MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Sebaldella termitidis ATCC 33386 plasmid pSTERM01

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013518	TC	3	6	883	888	0 %	50 %	0 %	50 %	268793184
2	NC_013518	AT	3	6	1810	1815	50 %	50 %	0 %	0 %	268793185
3	NC_013518	AT	3	6	2509	2514	50 %	50 %	0 %	0 %	268793186
4	NC_013518	AT	3	6	2552	2557	50 %	50 %	0 %	0 %	268793186
5	NC_013518	AC	3	6	3294	3299	50 %	0 %	0 %	50 %	268793187
6	NC_013518	AT	3	6	3399	3404	50 %	50 %	0 %	0 %	268793187
7	NC_013518	TA	3	6	3554	3559	50 %	50 %	0 %	0 %	268793188
8	NC_013518	CT	4	8	4588	4595	0 %	50 %	0 %	50 %	268793190
9	NC_013518	AT	4	8	4990	4997	50 %	50 %	0 %	0 %	268793190
10	NC_013518	AT	3	6	5121	5126	50 %	50 %	0 %	0 %	268793190
11	NC_013518	TC	3	6	5747	5752	0 %	50 %	0 %	50 %	268793191
12	NC_013518	TA	3	6	5821	5826	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
13	NC_013518	CT	3	6	5957	5962	0 %	50 %	0 %	50 %	268793191
14	NC_013518	AT	3	6	6097	6102	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
15	NC_013518	AT	3	6	6410	6415	50 %	50 %	0 %	0 %	268793191
16	NC_013518	AT	3	6	6955	6960	50 %	50 %	0 %	0 %	268793192
17	NC_013518	TA	3	6	6962	6967	50 %	50 %	0 %	0 %	268793192
18	NC_013518	CT	3	6	7234	7239	0 %	50 %	0 %	50 %	268793193
19	NC_013518	TA	3	6	7695	7700	50 %	50 %	0 %	0 %	268793193
20	NC_013518	TA	3	6	7795	7800	50 %	50 %	0 %	0 %	268793193
21	NC_013518	TA	4	8	8078	8085	50 %	50 %	0 %	0 %	268793194
22	NC_013518	TA	3	6	8579	8584	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
23	NC_013518	TA	3	6	8651	8656	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
24	NC_013518	TA	3	6	8663	8668	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
25	NC_013518	AT	3	6	9273	9278	50 %	50 %	0 %	0 %	268793195
26	NC_013518	TC	3	6	9972	9977	0 %	50 %	0 %	50 %	268793196
27	NC_013518	AT	5	10	10321	10330	50 %	50 %	0 %	0 %	268793197
28	NC_013518	TA	3	6	10782	10787	50 %	50 %	0 %	0 %	268793198
29	NC_013518	CA	3	6	12230	12235	50 %	0 %	0 %	50 %	268793200
30	NC_013518	AT	3	6	12513	12518	50 %	50 %	0 %	0 %	268793200
31	NC_013518	AT	3	6	12676	12681	50 %	50 %	0 %	0 %	268793200
32	NC_013518	AT	3	6	12947	12952	50 %	50 %	0 %	0 %	268793201
33	NC_013518	AT	3	6	13147	13152	50 %	50 %	0 %	0 %	268793201
34	NC_013518	TA	3	6	13261	13266	50 %	50 %	0 %	0 %	268793202
35	NC_013518	TA	3	6	13864	13869	50 %	50 %	0 %	0 %	268793202
36	NC_013518	CT	3	6	13965	13970	0 %	50 %	0 %	50 %	268793202
37	NC_013518	CT	3	6	14167	14172	0 %	50 %	0 %	50 %	268793203
38	NC_013518	AG	3	6	14303	14308	50 %	0 %	50 %	0 %	268793203
39	NC_013518	TG	3	6	14372	14377	0 %	50 %	50 %	0 %	268793203
40	NC_013518	TA	4	8	15373	15380	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
41	NC_013518	TA	3	6	15411	15416	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
42	NC_013518	CT	3	6	15713	15718	0 %	50 %	0 %	50 %	268793204
43	NC_013518	TC	3	6	15844	15849	0 %	50 %	0 %	50 %	268793204
44	NC_013518	AT	3	6	15923	15928	50 %	50 %	0 %	0 %	268793204
45	NC_013518	TA	3	6	17028	17033	50 %	50 %	0 %	0 %	268793206
46	NC_013518	AT	3	6	17756	17761	50 %	50 %	0 %	0 %	268793208
47	NC_013518	AT	5	10	17870	17879	50 %	50 %	0 %	0 %	268793208
48	NC_013518	TA	3	6	20538	20543	50 %	50 %	0 %	0 %	268793211
49	NC_013518	TC	3	6	21202	21207	0 %	50 %	0 %	50 %	268793212
50	NC_013518	TA	3	6	21530	21535	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
51	NC_013518	AT	3	6	22075	22080	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
52	NC_013518	AT	3	6	22205	22210	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
53	NC_013518	TA	3	6	23154	23159	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
54	NC_013518	TA	3	6	23457	23462	50 %	50 %	0 %	0 %	268793213
55	NC_013518	AT	3	6	24582	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	268793215
56	NC_013518	AT	3	6	24645	24650	50 %	50 %	0 %	0 %	268793215
57	NC_013518	AT	3	6	25312	25317	50 %	50 %	0 %	0 %	268793216
58	NC_013518	AC	3	6	25455	25460	50 %	0 %	0 %	50 %	268793216
59	NC_013518	TC	3	6	25486	25491	0 %	50 %	0 %	50 %	268793216
60	NC_013518	TC	3	6	25667	25672	0 %	50 %	0 %	50 %	268793216
61	NC_013518	AT	3	6	25816	25821	50 %	50 %	0 %	0 %	268793216
