MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Edwardsiella tarda EIB202 plasmid pEIB202

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013509	CGCT	2	8	311	318	0 %	25 %	25 %	50 %	268593653
2	NC_013509	AGGT	2	8	1461	1468	25 %	25 %	50 %	0 %	268593653
3	NC_013509	GGCC	2	8	1818	1825	0 %	0 %	50 %	50 %	268593653
4	NC_013509	CAGC	2	8	1884	1891	25 %	0 %	25 %	50 %	268593653
5	NC_013509	AGCG	2	8	2379	2386	25 %	0 %	50 %	25 %	268593654
6	NC_013509	TTGA	2	8	3016	3023	25 %	50 %	25 %	0 %	268593655
7	NC_013509	GGCG	2	8	3641	3648	0 %	0 %	75 %	25 %	268593655
8	NC_013509	GCTC	2	8	3848	3855	0 %	25 %	25 %	50 %	268593655
9	NC_013509	GCGG	2	8	3874	3881	0 %	0 %	75 %	25 %	268593655
10	NC_013509	AGGT	2	8	5074	5081	25 %	25 %	50 %	0 %	268593658
11	NC_013509	GGTT	2	8	5219	5226	0 %	50 %	50 %	0 %	268593658
12	NC_013509	GTCT	2	8	5628	5635	0 %	50 %	25 %	25 %	268593658
13	NC_013509	TGAG	2	8	5811	5818	25 %	25 %	50 %	0 %	268593659
14	NC_013509	CGGC	2	8	6193	6200	0 %	0 %	50 %	50 %	268593661
15	NC_013509	CCCG	2	8	7955	7962	0 %	0 %	25 %	75 %	268593663
16	NC_013509	TCAG	2	8	8261	8268	25 %	25 %	25 %	25 %	268593665
17	NC_013509	TCGG	2	8	8876	8883	0 %	25 %	50 %	25 %	268593665
18	NC_013509	ATGT	2	8	9929	9936	25 %	50 %	25 %	0 %	268593665
19	NC_013509	CTTT	2	8	10462	10469	0 %	75 %	0 %	25 %	268593665
20	NC_013509	AGGC	2	8	11047	11054	25 %	0 %	50 %	25 %	268593666
21	NC_013509	CCAC	2	8	11563	11570	25 %	0 %	0 %	75 %	268593668
22	NC_013509	AGGC	2	8	12597	12604	25 %	0 %	50 %	25 %	268593668
23	NC_013509	GCCG	2	8	13052	13059	0 %	0 %	50 %	50 %	268593668
24	NC_013509	GCTC	2	8	13306	13313	0 %	25 %	25 %	50 %	268593668
25	NC_013509	TCGG	2	8	13354	13361	0 %	25 %	50 %	25 %	268593668
26	NC_013509	GCCG	2	8	13784	13791	0 %	0 %	50 %	50 %	268593669
27	NC_013509	CGAC	2	8	14125	14132	25 %	0 %	25 %	50 %	268593669
28	NC_013509	ATCA	2	8	14582	14589	50 %	25 %	0 %	25 %	268593670
29	NC_013509	CAAA	2	8	14633	14640	75 %	0 %	0 %	25 %	268593670
30	NC_013509	GAAG	2	8	15318	15325	50 %	0 %	50 %	0 %	268593671
31	NC_013509	AAAC	2	8	15489	15496	75 %	0 %	0 %	25 %	268593672
32	NC_013509	GCGA	2	8	15810	15817	25 %	0 %	50 %	25 %	268593673
33	NC_013509	GGCC	2	8	16462	16469	0 %	0 %	50 %	50 %	268593674
34	NC_013509	CCAA	2	8	17195	17202	50 %	0 %	0 %	50 %	268593675
35	NC_013509	GCCG	2	8	17277	17284	0 %	0 %	50 %	50 %	268593675
