MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013512	ATGCCT	2	12	2220	2231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268678645
2	NC_013512	TTAATA	2	12	3137	3148	50 %	50 %	0 %	0 %	268678646
3	NC_013512	AAAAAC	2	12	3490	3501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	268678646
4	NC_013512	AAATTA	2	12	3569	3580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268678646
5	NC_013512	TTTGAT	2	12	13791	13802	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678656
6	NC_013512	TTTGAG	2	12	15240	15251	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678658
7	NC_013512	GGTTTG	2	12	15912	15923	0 %	50 %	50 %	0 %	268678658
8	NC_013512	TTTAAT	2	12	18225	18236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268678660
9	NC_013512	CATTGG	2	12	22670	22681	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678664
10	NC_013512	CTATAA	2	12	22892	22903	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268678664
11	NC_013512	TTTTTC	2	12	30757	30768	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268678674
12	NC_013512	ATGTAA	2	12	30868	30879	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268678674
13	NC_013512	TCTATT	2	12	31790	31801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268678674
14	NC_013512	TAACGG	2	12	40270	40281	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268678683
15	NC_013512	TATGGG	2	12	40604	40615	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678683
16	NC_013512	AGGTAA	2	12	43165	43176	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268678687
17	NC_013512	CGTCAT	2	12	44177	44188	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268678687
18	NC_013512	AATTTT	2	12	48914	48925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268678692
19	NC_013512	ATTTTG	2	12	53474	53485	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678696
20	NC_013512	GTGTAG	2	12	54192	54203	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678696
21	NC_013512	TAAAAG	2	12	57431	57442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268678699
22	NC_013512	CTTTTG	2	12	59014	59025	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	268678702
23	NC_013512	ATTGAC	2	12	59216	59227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268678702
24	NC_013512	CCTCTA	2	12	61849	61860	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	268678705
25	NC_013512	TGATGT	2	12	64837	64848	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678707
26	NC_013512	TCAACC	2	12	66341	66352	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	268678709
27	NC_013512	TTGGAT	2	12	67650	67661	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678709
28	NC_013512	AAGTTT	2	12	69779	69790	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268678712
29	NC_013512	TTGCAT	2	12	72379	72390	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678716
30	NC_013512	CAACTT	2	12	72783	72794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268678716
31	NC_013512	ATATGA	2	12	74559	74570	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268678718
32	NC_013512	AGATAG	2	12	75082	75093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268678718
33	NC_013512	ATTTTG	2	12	84682	84693	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678728
34	NC_013512	TTTGTT	2	12	85051	85062	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	268678728
35	NC_013512	TAAAAG	2	12	92422	92433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268678739
36	NC_013512	TCAGTG	2	12	92611	92622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678740
37	NC_013512	GGTGAT	2	12	104926	104937	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678754
38	NC_013512	GCGAGT	2	12	104983	104994	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268678754
39	NC_013512	GGTGAT	2	12	106824	106835	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678755
40	NC_013512	GCGAGT	2	12	106881	106892	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268678755
41	NC_013512	CAAAAG	2	12	110705	110716	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	268678759
42	NC_013512	GCAATG	2	12	110894	110905	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268678760
43	NC_013512	TGCGAT	2	12	119486	119497	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678770
44	NC_013512	ACGTTG	2	12	120880	120891	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678772
45	NC_013512	TTTAGG	2	12	121526	121537	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678773
46	NC_013512	GACTTT	2	12	124874	124885	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678777
47	NC_013512	CATTGT	2	12	125949	125960	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678778
48	NC_013512	TTTTGA	2	12	129058	129069	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678780
49	NC_013512	TGTGAT	2	12	129325	129336	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678781
50	NC_013512	AAACGT	2	12	129949	129960	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268678782
51	NC_013512	AAAGAG	2	12	129982	129993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268678782
52	NC_013512	GCTTTT	2	12	131942	131953	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	268678785
53	NC_013512	TTTATG	2	12	141421	141432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678793
54	NC_013512	GAAGCA	2	12	143006	143017	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268678794
55	NC_013512	GTATTG	2	12	147857	147868	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678798
56	NC_013512	AAGCAC	2	12	158575	158586	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	268678811
57	NC_013512	TTCGAT	2	12	159149	159160	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678811
58	NC_013512	GTTTTT	2	12	160881	160892	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	268678814
59	NC_013512	AAACTT	2	12	162903	162914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268678816
60	NC_013512	ATTTCT	2	12	163328	163339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268678817
