GAC	2	6	8098	8103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268796567
63	NC_013519	GAT	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
64	NC_013519	GGA	2	6	8233	8238	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796567
65	NC_013519	AAC	2	6	8286	8291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796567
66	NC_013519	TGA	2	6	8310	8315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
67	NC_013519	ATG	2	6	8333	8338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796567
68	NC_013519	GAA	2	6	8363	8368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796567
69	NC_013519	AAT	2	6	8373	8378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
70	NC_013519	AAT	2	6	8553	8558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
71	NC_013519	ATT	2	6	8651	8656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796567
72	NC_013519	ATA	2	6	8711	8716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
73	NC_013519	AAT	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796567
74	NC_013519	TGT	2	6	8763	8768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796567
75	NC_013519	ATT	2	6	9170	9175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796568
76	NC_013519	TTA	2	6	9312	9317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796568
77	NC_013519	CAG	2	6	9352	9357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268796568
78	NC_013519	AAG	2	6	9447	9452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796568
79	NC_013519	ATA	2	6	9673	9678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796568
80	NC_013519	ATG	2	6	9682	9687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796568
81	NC_013519	GTT	2	6	9801	9806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796569
82	NC_013519	ATT	2	6	9897	9902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796569
83	NC_013519	TAT	2	6	9919	9924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268796569
84	NC_013519	TGG	2	6	9930	9935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268796569
85	NC_013519	AAG	2	6	10014	10019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796569
86	NC_013519	ATA	2	6	10028	10033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796569
87	NC_013519	AGT	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796569
88	NC_013519	AGA	2	6	10191	10196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796569
89	NC_013519	ATA	2	6	10262	10267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796570
90	NC_013519	TGA	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796570
91	NC_013519	GAT	2	6	10336	10341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796570
92	NC_013519	TAC	2	6	10427	10432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796570
93	NC_013519	TGT	2	6	10752	10757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268796571
94	NC_013519	TCC	2	6	10884	10889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268796571
95	NC_013519	ATG	2	6	10891	10896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796571
96	NC_013519	TAA	2	6	10902	10907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796571
97	NC_013519	ATA	2	6	10945	10950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796571
98	NC_013519	TAG	2	6	11546	11551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796572
99	NC_013519	CAA	2	6	11578	11583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268796572
100	NC_013519	GAT	2	6	11620	11625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796572
101	NC_013519	AGG	2	6	11840	11845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268796573
102	NC_013519	GAA	2	6	11969	11974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796573
103	NC_013519	AGA	2	6	13329	13334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268796574
104	NC_013519	TCA	2	6	13427	13432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268796574
105	NC_013519	TGA	2	6	13437	13442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268796574
106	NC_013519	TAA	2	6	13467	13472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268796574

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.