MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013512	ATTTTT	2	12	85180	85191	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013512	CTTTAA	2	12	97691	97702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013512	TCAATT	2	12	211047	211058	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013512	TGGTGT	2	12	245500	245511	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013512	TCAAAT	2	12	415358	415369	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013512	CGTTTA	2	12	437815	437826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013512	GGCTTT	2	12	443758	443769	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013512	TTAAAA	2	12	444040	444051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013512	TTAAAA	2	12	454688	454699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013512	AAAGAT	2	12	490231	490242	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013512	TAACTT	2	12	495832	495843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013512	AAAAAG	2	12	528444	528455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013512	TTTATT	2	12	679209	679220	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013512	ATAGCC	2	12	679362	679373	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_013512	TCACGG	2	12	679803	679814	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013512	TTTATT	2	12	762319	762330	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013512	CTTGAG	2	12	782842	782853	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013512	AAAACC	2	12	831554	831565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013512	TCATTT	2	12	833804	833815	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013512	ATTTTT	2	12	857779	857790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013512	TTAATT	2	12	900428	900439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013512	CTTTTT	2	12	901522	901533	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_013512	TGACGT	2	12	902248	902259	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013512	TAAAAA	2	12	951409	951420	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013512	GTTTTT	2	12	1023521	1023532	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013512	CCAAAG	2	12	1024741	1024752	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_013512	CTTTTT	2	12	1087849	1087860	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013512	TTTTAC	2	12	1163074	1163085	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_013512	AAATGT	2	12	1221864	1221875	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013512	TTCAAA	2	12	1246863	1246874	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013512	GTTTTT	2	12	1265828	1265839	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013512	CCATCC	2	12	1271364	1271375	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013512	AGGTTG	2	12	1271567	1271578	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013512	ATTTTT	2	12	1375114	1375125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013512	TAAAAA	2	12	1377272	1377283	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013512	GCAAAG	2	12	1377372	1377383	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_013512	TAATTT	2	12	1377705	1377716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013512	TCTTCA	2	12	1405627	1405638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013512	AAATTG	2	12	1522130	1522141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013512	TATTTT	2	12	1541404	1541415	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013512	TTTATT	2	12	1543188	1543199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013512	TTAGTT	2	12	1641018	1641029	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013512	GAACTA	2	12	1643461	1643472	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_013512	ACTCTT	2	12	1696887	1696898	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013512	CCCAAA	2	12	1705732	1705743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013512	ATTAAA	2	12	1741441	1741452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013512	TAAAGA	2	12	1757189	1757200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013512	TAATCT	2	12	1779050	1779061	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013512	CTTTAC	2	12	1922851	1922862	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_013512	AGCTTC	2	12	2172800	2172811	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013512	TTTTTC	2	12	2173001	2173012	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_013512	CTTAAG	2	12	2197885	2197896	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_013512	TTTATT	2	12	2287226	2287237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013512	GTAAAA	2	12	2290574	2290585	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.