62	NC_013518	AT	3	6	26782	26787	50 %	50 %	0 %	0 %	268793217
63	NC_013518	AT	3	6	27671	27676	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
64	NC_013518	TA	3	6	27718	27723	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
65	NC_013518	AT	3	6	28042	28047	50 %	50 %	0 %	0 %	268793218
66	NC_013518	AT	4	8	28642	28649	50 %	50 %	0 %	0 %	268793220
67	NC_013518	AT	4	8	30067	30074	50 %	50 %	0 %	0 %	268793221
68	NC_013518	TC	3	6	33278	33283	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
69	NC_013518	TC	3	6	33316	33321	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
70	NC_013518	AT	3	6	33385	33390	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
71	NC_013518	TG	3	6	33431	33436	0 %	50 %	50 %	0 %	268793224
72	NC_013518	AT	3	6	35281	35286	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
73	NC_013518	TC	3	6	35463	35468	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
74	NC_013518	AT	3	6	35488	35493	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
75	NC_013518	TA	3	6	35507	35512	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
76	NC_013518	AT	3	6	35568	35573	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
77	NC_013518	AT	3	6	35752	35757	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
78	NC_013518	AT	3	6	36990	36995	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
79	NC_013518	CT	3	6	37154	37159	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
80	NC_013518	TA	3	6	37399	37404	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
81	NC_013518	AT	3	6	37774	37779	50 %	50 %	0 %	0 %	268793224
82	NC_013518	TC	3	6	38957	38962	0 %	50 %	0 %	50 %	268793224
83	NC_013518	AC	3	6	39625	39630	50 %	0 %	0 %	50 %	268793224
84	NC_013518	AT	3	6	39984	39989	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
85	NC_013518	TA	3	6	39999	40004	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
86	NC_013518	CT	3	6	40026	40031	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
87	NC_013518	TA	3	6	40046	40051	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
88	NC_013518	AT	3	6	40075	40080	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
89	NC_013518	TA	3	6	40625	40630	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
90	NC_013518	CT	3	6	40828	40833	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
91	NC_013518	TA	3	6	41249	41254	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
92	NC_013518	TA	3	6	41264	41269	50 %	50 %	0 %	0 %	268793225
93	NC_013518	CT	3	6	41496	41501	0 %	50 %	0 %	50 %	268793225
94	NC_013518	TA	3	6	42010	42015	50 %	50 %	0 %	0 %	268793226
95	NC_013518	AT	3	6	42264	42269	50 %	50 %	0 %	0 %	268793226
96	NC_013518	TA	3	6	43112	43117	50 %	50 %	0 %	0 %	268793227
97	NC_013518	AT	3	6	43435	43440	50 %	50 %	0 %	0 %	268793228
98	NC_013518	AT	3	6	43692	43697	50 %	50 %	0 %	0 %	268793228
99	NC_013518	TA	4	8	45817	45824	50 %	50 %	0 %	0 %	268793230
100	NC_013518	AT	3	6	47187	47192	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
101	NC_013518	AT	3	6	47752	47757	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
102	NC_013518	TA	3	6	47974	47979	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
103	NC_013518	AT	3	6	48115	48120	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
104	NC_013518	AT	3	6	48141	48146	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
105	NC_013518	TA	3	6	48525	48530	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
106	NC_013518	TA	3	6	48606	48611	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
107	NC_013518	AT	3	6	49599	49604	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
108	NC_013518	AT	3	6	49876	49881	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
109	NC_013518	AT	3	6	50379	50384	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
110	NC_013518	AT	3	6	51613	51618	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
111	NC_013518	TA	3	6	52603	52608	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231
112	NC_013518	TA	3	6	52756	52761	50 %	50 %	0 %	0 %	268793231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.