MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Edwardsiella tarda EIB202 plasmid pEIB202

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013509	CGTGA	2	10	4659	4668	20 %	20 %	40 %	20 %	268593657
2	NC_013509	CCCAG	2	10	8655	8664	20 %	0 %	20 %	60 %	268593665
3	NC_013509	CCGCA	2	10	12414	12423	20 %	0 %	20 %	60 %	268593668
4	NC_013509	CCGCC	2	10	16257	16266	0 %	0 %	20 %	80 %	268593674
5	NC_013509	CCCTT	2	10	17483	17492	0 %	40 %	0 %	60 %	268593675
6	NC_013509	AAGCG	2	10	22841	22850	40 %	0 %	40 %	20 %	268593681
7	NC_013509	CATGA	2	10	23549	23558	40 %	20 %	20 %	20 %	268593683
8	NC_013509	AAGGC	2	10	24779	24788	40 %	0 %	40 %	20 %	268593685
9	NC_013509	ACACC	2	10	25550	25559	40 %	0 %	0 %	60 %	268593685
10	NC_013509	GCTGG	2	10	26064	26073	0 %	20 %	60 %	20 %	268593686
11	NC_013509	AAAGG	2	10	28686	28695	60 %	0 %	40 %	0 %	268593688
12	NC_013509	ATATT	2	10	29048	29057	40 %	60 %	0 %	0 %	268593688
13	NC_013509	GCTTC	2	10	29427	29436	0 %	40 %	20 %	40 %	268593689
14	NC_013509	TCCCC	2	10	29797	29806	0 %	20 %	0 %	80 %	268593690
15	NC_013509	TGCCC	2	10	29855	29864	0 %	20 %	20 %	60 %	268593690
16	NC_013509	CTCCC	2	10	31039	31048	0 %	20 %	0 %	80 %	268593691
17	NC_013509	AAGGC	2	10	31271	31280	40 %	0 %	40 %	20 %	268593692
18	NC_013509	TTAAA	2	10	34268	34277	60 %	40 %	0 %	0 %	268593696
19	NC_013509	GCGTT	2	10	36191	36200	0 %	40 %	40 %	20 %	268593698
20	NC_013509	GAAAT	2	10	36419	36428	60 %	20 %	20 %	0 %	268593698
21	NC_013509	CGAAG	2	10	36602	36611	40 %	0 %	40 %	20 %	268593699
22	NC_013509	CGCGG	2	10	37407	37416	0 %	0 %	60 %	40 %	268593700
23	NC_013509	GAAGG	2	10	38001	38010	40 %	0 %	60 %	0 %	268593700
24	NC_013509	TTGCC	2	10	38546	38555	0 %	40 %	20 %	40 %	268593702
25	NC_013509	GTTTG	2	10	41572	41581	0 %	60 %	40 %	0 %	268593705
26	NC_013509	CGCGC	2	10	41812	41821	0 %	0 %	40 %	60 %	268593705
27	NC_013509	TTCTT	2	10	42513	42522	0 %	80 %	0 %	20 %	268593705
28	NC_013509	TGGCG	2	10	43109	43118	0 %	20 %	60 %	20 %	268593705

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.