MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	ATAAAA	2	12	1952	1963	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	268793185
2	NC_013518	AAATAT	2	12	3098	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013518	ATTTCT	2	12	3639	3650	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268793188
4	NC_013518	TCATAA	2	12	5097	5108	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268793190
5	NC_013518	TTTTTC	2	12	5213	5224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268793190
6	NC_013518	TTTTAC	2	12	6454	6465	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268793191
7	NC_013518	CTTTTT	2	12	7186	7197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268793192
8	NC_013518	TTTCTT	2	12	9109	9120	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268793195
9	NC_013518	TATGTT	2	12	11644	11655	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268793199
10	NC_013518	ATAAGT	2	12	12440	12451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268793200
11	NC_013518	ACTTTC	2	12	12888	12899	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	268793201
12	NC_013518	GAAAAT	2	12	17964	17975	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013518	CTTTAA	2	12	22310	22321	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268793213
14	NC_013518	TAAATT	2	12	22527	22538	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
15	NC_013518	AAAGTA	2	12	22873	22884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268793213
16	NC_013518	AAACTA	2	12	24335	24346	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268793215
17	NC_013518	ATCTTT	2	12	25620	25631	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268793216
18	NC_013518	AATCCA	2	12	26622	26633	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	268793217
19	NC_013518	TATCTA	2	12	29988	29999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268793221
20	NC_013518	TTTATT	2	12	31001	31012	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	268793223
21	NC_013518	ATTTTC	2	12	31211	31222	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268793223
22	NC_013518	TACATT	2	12	34688	34699	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268793224
23	NC_013518	TTTATA	2	12	35343	35354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268793224
24	NC_013518	ATCTAC	2	12	36485	36496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268793224
25	NC_013518	ATGTTA	2	12	37720	37731	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268793224
26	NC_013518	ACTAAA	2	12	38102	38113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268793224
27	NC_013518	TATTTC	2	12	38816	38827	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268793224
28	NC_013518	TGTTCC	2	12	38837	38848	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	268793224
29	NC_013518	TCCTAC	2	12	40217	40228	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	268793225
30	NC_013518	CTTTAG	2	12	40493	40504	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268793225
31	NC_013518	GTAATT	2	12	41668	41679	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013518	CTTCTG	2	12	42022	42033	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	268793226
33	NC_013518	TTTTTC	2	12	42689	42700	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_013518	AAAATG	2	12	44088	44099	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013518	AGTTTT	2	12	44950	44961	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268793229
36	NC_013518	TCATAT	2	12	46280	46291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268793231
37	NC_013518	TCCTAT	2	12	47677	47688	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	268793231
38	NC_013518	AATTCC	2	12	47980	47991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268793231
39	NC_013518	GGTACA	2	12	48089	48100	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268793231
40	NC_013518	CTTCAT	2	12	48660	48671	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	268793231
41	NC_013518	TCCAGT	2	12	48733	48744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268793231
42	NC_013518	TATATT	2	12	51382	51393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268793231
43	NC_013518	ATTTAT	2	12	51544	51555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268793231
44	NC_013518	AAATAT	2	12	51668	51679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268793231
45	NC_013518	TGTATC	2	12	51769	51780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268793231
46	NC_013518	ATTTAA	2	12	52477	52488	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
47	NC_013518	TTCCTC	2	12	53321	53332	0 %	50 %	0 %	50 %	268793233

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.