MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946 chromosome

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013512	CTAA	2	8	1196	1203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013512	TTAA	2	8	2731	2738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013512	AAAG	2	8	12620	12627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013512	TTTA	2	8	13370	13377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013512	AAAC	2	8	16174	16181	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_013512	TAAA	2	8	29739	29746	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013512	TATT	2	8	31876	31883	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013512	CTTT	2	8	33317	33324	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013512	CCAT	2	8	38389	38396	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_013512	ATTA	2	8	38561	38568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013512	ACAG	2	8	42748	42755	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_013512	AAAT	2	8	73610	73617	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013512	TATT	2	8	79692	79699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013512	TTCT	2	8	82258	82265	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_013512	AATA	2	8	82342	82349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013512	ATTT	2	8	82647	82654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013512	ATCC	2	8	93254	93261	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013512	TCTT	2	8	93378	93385	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_013512	TTAC	2	8	105918	105925	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013512	TCAA	2	8	112484	112491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_013512	ATGG	2	8	114166	114173	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013512	ATTA	2	8	168082	168089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013512	AATT	2	8	171622	171629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013512	TATT	2	8	182046	182053	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013512	ATTT	2	8	209626	209633	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013512	TAGT	2	8	211077	211084	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013512	TTGA	2	8	222580	222587	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013512	ATAC	2	8	222650	222657	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_013512	AAAG	2	8	225620	225627	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013512	TTGT	2	8	230836	230843	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013512	ACAA	2	8	230952	230959	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_013512	AAAG	2	8	230963	230970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013512	TTAG	2	8	239193	239200	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013512	CAAA	2	8	249497	249504	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_013512	TAAA	2	8	264302	264309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013512	TTGT	2	8	270365	270372	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013512	ATTT	2	8	271970	271977	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013512	TATT	2	8	273509	273516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013512	TTTA	2	8	294378	294385	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013512	TTCA	2	8	298059	298066	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_013512	AGTC	2	8	298073	298080	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_013512	TCAC	2	8	309565	309572	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013512	GTTG	2	8	313755	313762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013512	GAAA	2	8	316475	316482	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013512	TTTG	2	8	323700	323707	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013512	TAAA	2	8	338863	338870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013512	AGTA	2	8	343869	343876	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013512	TTCA	2	8	345018	345025	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013512	ATTA	2	8	361362	361369	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013512	AAGT	2	8	370447	370454	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013512	AAGT	2	8	378493	378500	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013512	GTGA	2	8	378508	378515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013512	TAAA	2	8	382132	382139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013512	ACCA	2	8	382243	382250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_013512	TCAA	2	8	405733	405740	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_013512	AGTC	2	8	415398	415405	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013512	GGGA	2	8	426469	426476	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013512	ATTC	2	8	427868	427875	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_013512	TATG	2	8	431821	431828	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013512	TTTA	2	8	431907	431914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013512	AAAG	2	8	432617	432624	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013512	GAAA	2	8	435303	435310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013512	GACT	3	12	440102	440113	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013512	AATA	2	8	440183	440190	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013512	CTTT	2	8	440287	440294	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013512	AATT	2	8	443030	443037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013512	ATTT	2	8	448665	448672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013512	TCAT	2	8	448706	448713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_013512	TTAC	2	8	456846	456853	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_013512	TATG	2	8	466791	466798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013512	GATG	2	8	474960	474967	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013512	GATA	2	8	487075	487082	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013512	TAAA	2	8	488349	488356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013512	TAAA	2	8	489875	489882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013512	AAAG	2	8	497400	497407	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013512	AATT	2	8	510827	510834	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013512	TAAG	2	8	510845	510852	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013512	TTTA	2	8	523769	523776	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013512	ATTA	2	8	527391	527398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013512	ATCA	2	8	530030	530037	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013512	AAGC	2	8	559094	559101	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013512	AATT	2	8	564433	564440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013512	TTTA	2	8	594428	594435	