MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Edwardsiella tarda EIB202 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013508	CAGTGC	2	12	35516	35527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013508	CCATCT	2	12	44165	44176	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013508	CGATGT	2	12	144676	144687	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013508	TAAGAC	2	12	174021	174032	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013508	TTAACA	2	12	175758	175769	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_013508	TAAGAC	2	12	209407	209418	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013508	CACGAT	2	12	239304	239315	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013508	TCAGGA	2	12	244902	244913	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_013508	TTTTCA	2	12	256516	256527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013508	CAGATA	2	12	282355	282366	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_013508	TTAAAT	2	12	289008	289019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013508	CAGTGT	2	12	353657	353668	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013508	ATCGCG	2	12	388294	388305	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013508	TAACCC	12	72	401761	401832	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013508	CGGCGC	2	12	412800	412811	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013508	GTATCC	2	12	415663	415674	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013508	ACGCAG	2	12	419316	419327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013508	TTTACC	2	12	458611	458622	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013508	GAAAAA	2	12	498981	498992	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013508	TAGATT	2	12	516133	516144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013508	GATAGC	2	12	522289	522300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_013508	TTTTTG	2	12	537542	537553	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013508	ATATGT	2	12	565661	565672	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013508	TTATTT	2	12	572877	572888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013508	ACGTGT	2	12	588797	588808	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_013508	TAAGAC	2	12	605767	605778	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013508	ATTTAA	2	12	649207	649218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013508	CGGCGT	2	12	675963	675974	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_013508	TTTATA	2	12	690746	690757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013508	ACAATG	2	12	738430	738441	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_013508	CCGCAG	2	12	786956	786967	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013508	GCGCTG	2	12	787160	787171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013508	TTTAAT	2	12	793561	793572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013508	TGGGTG	2	12	793580	793591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013508	ATGTAA	2	12	809132	809143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013508	CGTCGC	2	12	871822	871833	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013508	AGCGCG	2	12	878145	878156	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_013508	ACGCTG	2	12	925458	925469	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_013508	GGCTTT	2	12	948615	948626	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013508	TTATTT	2	12	973050	973061	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013508	GAATAT	2	12	991068	991079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013508	GATAAC	2	12	991566	991577	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013508	GCCGTC	2	12	1037211	1037222	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013508	CAGAGC	2	12	1045722	1045733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_013508	GCGCCG	2	12	1057627	1057638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_013508	CTTAAA	2	12	1133956	1133967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_013508	GCCTTC	2	12	1155104	1155115	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
48	NC_013508	CTTTTT	2	12	1219512	1219523	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013508	CTCTCC	2	12	1231294	1231305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_013508	GCGAGG	2	12	1262284	1262295	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_013508	ACGGCC	2	12	1273468	1273479	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
52	NC_013508	ATAGGA	2	12	1277707	1277718	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013508	CAACGG	2	12	1318489	1318500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013508	GCGTCG	2	12	1346747	1346758	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013508	TTTCCC	8	48	1398520	1398567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013508	CCCTAT	2	12	1410689	1410700	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_013508	CTTGCC	2	12	1410796	1410807	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013508	ATGTCT	2	12	1411319	1411330	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013508	CGGCGC	2	12	1435865	1435876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013508	TGTGGG	2	12	1441790	1441801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013508	GATGGC	2	12	1441965	1441976	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013508	TCGCTC	2	12	1473773	1473784	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_013508	TAAAAA	2	12	1474071	1474082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013508	CCCTCC	2	12	1480961	1480972	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
65	NC_013508	GATTTT	2	12	1481098	1481109	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013508	GGGGGA	2	12	1482850	1482861	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013508	AACATA	2	12	1546637	1546648	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013508	GGGCGC	2	12	1587012	1587023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_013508	TGATAA	2	12	1595801	1595812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013508	TTATTT	2	12	1620954	1620965	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013508	ACGATG	2	12	1644726	1644737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013508	ATTACA	4	24	1697120	1697143	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013508	TAATTA	2	12	1708587	1708598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013508	GGGAGA	2	12	1726216	1726227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013508	GTCACA	2	12	1760100	1760111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_013508	ATCGGC	2	12	1772041	1772052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013508	ATCTGA	2	12	1774018	1774029	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_013508	GCGCCT	2	12	1774507	1774518	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