36	NC_013509	CAGC	2	8	17914	17921	25 %	0 %	25 %	50 %	268593676
37	NC_013509	CCGG	2	8	18278	18285	0 %	0 %	50 %	50 %	268593676
38	NC_013509	GCCA	2	8	19005	19012	25 %	0 %	25 %	50 %	268593678
39	NC_013509	CTGG	2	8	19121	19128	0 %	25 %	50 %	25 %	268593678
40	NC_013509	CCGG	2	8	19484	19491	0 %	0 %	50 %	50 %	268593679
41	NC_013509	TACC	2	8	19689	19696	25 %	25 %	0 %	50 %	268593679
42	NC_013509	CGAC	2	8	20109	20116	25 %	0 %	25 %	50 %	268593679
43	NC_013509	TCCC	2	8	20736	20743	0 %	25 %	0 %	75 %	268593679
44	NC_013509	CCAG	2	8	22019	22026	25 %	0 %	25 %	50 %	268593681
45	NC_013509	GGAA	2	8	22448	22455	50 %	0 %	50 %	0 %	268593681
46	NC_013509	CGGC	2	8	22553	22560	0 %	0 %	50 %	50 %	268593681
47	NC_013509	AAGC	2	8	23729	23736	50 %	0 %	25 %	25 %	268593683
48	NC_013509	GTCT	2	8	23852	23859	0 %	50 %	25 %	25 %	268593683
49	NC_013509	GCCG	2	8	24148	24155	0 %	0 %	50 %	50 %	268593684
50	NC_013509	CCGT	2	8	24212	24219	0 %	25 %	25 %	50 %	268593684
51	NC_013509	GCCG	2	8	24626	24633	0 %	0 %	50 %	50 %	268593684
52	NC_013509	GCCG	2	8	24813	24820	0 %	0 %	50 %	50 %	268593685
53	NC_013509	GGCC	2	8	25050	25057	0 %	0 %	50 %	50 %	268593685
54	NC_013509	AGCG	2	8	25291	25298	25 %	0 %	50 %	25 %	268593685
55	NC_013509	CGGC	2	8	26043	26050	0 %	0 %	50 %	50 %	268593686
56	NC_013509	GCCC	2	8	26079	26086	0 %	0 %	25 %	75 %	268593686
57	NC_013509	GCAA	2	8	26103	26110	50 %	0 %	25 %	25 %	268593686
58	NC_013509	CTGG	2	8	27394	27401	0 %	25 %	50 %	25 %	268593687
59	NC_013509	GGCA	2	8	27416	27423	25 %	0 %	50 %	25 %	268593687
60	NC_013509	GGCA	2	8	27827	27834	25 %	0 %	50 %	25 %	268593688
61	NC_013509	CCTG	2	8	27993	28000	0 %	25 %	25 %	50 %	268593688
62	NC_013509	TTGC	2	8	28008	28015	0 %	50 %	25 %	25 %	268593688
63	NC_013509	AAGC	2	8	28041	28048	50 %	0 %	25 %	25 %	268593688
64	NC_013509	CCAT	2	8	28068	28075	25 %	25 %	0 %	50 %	268593688
65	NC_013509	CGGC	2	8	28284	28291	0 %	0 %	50 %	50 %	268593688
66	NC_013509	AGCG	2	8	28372	28379	25 %	0 %	50 %	25 %	268593688
67	NC_013509	CGGC	2	8	28402	28409	0 %	0 %	50 %	50 %	268593688
68	NC_013509	CAGG	2	8	29337	29344	25 %	0 %	50 %	25 %	268593689
69	NC_013509	CACT	2	8	29766	29773	25 %	25 %	0 %	50 %	268593690
70	NC_013509	CCAG	2	8	30679	30686	25 %	0 %	25 %	50 %	268593691
71	NC_013509	CAGA	2	8	31758	31765	50 %	0 %	25 %	25 %	268593692
72	NC_013509	TTTC	2	8	32118	32125	0 %	75 %	0 %	25 %	268593693