61	NC_013512	TTTAGG	2	12	163927	163938	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678817
62	NC_013512	CTTCAG	2	12	166279	166290	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268678821
63	NC_013512	GTAAAA	2	12	168589	168600	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268678823
64	NC_013512	GCTTTG	2	12	170229	170240	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268678824
65	NC_013512	TTTTCT	2	12	172614	172625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268678825
66	NC_013512	GTGGAT	2	12	179365	179376	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678831
67	NC_013512	TCTTTC	2	12	181219	181230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268678833
68	NC_013512	TGGCTA	2	12	184147	184158	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678837
69	NC_013512	TGGTAT	2	12	193744	193755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678848
70	NC_013512	TTTGAT	2	12	194909	194920	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678850
71	NC_013512	TAAAAA	2	12	202826	202837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	268678858
72	NC_013512	TCAAAA	2	12	202916	202927	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268678858
73	NC_013512	TATTGC	2	12	204508	204519	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678860
74	NC_013512	CATATT	2	12	209947	209958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268678864
75	NC_013512	ATCAAG	2	12	212178	212189	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268678868
76	NC_013512	AATTTT	2	12	221601	221612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268678878
77	NC_013512	CTTCCA	2	12	222443	222454	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	268678879
78	NC_013512	TCGGTG	2	12	226637	226648	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268678884
79	NC_013512	AAGCTT	2	12	228243	228254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268678885
80	NC_013512	AAAAGA	2	12	231656	231667	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	268678889
81	NC_013512	TTGTGG	2	12	232445	232456	0 %	50 %	50 %	0 %	268678889
82	NC_013512	TTTTCG	2	12	233990	234001	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	268678890
83	NC_013512	TCTAAA	2	12	238911	238922	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268678895
84	NC_013512	GGTTTT	2	12	239308	239319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268678896
85	NC_013512	ACAATC	2	12	243130	243141	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	268678900
86	NC_013512	GAATAC	2	12	244512	244523	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268678902
87	NC_013512	TCTTTT	2	12	248919	248930	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	268678905
88	NC_013512	GCCAAA	2	12	250192	250203	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	268678906
89	NC_013512	TACAAA	2	12	251500	251511	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268678906
90	NC_013512	GTTAAA	2	12	251872	251883	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268678906
91	NC_013512	GATTGG	2	12	253280	253291	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268678908
92	NC_013512	CGATTG	2	12	256876	256887	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678910
93	NC_013512	GCAGAT	2	12	261469	261480	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268678914
94	NC_013512	TAAAAA	2	12	261508	261519	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	268678914
95	NC_013512	GAAGAG	2	12	262111	262122	50 %	0 %	50 %	0 %	268678915
96	NC_013512	CTCTTT	2	12	263297	263308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268678916
97	NC_013512	CAAAGG	2	12	265296	265307	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	268678918
98	NC_013512	AGTTTG	2	12	267447	267458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678921
99	NC_013512	CACACT	2	12	271567	271578	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	268678925
100	NC_013512	CAATGC	2	12	274334	274345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268678928
101	NC_013512	GTTTTC	2	12	275635	275646	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	268678930
102	NC_013512	CTTTGA	2	12	280933	280944	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268678936
103	NC_013512	GTTTAT	2	12	284960	284971	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678941
104	NC_013512	ATTTTT	2	12	286077	286088	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	268678941
105	NC_013512	GACACA	2	12	287441	287452	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	268678943
106	NC_013512	TCAGTG	2	12	291812	291823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268678949
107	NC_013512	ACGGTA	2	12	299896	299907	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268678956
108	NC_013512	ACCAAA	2	12	303622	303633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268678959
109	NC_013512	AAAACC	2	12	306503	306514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268678962
110	NC_013512	GTTTTT	2	12	307980	307991	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	268678964
111	NC_013512	GCTTTG	2	12	308432	308443	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268678964
112	NC_013512	TGGATT	2	12	311599	311610	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268678967
113	NC_013512	GATAAA	2	12	315853	315864	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268678971
114	NC_013512	TGACAT	2	12	316662	316673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268678973
115	NC_013512	ATTTGA	2	12	321270	321281	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268678979
116	NC_013512	CCTATG	2	12	321974	321985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268678981
117	NC_013512	TTGTTT	2	12	323855	323866	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	268678984
118	NC_013512	GTATTT	2	12	324075	324086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268678985
119	NC_013512	GCTGGT	3	18	329780	329797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	268678993
120	NC_013512	TGGTCT	2	12	329899	329910	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268678993
