MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	TTTTC	2	10	321	330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013518	TTCTC	2	10	696	705	0 %	60 %	0 %	40 %	268793184
3	NC_013518	TAAAT	2	10	1539	1548	60 %	40 %	0 %	0 %	268793185
4	NC_013518	ACATT	2	10	2379	2388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013518	GTTTT	2	10	2671	2680	0 %	80 %	20 %	0 %	268793186
6	NC_013518	ATTTA	2	10	3362	3371	40 %	60 %	0 %	0 %	268793187
7	NC_013518	AATTT	2	10	4050	4059	40 %	60 %	0 %	0 %	268793189
8	NC_013518	TTCTT	2	10	4138	4147	0 %	80 %	0 %	20 %	268793189
9	NC_013518	TTTTC	2	10	4393	4402	0 %	80 %	0 %	20 %	268793190
10	NC_013518	TCTAT	2	10	4866	4875	20 %	60 %	0 %	20 %	268793190
11	NC_013518	ATTTT	2	10	4957	4966	20 %	80 %	0 %	0 %	268793190
12	NC_013518	AAAAC	2	10	5300	5309	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013518	CATAT	2	10	6534	6543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013518	TTGAA	2	10	7888	7897	40 %	40 %	20 %	0 %	268793193
15	NC_013518	ATTAA	2	10	9285	9294	60 %	40 %	0 %	0 %	268793195
16	NC_013518	AAAAC	2	10	9476	9485	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_013518	TAAAA	2	10	10662	10671	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013518	TAAAT	2	10	10751	10760	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013518	TTCTC	2	10	13045	13054	0 %	60 %	0 %	40 %	268793201
20	NC_013518	AAGAA	2	10	15352	15361	80 %	0 %	20 %	0 %	268793204
21	NC_013518	TTTTA	2	10	15532	15541	20 %	80 %	0 %	0 %	268793204
22	NC_013518	ATATT	2	10	17276	17285	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013518	TCATA	2	10	17739	17748	40 %	40 %	0 %	20 %	268793208
24	NC_013518	AGAGA	2	10	18187	18196	60 %	0 %	40 %	0 %	268793209
25	NC_013518	TTAAA	2	10	19263	19272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013518	AATTT	2	10	19440	19449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013518	TTTAT	2	10	19920	19929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013518	ATTTT	2	10	20762	20771	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013518	ATCTG	2	10	22602	22611	20 %	40 %	20 %	20 %	268793213
30	NC_013518	ATATT	2	10	23623	23632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013518	CTGAT	2	10	23639	23648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_013518	TTTAT	2	10	23691	23700	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013518	ATATA	2	10	23999	24008	60 %	40 %	0 %	0 %	268793214
34	NC_013518	TCAAT	2	10	24478	24487	40 %	40 %	0 %	20 %	268793215
35	NC_013518	ACTTT	2	10	24721	24730	20 %	60 %	0 %	20 %	268793215
36	NC_013518	TTGTT	2	10	25329	25338	0 %	80 %	20 %	0 %	268793216
37	NC_013518	TTTTC	2	10	25754	25763	0 %	80 %	0 %	20 %	268793216
38	NC_013518	TTTGA	2	10	25827	25836	20 %	60 %	20 %	0 %	268793216
39	NC_013518	TATTT	2	10	26420	26429	20 %	80 %	0 %	0 %	268793217
40	NC_013518	ATATC	2	10	26461	26470	40 %	40 %	0 %	20 %	268793217
41	NC_013518	TGTTT	2	10	26862	26871	0 %	80 %	20 %	0 %	268793217
42	NC_013518	TATTT	2	10	27606	27615	20 %	80 %	0 %	0 %	268793218
43	NC_013518	AAGAT	2	10	29459	29468	60 %	20 %	20 %	0 %	268793220
44	NC_013518	TAAAA	2	10	30857	30866	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013518	AAAAT	2	10	31270	31279	80 %	20 %	0 %	0 %	268793223
46	NC_013518	CTTTC	2	10	32182	32191	0 %	60 %	0 %	40 %	268793224
47	NC_013518	ATATT	2	10	33985	33994	40 %	60 %	0 %	0 %	268793224
48	NC_013518	ACTGT	2	10	35308	35317	20 %	40 %	20 %	20 %	268793224
49	NC_013518	CTGCT	2	10	40959	40968	0 %	40 %	20 %	40 %	268793225
50	NC_013518	TCCTG	2	10	41001	41010	0 %	40 %	20 %	40 %	268793225
51	NC_013518	TATTT	2	10	45554	45563	20 %	80 %	0 %	0 %	268793230
52	NC_013518	CCTGC	2	10	50007	50016	0 %	20 %	20 %	60 %	268793231
53	NC_013518	TTGTT	2	10	50310	50319	0 %	80 %	20 %	0 %	268793231
54	NC_013518	TTATA	2	10	54102	54111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.