MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	TAAA	2	8	1068	1075	75 %	25 %	0 %	0 %	268318539
2	NC_013505	AAAT	2	8	1372	1379	75 %	25 %	0 %	0 %	268318540
3	NC_013505	TAAA	2	8	1985	1992	75 %	25 %	0 %	0 %	268318540
4	NC_013505	AATT	2	8	3381	3388	50 %	50 %	0 %	0 %	268318541
5	NC_013505	ATTA	2	8	3853	3860	50 %	50 %	0 %	0 %	268318541
6	NC_013505	AAAT	2	8	3930	3937	75 %	25 %	0 %	0 %	268318541
7	NC_013505	TAGT	2	8	4962	4969	25 %	50 %	25 %	0 %	268318542
8	NC_013505	TATT	2	8	5010	5017	25 %	75 %	0 %	0 %	268318542
9	NC_013505	CTTA	2	8	6372	6379	25 %	50 %	0 %	25 %	268318543
10	NC_013505	ATTA	2	8	6988	6995	50 %	50 %	0 %	0 %	268318544
11	NC_013505	TTAA	2	8	7040	7047	50 %	50 %	0 %	0 %	268318544
12	NC_013505	GAAC	2	8	7388	7395	50 %	0 %	25 %	25 %	268318544
13	NC_013505	TAAC	2	8	7443	7450	50 %	25 %	0 %	25 %	268318544
14	NC_013505	AGAT	2	8	8423	8430	50 %	25 %	25 %	0 %	268318545
15	NC_013505	ATTT	2	8	8695	8702	25 %	75 %	0 %	0 %	268318546
16	NC_013505	TAAA	2	8	8713	8720	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
17	NC_013505	AAAT	2	8	8752	8759	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
18	NC_013505	AATA	2	8	8955	8962	75 %	25 %	0 %	0 %	268318546
19	NC_013505	AAGA	2	8	9830	9837	75 %	0 %	25 %	0 %	268318547
20	NC_013505	TTTA	2	8	9845	9852	25 %	75 %	0 %	0 %	268318547
21	NC_013505	CTAT	2	8	10465	10472	25 %	50 %	0 %	25 %	268318548
22	NC_013505	ATTA	2	8	10586	10593	50 %	50 %	0 %	0 %	268318548
23	NC_013505	GAAA	2	8	10838	10845	75 %	0 %	25 %	0 %	268318548
24	NC_013505	GAAA	2	8	11502	11509	75 %	0 %	25 %	0 %	268318549
25	NC_013505	ACTT	2	8	11609	11616	25 %	50 %	0 %	25 %	268318549
26	NC_013505	AAGA	2	8	11679	11686	75 %	0 %	25 %	0 %	268318549
27	NC_013505	TAAA	2	8	11945	11952	75 %	25 %	0 %	0 %	268318549
28	NC_013505	CTTT	2	8	12215	12222	0 %	75 %	0 %	25 %	268318549
29	NC_013505	TATT	2	8	12336	12343	25 %	75 %	0 %	0 %	268318550
30	NC_013505	TGGT	2	8	12653	12660	0 %	50 %	50 %	0 %	268318550
31	NC_013505	AAGA	2	8	12675	12682	75 %	0 %	25 %	0 %	268318550
32	NC_013505	ACAT	2	8	14296	14303	50 %	25 %	0 %	25 %	268318551
33	NC_013505	AGAA	2	8	14312	14319	75 %	0 %	25 %	0 %	268318551
34	NC_013505	AATT	2	8	14653	14660	50 %	50 %	0 %	0 %	268318551
35	NC_013505	CTTT	2	8	14739	14746	0 %	75 %	0 %	25 %	268318551
36	NC_013505	ATTT	2	8	18870	18877	25 %	75 %	0 %	0 %	268318555
37	NC_013505	TAAA	2	8	18927	18934	75 %	25 %	0 %	0 %	268318555
38	NC_013505	TAAA	2	8	19522	19529	75 %	25 %	0 %	0 %	268318555
39	NC_013505	GTTA	2	8	19675	19682	25 %	50 %	25 %	0 %	268318555
40	NC_013505	TTTA	2	8	20305	20312	25 %	75 %	0 %	0 %	268318556
41	NC_013505	GTTG	2	8	20489	20496	0 %	50 %	50 %	0 %	268318556
42	NC_013505	ACTG	2	8	20729	20736	25 %	25 %	25 %	25 %	268318556
43	NC_013505	TTGA	2	8	21213	21220	25 %	50 %	25 %	0 %	268318556
44	NC_013505	CAAA	2	8	21531	21538	75 %	0 %	0 %	25 %	268318556
45	NC_013505	TAAT	2	8	21582	21589	50 %	50 %	0 %	0 %	268318556
46	NC_013505	TTTC	2	8	22158	22165	0 %	75 %	0 %	25 %	268318557
47	NC_013505	ATAG	2	8	22175	22182	50 %	25 %	25 %	0 %	268318557
48	NC_013505	CTTA	2	8	22403	22410	25 %	50 %	0 %	25 %	268318557
49	NC_013505	ATTT	2	8	22818	22825	25 %	75 %	0 %	0 %	268318558
50	NC_013505	GTTT	2	8	22950	22957	0 %	75 %	25 %	0 %	268318558
51	NC_013505	CAAA	2	8	24097	24104	75 %	0 %	0 %	25 %	268318559
52	NC_013505	ATTC	2	8	24133	24140	25 %	50 %	0 %	25 %	268318559
53	NC_013505	AATT	2	8	24301	24308	50 %	50 %	0 %	0 %	268318559
54	NC_013505	TGTT	2	8	24803	24810	0 %	75 %	25 %	0 %	268318560

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.