79	NC_013508	GGCGCT	2	12	1785697	1785708	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_013508	ATTACC	2	12	1792890	1792901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013508	CGGACG	2	12	1792949	1792960	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013508	CGTAGG	2	12	1818475	1818486	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_013508	TGAATA	2	12	1850061	1850072	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013508	GAAAAT	2	12	1850262	1850273	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013508	CGCTGA	2	12	1851238	1851249	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013508	GACATC	2	12	1870218	1870229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013508	GGCGCC	2	12	1893044	1893055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013508	CGCGGT	2	12	1903539	1903550	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_013508	GTCAAG	2	12	1918726	1918737	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_013508	ACGTGC	2	12	1925206	1925217	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013508	AATAAA	2	12	1932628	1932639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013508	ATCCAC	2	12	1933361	1933372	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_013508	ATAGCA	2	12	1942714	1942725	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_013508	CCGGCC	2	12	1987747	1987758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_013508	GCCTGA	2	12	2002320	2002331	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_013508	CGCGGC	2	12	2007134	2007145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_013508	GAGGCA	12	72	2012177	2012248	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_013508	TAAATT	2	12	2023690	2023701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013508	TAATCC	2	12	2032789	2032800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_013508	CCTGTT	2	12	2071657	2071668	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_013508	ATATTG	2	12	2071711	2071722	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013508	CGTCGC	2	12	2073668	2073679	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013508	GCTATG	2	12	2092514	2092525	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013508	GCGCTC	2	12	2094808	2094819	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_013508	GCCGCA	2	12	2125324	2125335	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_013508	CGGATT	2	12	2152955	2152966	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_013508	GACGTC	2	12	2153971	2153982	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_013508	GCCCTT	2	12	2219430	2219441	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013508	ATCAAA	2	12	2231754	2231765	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_013508	CCGCGC	2	12	2248171	2248182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_013508	CACGCC	2	12	2265939	2265950	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_013508	GTTATC	2	12	2280561	2280572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_013508	TACGCC	2	12	2289759	2289770	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013508	TATTTT	2	12	2369129	2369140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013508	ATTTAA	2	12	2373909	2373920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013508	TAAAAT	2	12	2375524	2375535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013508	ATCGCC	2	12	2376121	2376132	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013508	CCCCCT	2	12	2376179	2376190	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
119	NC_013508	CGTCAC	2	12	2384100	2384111	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
120	NC_013508	GCCGAC	2	12	2389739	2389750	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_013508	GGCGCG	2	12	2414756	2414767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_013508	TCCGGA	2	12	2429661	2429672	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_013508	GGCGCC	2	12	2465335	2465346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_013508	CTGACG	2	12	2485879	2485890	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_013508	TGAGAG	2	12	2495252	2495263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013508	AAATCC	2	12	2515174	2515185	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013508	TCGGCG	2	12	2551015	2551026	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_013508	ACCATT	2	12	2554369	2554380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_013508	ATTATC	2	12	2591051	2591062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_013508	CAGAAA	2	12	2604356	2604367	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_013508	GACTGG	2	12	2619740	2619751	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_013508	GGCGCA	2	12	2639179	2639190	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_013508	GCGCGG	2	12	2653964	2653975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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139	NC_013508	CGGCGC	2	12	2750044	2750055	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_013508	ATCACC	2	12	2810165	2810176	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_013508	TTAAAT	2	12	2816485	2816496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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146	NC_013508	TAGTCA	2	12	2915143	2915154	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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151	NC_013508	ACCATA	2	12	3007720	3007731	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013508	TTATCG	2	12	3031042	3031053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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154	NC_013508	TTCCTC	2	12	3081837	3081848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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157	NC_013508	ATTATA	2	12	3133268	3133279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_013508	TTTATC	2	12	3183521	3183532	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
159	NC_013508	AGATAA	2	12	3202629	3202640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_013508	GGCGGG	4	24	3290859	3290882	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_013508	CGCAGG	2	12	3297852	3297863	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_013508	CGCCCG	2	12	3308948	3308959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.