MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	CTAA	2	8	226	233	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_013505	TGAA	2	8	350	357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	TAAA	2	8	1068	1075	75 %	25 %	0 %	0 %	268318539
4	NC_013505	TATT	2	8	1199	1206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013505	AAAT	2	8	1372	1379	75 %	25 %	0 %	0 %	268318540
6	NC_013505	TAAA	2	8	1985	1992	75 %	25 %	0 %	0 %	268318540
7	NC_013505	ATTT	2	8	2119	2126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013505	TAAT	2	8	2641	2648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013505	AATT	2	8	3381	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	268318541
10	NC_013505	ATTA	2	8	3853	3860	50 %	50 %	0 %	0 %	268318541
11	NC_013505	AAAT	2	8	3930	3937	75 %	25 %	0 %	0 %	268318541
12	NC_013505	TAGT	2	8	4962	4969	25 %	50 %	25 %	0 %	268318542
13	NC_013505	TATT	2	8	5010	5017	25 %	75 %	0 %	0 %	268318542
14	NC_013505	AATG	2	8	5555	5562	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013505	ATTT	2	8	5909	5916	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013505	ATTT	2	8	6179	6186	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013505	CTTA	2	8	6372	6379	25 %	50 %	0 %	25 %	268318543
18	NC_013505	CAAC	2	8	6931	6938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013505	ATTA	2	8	6988	6995	50 %	50 %	0 %	0 %	268318544
20	NC_013505	TTAA	2	8	7040	7047	50 %	50 %	0 %	0 %	268318544
21	NC_013505	GAAC	2	8	7388	7395	50 %	0 %	25 %	25 %	268318544
22	NC_013505	TAAC	2	8	7443	7450	50 %	25 %	0 %	25 %	268318544
23	NC_013505	AGAT	2	8	8423	8430	50 %	25 %	25 %	0 %	268318545
24	NC_013505	TTTA	2	8	8535	8542	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013505	ATTT	2	8	8695	8702	25 %	75 %	0 %	0 %	268318546
26	NC_013505	TAAA	2	8	8713	8720	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
27	NC_013505	AAAT	2	8	8752	8759	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
28	NC_013505	AATA	2	8	8955	8962	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
29	NC_013505	AATC	2	8	9702	9709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013505	AAGA	2	8	9830	9837	75 %	0 %	25 %	0 %	268318547
31	NC_013505	TTTA	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	268318547
32	NC_013505	TAAT	2	8	10259	10266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013505	CTAT	2	8	10465	10472	25 %	50 %	0 %	25 %	268318548
34	NC_013505	ATTA	2	8	10586	10593	50 %	50 %	0 %	0 %	268318548
35	NC_013505	GAAA	2	8	10838	10845	75 %	0 %	25 %	0 %	268318548
36	NC_013505	GAAA	2	8	11502	11509	75 %	0 %	25 %	0 %	268318549
37	NC_013505	ACTT	2	8	11609	11616	25 %	50 %	0 %	25 %	268318549
38	NC_013505	AAGA	2	8	11679	11686	75 %	0 %	25 %	0 %	268318549
39	NC_013505	TAAA	2	8	11945	11952	75 %	25 %	0 %	0 %	268318549
40	NC_013505	CTTT	2	8	12215	12222	0 %	75 %	0 %	25 %	268318549
41	NC_013505	TATT	2	8	12336	12343	25 %	75 %	0 %	0 %	268318550
42	NC_013505	TGGT	2	8	12653	12660	0 %	50 %	50 %	0 %	268318550
43	NC_013505	AAGA	2	8	12675	12682	75 %	0 %	25 %	0 %	268318550
44	NC_013505	TAGA	2	8	12893	12900	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013505	AAAC	2	8	13194	13201	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_013505	TATT	2	8	13285	13292	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013505	AATC	2	8	13477	13484	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_013505	CTAA	2	8	13765	13772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013505	ACAT	2	8	14296	14303	50 %	25 %	0 %	25 %	268318551
50	NC_013505	AGAA	2	8	14312	14319	75 %	0 %	25 %	0 %	268318551
51	NC_013505	AATT	2	8	14653	14660	50 %	50 %	0 %	0 %	268318551
52	NC_013505	CTTT	2	8	14739	14746	0 %	75 %	0 %	25 %	268318551
53	NC_013505	CTTT	2	8	14847	14854	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_013505	TTGA	2	8	15244	15251	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013505	TAAG	2	8	15716	15723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013505	AAGA	2	8	15870	15877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013505	TGAT	2	8	16063	16070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013505	TAGA	2	8	16102	16109	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013505	ATAG	2	8	16611	16618	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013505	TTAC	2	8	16662	16669	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013505	TAAA	2	8	16790	16797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013505	TTCT	2	8	17443	17450	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013505	TCGA	2	8	18256	18263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013505	TCTT	2	8	18302	18309	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_013505	ATTT	2	8	18870	18877	25 %	75 %	0 %	0 %	268318555
66	NC_013505	TAAA	2	8	18927	18934	75 %	25 %	0 %	0 %	268318555
67	NC_013505	TAAA	2	8	19522	19529	75 %	25 %	0 %	0 %	268318555
68	NC_013505	GTTA	2	8	19675	19682	25 %	50 %	25 %	0 %	268318555
69	NC_013505	TTTA	2	8	20305	20312	25 %	75 %	0 %	0 %	268318556
70	NC_013505	GTTG	2	8	20489	20496	0 %	50 %	50 %	0 %	268318556
71	NC_013505	ACTG	2	8	20729	20736	25 %	25 %	25 %	25 %	268318556
72	NC_013505	TTGA	2	8	21213	21220	25 %	50 %	25 %	0 %	268318556
73	NC_013505	CAAA	2	8	21531	21538	75 %	0 %	0 %	25 %	268318556
74	NC_013505	TAAT	2	8	21582	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	268318556
75	NC_013505	TTTC	2	8	22158	22165	0 %	75 %	0 %	25 %	268318557
76	NC_013505	ATAG	2	8	22175	22182	50 %	25 %	25 %	0 %	268318557
77	NC_013505	CTTA	2	8	22403	22410	25 %	50 %	0 %	25 %	268318557
78	NC_013505	ATTT	2	8	22818	22825	25 %	75 %	0 %	0 %	268318558
79	NC_013505	GTTT	2	8	22950	22957	0 %	75 %	25 %	0 %	268318558
80	NC_013505	CAAA	2	8	24097	24104	75 %	0 %	0 %	25 %	268318559
81	NC_013505	ATTC	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	268318559
82	NC_013505	AATT	2	8	24301	24308	50 %	50 %	0 %	0 %	268318559
83	NC_013505	TGTT	2	8	24803	24810	0 %	75 %	25 %	0 %	268318560
84	NC_013505	TTTC	2	8	25421	25428	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_013505	AAAG	2	8	25590	25597	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013505	GTAA	2	8	25621	25628	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.