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013512	ATCA	2	8	601828	601835	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013512	TAAT	2	8	606813	606820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013512	TCAC	2	8	612459	612466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_013512	AAAT	2	8	612783	612790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013512	TAGA	2	8	641064	641071	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013512	TAAA	2	8	651181	651188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013512	ATTA	2	8	675611	675618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013512	GTTT	2	8	675699	675706	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013512	AAGG	2	8	675815	675822	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013512	CCTT	2	8	675836	675843	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_013512	AAGA	2	8	679977	679984	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013512	TGAA	2	8	688243	688250	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013512	AAAT	2	8	703237	703244	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_013512	TTTA	2	8	703444	703451	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013512	TAAA	2	8	703488	703495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013512	AGGA	2	8	704153	704160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013512	CCAT	2	8	715692	715699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_013512	AAAT	2	8	716017	716024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013512	TAAT	2	8	716645	716652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013512	AACC	2	8	717108	717115	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_013512	ACGC	2	8	717274	717281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013512	TAAA	2	8	717598	717605	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013512	TATT	2	8	717622	717629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013512	AAAG	2	8	717945	717952	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013512	CTTA	2	8	718350	718357	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_013512	TAAA	2	8	718561	718568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013512	TATT	2	8	722131	722138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013512	AAAT	2	8	722175	722182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013512	TAAA	2	8	732160	732167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013512	CTTT	2	8	736196	736203	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_013512	CTTT	2	8	736239	736246	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013512	CAGA	2	8	736610	736617	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013512	GGGT	2	8	736655	736662	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013512	CATC	2	8	736754	736761	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013512	ATCT	2	8	739449	739456	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_013512	CACT	2	8	759299	759306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013512	CTAA	2	8	760761	760768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_013512	ATAA	2	8	760845	760852	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013512	CAAT	2	8	766676	766683	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_013512	TTTA	2	8	768779	768786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013512	TAAA	2	8	772957	772964	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013512	ATTT	2	8	777864	777871	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013512	CTTA	2	8	777899	777906	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_013512	TATC	2	8	778164	778171	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_013512	TTGA	2	8	778345	778352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013512	GATT	2	8	778495	778502	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013512	AAAT	2	8	778530	778537	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013512	ATCA	2	8	778840	778847	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_013512	AAAT	2	8	779308	779315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013512	TCTA	2	8	781909	781916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_013512	GCAC	2	8	782513	782520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013512	AAGA	2	8	801368	801375	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013512	AATA	2	8	805588	805595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013512	CCTT	2	8	812877	812884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_013512	TCTT	2	8	841307	841314	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_013512	ATTT	2	8	859014	859021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_013512	TTTA	2	8	861866	861873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013512	AACA	2	8	891290	891297	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_013512	AATC	2	8	900540	900547	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_013512	AAAC	2	8	902618	902625	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_013512	TTGA	2	8	902688	902695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_013512	AACT	2	8	902700	902707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_013512	AATC	2	8	902778	902785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_013512	GATA	2	8	903281	903288	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_013512	GAAG	2	8	903353	903360	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_013512	GATG	2	8	903937	903944	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_013512	ACCC	2	8	906262	906269	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_013512	AATT	2	8	906561	906568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_013512	CAGA	2	8	1700244	1700251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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322	NC_013512	CTTT	2	8	1910931	1910938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
323	NC_013512	ATTT	2	8	1933507	1933514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_013512	TAAA	2	8	1937919	1937926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
325	NC_013512	TATT	2	8	1942088	1942095	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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332	NC_013512	TGCT	2	8	2039651	2039658	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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342	NC_013512	TTTA	2	8	2077127	2077134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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344	NC_013512	TTTA	2	8	2108070	2108077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
345	NC_013512	TGAT	2	8	2116953	2116960	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
346	NC_013512	ATTA	2	8	2117030	2117037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
347	NC_013512	AAGA	2	8	2132251	2132258	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.