MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	TATT	2	8	21	28	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013518	AATA	2	8	221	228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013518	TATT	2	8	345	352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013518	AATT	2	8	960	967	50 %	50 %	0 %	0 %	268793184
5	NC_013518	CTTT	2	8	1318	1325	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013518	CTAA	2	8	1582	1589	50 %	25 %	0 %	25 %	268793185
7	NC_013518	ATTT	2	8	1661	1668	25 %	75 %	0 %	0 %	268793185
8	NC_013518	TAAA	2	8	2200	2207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013518	TTCC	2	8	2840	2847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013518	AATG	2	8	3244	3251	50 %	25 %	25 %	0 %	268793187
11	NC_013518	AAAT	2	8	3444	3451	75 %	25 %	0 %	0 %	268793187
12	NC_013518	CAAT	2	8	3537	3544	50 %	25 %	0 %	25 %	268793188
13	NC_013518	TAAA	2	8	3731	3738	75 %	25 %	0 %	0 %	268793188
14	NC_013518	TACA	2	8	3740	3747	50 %	25 %	0 %	25 %	268793188
15	NC_013518	ATTT	2	8	4110	4117	25 %	75 %	0 %	0 %	268793189
16	NC_013518	TTCT	2	8	4266	4273	0 %	75 %	0 %	25 %	268793189
17	NC_013518	AGAA	2	8	6289	6296	75 %	0 %	25 %	0 %	268793191
18	NC_013518	TTCT	2	8	7449	7456	0 %	75 %	0 %	25 %	268793193
19	NC_013518	AATA	2	8	7667	7674	75 %	25 %	0 %	0 %	268793193
20	NC_013518	TTTC	2	8	8060	8067	0 %	75 %	0 %	25 %	268793194
21	NC_013518	TAAG	2	8	8243	8250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013518	CTTT	2	8	8342	8349	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_013518	GCTT	2	8	8588	8595	0 %	50 %	25 %	25 %	268793195
24	NC_013518	ATTT	2	8	8954	8961	25 %	75 %	0 %	0 %	268793195
25	NC_013518	AACT	2	8	9401	9408	50 %	25 %	0 %	25 %	268793195
26	NC_013518	TCTT	2	8	9413	9420	0 %	75 %	0 %	25 %	268793195
27	NC_013518	TCTT	2	8	10551	10558	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_013518	CAAT	2	8	11011	11018	50 %	25 %	0 %	25 %	268793198
29	NC_013518	TTTA	2	8	11282	11289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013518	TATT	2	8	11454	11461	25 %	75 %	0 %	0 %	268793199
31	NC_013518	AAGA	3	12	12519	12530	75 %	0 %	25 %	0 %	268793200
32	NC_013518	ATCT	2	8	12553	12560	25 %	50 %	0 %	25 %	268793200
33	NC_013518	TTTG	2	8	12574	12581	0 %	75 %	25 %	0 %	268793200
34	NC_013518	ATTT	2	8	13241	13248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013518	TTAT	2	8	13270	13277	25 %	75 %	0 %	0 %	268793202
36	NC_013518	CTTT	2	8	13633	13640	0 %	75 %	0 %	25 %	268793202
37	NC_013518	AATC	2	8	13979	13986	50 %	25 %	0 %	25 %	268793202
38	NC_013518	TATC	2	8	14550	14557	25 %	50 %	0 %	25 %	268793203
39	NC_013518	TCTG	2	8	14966	14973	0 %	50 %	25 %	25 %	268793204
40	NC_013518	TTGG	2	8	14978	14985	0 %	50 %	50 %	0 %	268793204
41	NC_013518	GCTT	2	8	15099	15106	0 %	50 %	25 %	25 %	268793204
42	NC_013518	TAAA	2	8	15966	15973	75 %	25 %	0 %	0 %	268793204
43	NC_013518	TAAT	2	8	16138	16145	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013518	ATGC	2	8	16234	16241	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_013518	TAAA	2	8	16580	16587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013518	CTAT	2	8	16647	16654	25 %	50 %	0 %	25 %	268793205
47	NC_013518	CTTC	2	8	16902	16909	0 %	50 %	0 %	50 %	268793206
48	NC_013518	TACT	2	8	17141	17148	25 %	50 %	0 %	25 %	268793206
49	NC_013518	TACA	2	8	17187	17194	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_013518	AATT	2	8	17361	17368	50 %	50 %	0 %	0 %	268793207
51	NC_013518	ATAA	2	8	17396	17403	75 %	25 %	0 %	0 %	268793207
