MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	TAATT	2	10	805	814	40 %	60 %	0 %	0 %	268318539
2	NC_013505	TAAAT	2	10	1336	1345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	CCGAT	2	10	1776	1785	20 %	20 %	20 %	40 %	268318540
4	NC_013505	TAATC	2	10	2857	2866	40 %	40 %	0 %	20 %	268318541
5	NC_013505	CAGAT	2	10	3643	3652	40 %	20 %	20 %	20 %	268318541
6	NC_013505	TGAAT	2	10	4741	4750	40 %	40 %	20 %	0 %	268318542
7	NC_013505	AAATT	2	10	5577	5586	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013505	ACTAT	2	10	6341	6350	40 %	40 %	0 %	20 %	268318543
9	NC_013505	TTTAG	2	10	7238	7247	20 %	60 %	20 %	0 %	268318544
10	NC_013505	TAGTA	2	10	9619	9628	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013505	AGGTA	2	10	9729	9738	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013505	ACTTA	2	10	13011	13020	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_013505	TAAAG	2	10	13691	13700	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	AAAAT	2	10	13951	13960	80 %	20 %	0 %	0 %	268318551
15	NC_013505	AATTT	2	10	14325	14334	40 %	60 %	0 %	0 %	268318551
16	NC_013505	AAACT	2	10	14754	14763	60 %	20 %	0 %	20 %	268318551
17	NC_013505	CAAAA	2	10	15041	15050	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013505	GAAAA	2	10	15280	15289	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013505	AGAAA	2	10	15600	15609	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013505	GGCAA	2	10	16234	16243	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_013505	GTTAA	2	10	16740	16749	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013505	CGTCT	2	10	17000	17009	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_013505	ACAAA	2	10	17046	17055	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013505	AACTA	2	10	17677	17686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_013505	TTGCA	2	10	17798	17807	20 %	40 %	20 %	20 %	268318553
26	NC_013505	CTAAA	2	10	18060	18069	60 %	20 %	0 %	20 %	268318554
27	NC_013505	TTTTC	2	10	18075	18084	0 %	80 %	0 %	20 %	268318554
28	NC_013505	TAAAA	2	10	18194	18203	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013505	ATTTT	2	10	18364	18373	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013505	TAAGT	2	10	18440	18449	40 %	40 %	20 %	0 %	268318555
31	NC_013505	AAAAT	2	10	18590	18599	80 %	20 %	0 %	0 %	268318555
32	NC_013505	GCATT	2	10	22914	22923	20 %	40 %	20 %	20 %	268318558
33	NC_013505	GATAT	2	10	23595	23604	40 %	40 %	20 %	0 %	268318559

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.