73	NC_013509	ACAG	2	8	32288	32295	50 %	0 %	25 %	25 %	268593693
74	NC_013509	CTGC	2	8	32508	32515	0 %	25 %	25 %	50 %	268593693
75	NC_013509	CGAG	2	8	32664	32671	25 %	0 %	50 %	25 %	268593693
76	NC_013509	CAGG	2	8	33338	33345	25 %	0 %	50 %	25 %	268593694
77	NC_013509	TAAT	2	8	33647	33654	50 %	50 %	0 %	0 %	268593695
78	NC_013509	TGTA	2	8	33674	33681	25 %	50 %	25 %	0 %	268593695
79	NC_013509	ATTC	2	8	33772	33779	25 %	50 %	0 %	25 %	268593695
80	NC_013509	ATAA	2	8	34382	34389	75 %	25 %	0 %	0 %	268593696
81	NC_013509	AGAT	2	8	34561	34568	50 %	25 %	25 %	0 %	268593696
82	NC_013509	TCAA	2	8	36077	36084	50 %	25 %	0 %	25 %	268593698
83	NC_013509	CTGA	2	8	36708	36715	25 %	25 %	25 %	25 %	268593699
84	NC_013509	AGCG	2	8	36717	36724	25 %	0 %	50 %	25 %	268593699
85	NC_013509	CGGC	2	8	37524	37531	0 %	0 %	50 %	50 %	268593700
86	NC_013509	CTGA	2	8	38111	38118	25 %	25 %	25 %	25 %	268593701
87	NC_013509	ATTG	2	8	38559	38566	25 %	50 %	25 %	0 %	268593702
88	NC_013509	ATGG	2	8	38580	38587	25 %	25 %	50 %	0 %	268593702
89	NC_013509	GGCT	2	8	39282	39289	0 %	25 %	50 %	25 %	268593703
90	NC_013509	CATA	2	8	39358	39365	50 %	25 %	0 %	25 %	268593703
91	NC_013509	CTGG	2	8	39419	39426	0 %	25 %	50 %	25 %	268593703
92	NC_013509	AGGT	2	8	39938	39945	25 %	25 %	50 %	0 %	268593703
93	NC_013509	GCCA	2	8	40332	40339	25 %	0 %	25 %	50 %	268593703
94	NC_013509	CCTT	2	8	41031	41038	0 %	50 %	0 %	50 %	268593705
95	NC_013509	TGGC	2	8	41262	41269	0 %	25 %	50 %	25 %	268593705
96	NC_013509	CGGC	2	8	41306	41313	0 %	0 %	50 %	50 %	268593705
97	NC_013509	TGGT	2	8	41325	41332	0 %	50 %	50 %	0 %	268593705
98	NC_013509	CTGC	2	8	41344	41351	0 %	25 %	25 %	50 %	268593705
99	NC_013509	TGGC	2	8	41372	41379	0 %	25 %	50 %	25 %	268593705
100	NC_013509	CGGC	2	8	41622	41629	0 %	0 %	50 %	50 %	268593705
101	NC_013509	CGGC	2	8	41737	41744	0 %	0 %	50 %	50 %	268593705
102	NC_013509	CGGC	2	8	41746	41753	0 %	0 %	50 %	50 %	268593705
103	NC_013509	GCTG	2	8	42051	42058	0 %	25 %	50 %	25 %	268593705
104	NC_013509	GGCT	2	8	42090	42097	0 %	25 %	50 %	25 %	268593705
105	NC_013509	TGCT	2	8	42101	42108	0 %	50 %	25 %	25 %	268593705
106	NC_013509	TGAT	2	8	42596	42603	25 %	50 %	25 %	0 %	268593705
107	NC_013509	GCCG	2	8	43310	43317	0 %	0 %	50 %	50 %	268593705

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.