52	NC_013518	AGAA	2	8	17416	17423	75 %	0 %	25 %	0 %	268793207
53	NC_013518	AGCA	2	8	17535	17542	50 %	0 %	25 %	25 %	268793207
54	NC_013518	GATA	2	8	18276	18283	50 %	25 %	25 %	0 %	268793209
55	NC_013518	TATG	2	8	18651	18658	25 %	50 %	25 %	0 %	268793209
56	NC_013518	AAAT	2	8	18749	18756	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013518	AATA	2	8	18826	18833	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013518	ATTT	2	8	18925	18932	25 %	75 %	0 %	0 %	268793210
59	NC_013518	AAAG	2	8	19327	19334	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013518	GAAT	2	8	19473	19480	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013518	ATTT	2	8	19753	19760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013518	TTTC	2	8	19832	19839	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013518	TTAT	2	8	20290	20297	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013518	TTTC	2	8	20648	20655	0 %	75 %	0 %	25 %	268793211
65	NC_013518	AAAT	2	8	20814	20821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013518	TTTG	2	8	21747	21754	0 %	75 %	25 %	0 %	268793213
67	NC_013518	TTTC	2	8	21940	21947	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
68	NC_013518	TGCT	2	8	21980	21987	0 %	50 %	25 %	25 %	268793213
69	NC_013518	TATC	2	8	22151	22158	25 %	50 %	0 %	25 %	268793213
70	NC_013518	GTCT	2	8	22187	22194	0 %	50 %	25 %	25 %	268793213
71	NC_013518	TAAA	2	8	22368	22375	75 %	25 %	0 %	0 %	268793213
72	NC_013518	TTTC	2	8	22399	22406	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
73	NC_013518	AATT	2	8	22554	22561	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
74	NC_013518	CCCT	2	8	23003	23010	0 %	25 %	0 %	75 %	268793213
75	NC_013518	TTCT	2	8	23186	23193	0 %	75 %	0 %	25 %	268793213
76	NC_013518	TTTA	2	8	23882	23889	25 %	75 %	0 %	0 %	268793214
77	NC_013518	TTCT	2	8	24139	24146	0 %	75 %	0 %	25 %	268793214
78	NC_013518	GAAA	2	8	24248	24255	75 %	0 %	25 %	0 %	268793215
79	NC_013518	TAAA	2	8	24369	24376	75 %	25 %	0 %	0 %	268793215
80	NC_013518	TTTA	2	8	24798	24805	25 %	75 %	0 %	0 %	268793215
81	NC_013518	ATAA	2	8	25061	25068	75 %	25 %	0 %	0 %	268793216
82	NC_013518	ATTT	2	8	25731	25738	25 %	75 %	0 %	0 %	268793216
83	NC_013518	TAAA	2	8	25960	25967	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013518	ATTT	2	8	26131	26138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013518	TACT	2	8	26140	26147	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_013518	AAAT	2	8	26434	26441	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
87	NC_013518	ATTT	2	8	26756	26763	25 %	75 %	0 %	0 %	268793217
88	NC_013518	CTAT	2	8	26805	26812	25 %	50 %	0 %	25 %	268793217
89	NC_013518	TAAA	2	8	26877	26884	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
90	NC_013518	AATA	2	8	27020	27027	75 %	25 %	0 %	0 %	268793217
91	NC_013518	TTGA	2	8	27356	27363	25 %	50 %	25 %	0 %	268793217
92	NC_013518	CTTT	2	8	27420	27427	0 %	75 %	0 %	25 %	268793217
93	NC_013518	CTTT	2	8	27995	28002	0 %	75 %	0 %	25 %	268793218
94	NC_013518	TCCT	2	8	28231	28238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_013518	TTCC	2	8	28491	28498	0 %	50 %	0 %	50 %	268793219
96	NC_013518	AATT	2	8	28865	28872	50 %	50 %	0 %	0 %	268793220
97	NC_013518	CCAT	2	8	29153	29160	25 %	25 %	0 %	50 %	268793220
98	NC_013518	ATAA	2	8	29331	29338	75 %	25 %	0 %	0 %	268793220
99	NC_013518	ACCA	2	8	29369	29376	50 %	0 %	0 %	50 %	268793220
100	NC_013518	TTAC	2	8	29380	29387	25 %	50 %	0 %	25 %	268793220
