MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	ACT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013505	AGA	2	6	95	100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	CAT	2	6	141	146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_013505	ATC	2	6	273	278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013505	ATT	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013505	GCT	2	6	433	438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_013505	ACA	3	9	477	485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_013505	GCA	2	6	522	527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013505	TAG	2	6	566	571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013505	AGA	3	9	633	641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013505	ATA	2	6	653	658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013505	TCA	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_013505	ATG	2	6	734	739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	AAG	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318539
15	NC_013505	AAG	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318539
16	NC_013505	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318539
17	NC_013505	GTA	2	6	1120	1125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013505	TAG	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013505	TTA	2	6	1402	1407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
20	NC_013505	ACA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318540
21	NC_013505	GTA	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
22	NC_013505	TGA	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
23	NC_013505	TGA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
24	NC_013505	CTC	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318540
25	NC_013505	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318540
26	NC_013505	AAT	2	6	1821	1826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318540
27	NC_013505	AAC	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318540
28	NC_013505	ATT	2	6	1890	1895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
29	NC_013505	GAA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318540
30	NC_013505	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
31	NC_013505	AAG	2	6	2012	2017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013505	CTT	2	6	2040	2045	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_013505	AAT	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013505	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013505	TAA	2	6	2455	2460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013505	TCT	2	6	2593	2598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013505	GAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
38	NC_013505	TGG	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318541
39	NC_013505	ATG	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318541
40	NC_013505	GAA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
41	NC_013505	AAG	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
42	NC_013505	CAC	2	6	3081	3086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318541
43	NC_013505	CAA	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318541
44	NC_013505	AAT	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318541
45	NC_013505	GTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318541
46	NC_013505	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318541
47	NC_013505	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
48	NC_013505	GAA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
49	NC_013505	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318541
50	NC_013505	GAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
51	NC_013505	ACT	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318541
52	NC_013505	ACT	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318541
53	NC_013505	TAT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
54	NC_013505	ATT	2	6	3695	3700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
55	NC_013505	ATT	2	6	3764	3769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
56	NC_013505	GCT	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318541
57	NC_013505	GAT	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318541
58	NC_013505	AGA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
59	NC_013505	TTA	2	6	4021	4026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013505	AAT	2	6	4057	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013505	AGT	2	6	4077	4082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013505	GTA	2	6	4088	4093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013505	AGG	2	6	4185	4190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013505	ATT	2	6	4225	4230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013505	TAA	2	6	4250	4255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013505	ATT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013505	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
68	NC_013505	AGA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
69	NC_013505	ATT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
70	NC_013505	TAA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318542
71	NC_013505	AGA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
72	NC_013505	AGA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
73	NC_013505	ATG	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318542
74	NC_013505	ATT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
75	NC_013505	TAC	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318542
76	NC_013505	GAT	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318542
77	NC_013505	TAA	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318542
78	NC_013505	AGG	2	6	5268	5273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013505	TGG	2	6	5290	5295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013505	CTT	2	6	5311	5316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013505	ATA	2	6	5358	5363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013505	CTT	2	6	5414	5419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013505	GAA	4	12	5492	5503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013505	AAT	2	6	5510	5515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013505	GTA	2	6	5523	5528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013505	TTA	2	6	5610	5615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013505	ATT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013505	ATA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013505	TTG	2	6	5746	5751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013505	TCT	2	6	5769	5774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013505	TAA	3	9	5783	5791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013505	TTA	2	6	5799	5804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013505	TAT	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013505	TGT	2	6	5836	5841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013505	ATT	2	6	5881	5886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013505	TAC	2	6	6122	6127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_013505	GAG	2	6	6155	6160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_013505	AAT	2	6	6192	6197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_013505	AAG	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318543
100	NC_013505	TAC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318543
101	NC_013505	CTT	2	6	6596	6601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318543
102	NC_013505	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318543
103	NC_013505	TAC	2	6	6637	6642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318543
104	NC_013505	GAA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318543
105	NC_013505	TAG	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318543
106	NC_013505	CTA	2	6	6888	6893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_013505	GTA	2	6	6945	6950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_013505	AAT	2	6	7049	7054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318544
109	NC_013505	TAC	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318544
110	NC_013505	AGA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318544
111	NC_013505	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318544
112	NC_013505	AAG	2	6	7658	7663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
113	NC_013505	GAT	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318545
114	NC_013505	TTA	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
115	NC_013505	AGG	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318545
116	NC_013505	CAG	2	6	7745	7750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318545
117	NC_013505	TAA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
118	NC_013505	AGA	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
119	NC_013505	TAA	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
120	NC_013505	GAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
121	NC_013505	TTA	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
122	NC_013505	GAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
123	NC_013505	AGC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318545
124	NC_013505	ATT	2	6	8282	8287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
125	NC_013505	AAT	2	6	8314	8319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
126	NC_013505	AAT	2	6	8555	8560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013505	GTA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013505	TTC	2	6	8644	8649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318546
129	NC_013505	AAT	2	6	8668	8673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
130	NC_013505	AGT	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
131	NC_013505	ATA	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
132	NC_013505	TCA	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318546
133	NC_013505	ATA	2	6	8946	8951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
134	NC_013505	ATA	2	6	8987	8992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
135	NC_013505	TGA	2	6	9014	9019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
136	NC_013505	GTA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
137	NC_013505	AAT	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.