MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma hominis ATCC 23114 chromosome

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013511	AAATA	2	10	8677	8686	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013511	AAAGA	2	10	8734	8743	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013511	AGTCC	2	10	9066	9075	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013511	ATTAA	2	10	10353	10362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013511	TTTTA	2	10	14834	14843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013511	ATTTT	2	10	20325	20334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013511	GAAAA	2	10	31223	31232	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013511	ACACA	2	10	32290	32299	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_013511	TAAAA	2	10	32432	32441	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013511	TGAAA	2	10	43695	43704	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013511	AGTTT	2	10	46497	46506	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013511	AATTG	2	10	46627	46636	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013511	TTGAA	2	10	48662	48671	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013511	ATTTG	2	10	59023	59032	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013511	ATGAA	2	10	59112	59121	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013511	TTAAT	2	10	59976	59985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013511	TTAGA	2	10	60240	60249	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013511	GGACA	2	10	66201	66210	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013511	TAAAT	2	10	72364	72373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013511	ATTTT	2	10	72436	72445	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013511	AAGGA	2	10	72515	72524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013511	TATAA	2	10	75383	75392	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013511	ATGAT	2	10	76607	76616	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013511	TATAA	2	10	81271	81280	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013511	TATTT	2	10	88500	88509	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013511	TTTAT	2	10	90085	90094	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013511	TTATT	2	10	91783	91792	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013511	ATTAA	2	10	92067	92076	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013511	AAAAG	2	10	99212	99221	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013511	TTTTA	2	10	107457	107466	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013511	TTTAT	2	10	112947	112956	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013511	TAAAA	2	10	115020	115029	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013511	TAAAA	2	10	116459	116468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013511	ATTAT	2	10	116511	116520	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013511	ATTTA	2	10	129632	129641	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013511	ATTTT	2	10	133130	133139	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013511	TAAAT	2	10	133147	133156	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013511	AGAAA	2	10	142583	142592	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013511	AATTA	2	10	142803	142812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013511	AATAA	2	10	143212	143221	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013511	TAAAA	2	10	161864	161873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013511	TATTT	2	10	161874	161883	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013511	ACTTG	2	10	165761	165770	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_013511	TAAAT	2	10	168607	168616	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013511	GCAAA	2	10	178586	178595	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_013511	TAATG	2	10	209630	209639	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013511	TTTAA	2	10	209735	209744	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013511	AAACA	2	10	227620	227629	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_013511	AAAAC	2	10	230665	230674	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_013511	TTAAA	2	10	241613	241622	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013511	TAATT	2	10	246453	246462	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013511	TAAAA	2	10	248633	248642	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013511	AAAAT	2	10	254551	254560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013511	TTTAA	2	10	254686	254695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013511	ATTTT	2	10	262893	262902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013511	CTAAA	2	10	268209	268218	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013511	TTATT	2	10	270495	270504	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013511	ATTTT	2	10	275702	275711	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013511	CAAGG	2	10	280061	280070	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_013511	TAAAT	2	10	280159	280168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013511	ATTAT	2	10	295217	295226	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013511	TAATT	2	10	297493	297502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013511	TTTCT	2	10	307203	307212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013511	TAAAT	2	10	308469	308478	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013511	CTTAA	2	10	310795	310804	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_013511	TTTAT	2	10	315791	315800	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013511	AGTTA	2	10	328557	328566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013511	CTCCC	2	10	329554	329563	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
69	NC_013511	CACGA	2	10	330735	330744	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_013511	TAATT	2	10	331979	331988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013511	TTTGA	2	10	364412	364421	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013511	AATAT	2	10	364450	364459	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013511	ATTTA	2	10	364479	364488	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013511	TCTTT	2	10	387011	387020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_013511	TAAAA	2	10	388098	388107	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013511	TTAAT	2	10	394570	394579	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013511	TAATT	2	10	397042	397051	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013511	AAATT	3	15	410124	410138	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013511	CTATT	2	10	410155	410164	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_013511	ACTTT	2	10	412058	412067	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_013511	ACAAA	2	10	433063	433072	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_013511	TTAAT	2	10	435824	435833	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013511	TAAAA	2	10	435921	435930	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013511	AATTA	2	10	437103	437112	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013511	ATTTT	2	10	449016	449025	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013511	ATAAA	2	10	449112	449121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013511	TTTTA	2	10	449136	449145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013511	TTACA	2	10	456203	456212	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_013511	TAAAA	2	10	460533	460542	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013511	TAATT	2	10	460556	460565	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013511	TATAA	2	10	461289	461298	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013511	AAAAC	2	10	469532	469541	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_013511	TTTAT	2	10	469585	469594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013511	AGTTA	2	10	490576	490585	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013511	CTCCC	2	10	491573	491582	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
96	NC_013511	CACGA	2	10	492755	492764	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_013511	TAAAA	2	10	507485	507494	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013511	CAAAA	2	10	519226	519235	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_013511	ATTTT	2	10	527481	527490	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013511	TTTTC	2	10	531714	531723	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_013511	AATTA	2	10	537219	537228	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013511	ATAAA	2	10	537260	537269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_013511	AATTA	2	10	537291	537300	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013511	CAAAA	2	10	562144	562153	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_013511	AATTA	2	10	568153	568162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013511	TAAAA	3	15	573616	573630	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013511	TAAAA	2	10	578039	578048	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013511	AATTA	2	10	578605	578614	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013511	AGTTT	2	10	579182	579191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013511	ATTAA	2	10	588752	588761	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013511	GTTTT	2	10	591354	591363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013511	TATAA	2	10	593197	593206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013511	ATTTT	2	10	598735	598744	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013511	ATTTG	2	10	599279	599288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013511	ATTTA	2	10	599638	599647	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013511	TTTAA	2	10	610620	610629	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013511	GAAAA	2	10	612879	612888	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013511	ATTAT	2	10	623728	623737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013511	ATTAT	2	10	626501	626510	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_013511	ATTAT	2	10	626621	626630	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013511	GCAAT	2	10	627210	627219	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_013511	GAACT	2	10	628111	628120	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013511	CAAAT	2	10	628687	628696	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_013511	AAAAT	2	10	629128	629137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013511	CATGC	2	10	632485	632494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
126	NC_013511	TGCAA	2	10	632784	632793	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_013511	CTTTG	2	10	633406	633415	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013511	TTATT	2	10	644577	644586	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013511	TTTTA	2	10	660371	660380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.