101	NC_013518	ATCT	2	8	31105	31112	25 %	50 %	0 %	25 %	268793223
102	NC_013518	TCTT	2	8	31172	31179	0 %	75 %	0 %	25 %	268793223
103	NC_013518	CTTT	2	8	31233	31240	0 %	75 %	0 %	25 %	268793223
104	NC_013518	ATTT	2	8	31621	31628	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013518	AATA	3	12	32096	32107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013518	ATTT	2	8	32172	32179	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
107	NC_013518	CTTT	2	8	32926	32933	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
108	NC_013518	TTCT	2	8	32994	33001	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
109	NC_013518	CTTC	2	8	33246	33253	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
110	NC_013518	TTAT	2	8	33489	33496	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
111	NC_013518	TATT	2	8	33502	33509	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
112	NC_013518	GTTA	2	8	33767	33774	25 %	50 %	25 %	0 %	268793224
113	NC_013518	AATT	2	8	34015	34022	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
114	NC_013518	ACTC	2	8	34931	34938	25 %	25 %	0 %	50 %	268793224
115	NC_013518	CATT	2	8	35365	35372	25 %	50 %	0 %	25 %	268793224
116	NC_013518	TATT	2	8	35479	35486	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
117	NC_013518	CTTT	2	8	35494	35501	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
118	NC_013518	TTTC	2	8	35628	35635	0 %	75 %	0 %	25 %	268793224
119	NC_013518	ATCT	2	8	35768	35775	25 %	50 %	0 %	25 %	268793224
120	NC_013518	TTAT	2	8	35820	35827	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
121	NC_013518	GTCC	2	8	37183	37190	0 %	25 %	25 %	50 %	268793224
122	NC_013518	TTTA	2	8	37415	37422	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
123	NC_013518	TTGT	2	8	37473	37480	0 %	75 %	25 %	0 %	268793224
124	NC_013518	TTGT	2	8	37641	37648	0 %	75 %	25 %	0 %	268793224
125	NC_013518	TTAT	2	8	37674	37681	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
126	NC_013518	ATTA	2	8	38192	38199	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
127	NC_013518	TATT	2	8	38245	38252	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
128	NC_013518	TATT	2	8	38581	38588	25 %	75 %	0 %	0 %	268793224
129	NC_013518	CTTC	2	8	38718	38725	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
130	NC_013518	GCTT	2	8	39886	39893	0 %	50 %	25 %	25 %	268793225
131	NC_013518	ATCT	2	8	40886	40893	25 %	50 %	0 %	25 %	268793225
132	NC_013518	GCTC	2	8	41159	41166	0 %	25 %	25 %	50 %	268793225
133	NC_013518	GTTT	2	8	41293	41300	0 %	75 %	25 %	0 %	268793225
134	NC_013518	TTTC	2	8	41541	41548	0 %	75 %	0 %	25 %	268793225
135	NC_013518	TTTA	2	8	41682	41689	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013518	ATTT	2	8	41807	41814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013518	TAAG	2	8	42048	42055	50 %	25 %	25 %	0 %	268793226
138	NC_013518	AGTT	2	8	42391	42398	25 %	50 %	25 %	0 %	268793226
139	NC_013518	AATA	2	8	42469	42476	75 %	25 %	0 %	0 %	268793226
140	NC_013518	TCCT	2	8	42849	42856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013518	CAAC	2	8	43004	43011	50 %	0 %	0 %	50 %	268793227
142	NC_013518	TAAA	2	8	43792	43799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_013518	TTTA	2	8	44638	44645	25 %	75 %	0 %	0 %	268793229
144	NC_013518	ATTT	2	8	44677	44684	25 %	75 %	0 %	0 %	268793229
145	NC_013518	TACA	2	8	44808	44815	50 %	25 %	0 %	25 %	268793229
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.