121	NC_013512	ATATTT	2	12	332406	332417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268678994
122	NC_013512	TGAAGA	2	12	332422	332433	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268678994
123	NC_013512	TACATG	2	12	333947	333958	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268678994
124	NC_013512	AAAATA	2	12	334771	334782	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	268678995
125	NC_013512	CTGGTT	2	12	341462	341473	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268678998
126	NC_013512	AGTTGA	2	12	341727	341738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268678998
127	NC_013512	TGAGTT	2	12	349250	349261	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268679005
128	NC_013512	TTCCTA	2	12	350401	350412	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	268679005
129	NC_013512	AACCCA	2	12	351243	351254	50 %	0 %	0 %	50 %	268679006
130	NC_013512	TAAAGA	2	12	351763	351774	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268679006
131	NC_013512	TGATTG	2	12	352014	352025	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	268679006
132	NC_013512	CAAAGA	2	12	353696	353707	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	268679007
133	NC_013512	ATAAAC	2	12	355097	355108	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268679008
134	NC_013512	CATATT	2	12	356055	356066	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268679010
135	NC_013512	AAAAGT	2	12	356726	356737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	268679011
136	NC_013512	GGTGGC	2	12	363841	363852	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	268679019
137	NC_013512	ATTTTC	2	12	365228	365239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268679021
138	NC_013512	GATTGG	2	12	368744	368755	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268679025
139	NC_013512	TTTAGA	2	12	371289	371300	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268679027
140	NC_013512	TCCAAA	2	12	372334	372345	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	268679029
141	NC_013512	AAAAAG	2	12	372725	372736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	268679029
142	NC_013512	ATGGCG	2	12	374249	374260	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	268679031
143	NC_013512	CAAGCT	2	12	375832	375843	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	268679033
144	NC_013512	TCTGAA	2	12	376303	376314	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268679033
145	NC_013512	GTAAAG	2	12	380354	380365	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268679036
146	NC_013512	GTCAAT	2	12	380728	380739	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	268679036
147	NC_013512	TATGCC	2	12	381671	381682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	268679037
148	NC_013512	CAAAAT	2	12	387490	387501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	268679040
149	NC_013512	ACCAAT	2	12	388970	388981	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	268679042
150	NC_013512	GAGCGG	2	12	394400	394411	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	268679049
151	NC_013512	ATCTCT	2	12	397090	397101	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	268679051
152	NC_013512	TTTCAA	2	12	397216	397227	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268679052
153	NC_013512	GGGAAG	2	12	397246	397257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268679052
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155	NC_013512	TCGATG	2	12	404467	404478	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268679059
156	NC_013512	TATCAA	2	12	406566	406577	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268679061
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219	NC_013512	TTTAAA	2	12	574264	574275	50 %	50 %	0 %	0 %	268679230
220	NC_013512	TGGCAA	2	12	574832	574843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	268679231
221	NC_013512	TTTTAG	2	12	579678	579689	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268679235
222	NC_013512	CTGGTC	2	12	580830	580841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268679235
223	NC_013512	TGTAGG	2	12	583261	583272	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	268679237
224	NC_013512	TTTTCA	2	12	584359	584370	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	268679239
225	NC_013512	TTGAAA	2	12	587409	587420	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	268679240
226	NC_013512	CATTTG	2	12	588338	588349	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268679241
227	NC_013512	TGAAAC	2	12	588354	588365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268679241
228	NC_013512	GTTAGA	2	12	590422	590433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268679244
229	NC_013512	AGAAAA	2	12	590905	590916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	268679244
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231	NC_013512	GTATCG	2	12	598804	598815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	268679250
232	NC_013512	TTTGCA	2	12	599150	599161	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	268679250
233	NC_013512	TTCAAT	2	12	599565	599576	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	268679250
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343	NC_013512	ATTTTG	2	12	921936	921947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	268679549
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454	NC_013512	TGAAGA	2	12	1187718	1187729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268679798
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457	NC_013512	CTTTGG	2	12	1189888	1189899	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	268679801
458	NC_013512	TAGCAA	2	12	1191839	1191850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268679804
459	NC_013512	CCAAAC	2	12	1192063	1192074	50 %	0 %	0 %	50 %	268679804
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464	NC_013512	TTTGGG	2	12	1214823	1214834	0 %	50 %	50 %	0 %	268679828
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