MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 255

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	AAG	2	6	890	895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318539
2	NC_013505	AAG	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318539
3	NC_013505	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318539
4	NC_013505	TTA	2	6	1402	1407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
5	NC_013505	ACA	2	6	1556	1561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318540
6	NC_013505	GTA	2	6	1579	1584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
7	NC_013505	TGA	2	6	1608	1613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
8	NC_013505	TGA	2	6	1670	1675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318540
9	NC_013505	CTC	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318540
10	NC_013505	AGA	2	6	1788	1793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318540
11	NC_013505	AAT	2	6	1821	1826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318540
12	NC_013505	AAC	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318540
13	NC_013505	ATT	2	6	1890	1895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
14	NC_013505	GAA	2	6	1897	1902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318540
15	NC_013505	ATT	2	6	1972	1977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318540
16	NC_013505	GAA	2	6	2681	2686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
17	NC_013505	TGG	2	6	2816	2821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318541
18	NC_013505	ATG	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318541
19	NC_013505	GAA	2	6	2956	2961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
20	NC_013505	AAG	2	6	2991	2996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
21	NC_013505	CAC	2	6	3081	3086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318541
22	NC_013505	CAA	2	6	3090	3095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318541
23	NC_013505	AAT	2	6	3104	3109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318541
24	NC_013505	GTT	2	6	3175	3180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318541
25	NC_013505	CAG	2	6	3306	3311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318541
26	NC_013505	ATT	2	6	3354	3359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
27	NC_013505	GAA	2	6	3375	3380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
28	NC_013505	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318541
29	NC_013505	GAA	2	6	3455	3460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
30	NC_013505	ACT	2	6	3461	3466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318541
31	NC_013505	ACT	2	6	3554	3559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318541
32	NC_013505	TAT	2	6	3566	3571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
33	NC_013505	ATT	2	6	3695	3700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
34	NC_013505	ATT	2	6	3764	3769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318541
35	NC_013505	GCT	2	6	3803	3808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318541
36	NC_013505	GAT	2	6	3899	3904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318541
37	NC_013505	AGA	2	6	3976	3981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318541
38	NC_013505	ATT	2	6	4533	4538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
39	NC_013505	AGA	2	6	4573	4578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
40	NC_013505	ATT	2	6	4591	4596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
41	NC_013505	TAA	2	6	4758	4763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318542
42	NC_013505	AGA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
43	NC_013505	AGA	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318542
44	NC_013505	ATG	2	6	4925	4930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318542
45	NC_013505	ATT	2	6	4956	4961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318542
46	NC_013505	TAC	2	6	5087	5092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318542
47	NC_013505	GAT	2	6	5111	5116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318542
48	NC_013505	TAA	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318542
49	NC_013505	AAG	2	6	6403	6408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318543
50	NC_013505	TAC	2	6	6523	6528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318543
51	NC_013505	CTT	2	6	6596	6601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318543
52	NC_013505	TGA	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318543
53	NC_013505	TAC	2	6	6637	6642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318543
54	NC_013505	GAA	2	6	6663	6668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318543
55	NC_013505	TAG	2	6	6859	6864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318543
56	NC_013505	AAT	2	6	7049	7054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318544
57	NC_013505	TAC	2	6	7135	7140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318544
58	NC_013505	AGA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318544
59	NC_013505	CAA	2	6	7163	7168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318544
60	NC_013505	AAG	2	6	7658	7663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
61	NC_013505	GAT	2	6	7672	7677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318545
62	NC_013505	TTA	2	6	7678	7683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
63	NC_013505	AGG	2	6	7728	7733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318545
64	NC_013505	CAG	2	6	7745	7750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318545
65	NC_013505	TAA	2	6	7761	7766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
66	NC_013505	AGA	2	6	7776	7781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
67	NC_013505	TAA	2	6	7863	7868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
68	NC_013505	GAA	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
69	NC_013505	TTA	2	6	8006	8011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
70	NC_013505	GAA	2	6	8056	8061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318545
71	NC_013505	AGC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318545
72	NC_013505	ATT	2	6	8282	8287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318545
73	NC_013505	AAT	2	6	8314	8319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318545
74	NC_013505	TTC	2	6	8644	8649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318546
75	NC_013505	AAT	2	6	8668	8673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
76	NC_013505	AGT	2	6	8728	8733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
77	NC_013505	ATA	2	6	8907	8912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
78	NC_013505	TCA	2	6	8927	8932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318546
79	NC_013505	ATA	2	6	8946	8951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
80	NC_013505	ATA	2	6	8987	8992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
81	NC_013505	TGA	2	6	9014	9019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
82	NC_013505	GTA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318546
83	NC_013505	AAT	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318546
84	NC_013505	TAT	2	6	9246	9251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318546
85	NC_013505	ATT	2	6	9290	9295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318546
86	NC_013505	CTT	2	6	9355	9360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318546
87	NC_013505	TAA	2	6	9882	9887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318547
88	NC_013505	TAG	2	6	9912	9917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318547
89	NC_013505	ATT	2	6	9941	9946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318547
90	NC_013505	TGA	2	6	9979	9984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318547
91	NC_013505	TAT	2	6	10019	10024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318547
92	NC_013505	ATT	2	6	10086	10091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318547
93	NC_013505	ATT	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318547
94	NC_013505	TTA	2	6	10152	10157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318547
95	NC_013505	ATG	2	6	10161	10166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318547
96	NC_013505	AAT	2	6	10486	10491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318548
97	NC_013505	GAA	2	6	10521	10526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318548
98	NC_013505	TTA	2	6	10665	10670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318548
99	NC_013505	ACA	2	6	10708	10713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318548
100	NC_013505	TGA	2	6	10725	10730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318548
101	NC_013505	CAT	2	6	11333	11338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318549
102	NC_013505	TTA	2	6	11386	11391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318549
103	NC_013505	CTC	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268318549
104	NC_013505	ATT	2	6	11630	11635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318549
105	NC_013505	TAA	2	6	11691	11696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318549
106	NC_013505	AGA	2	6	11746	11751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318549
107	NC_013505	TGA	2	6	11760	11765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
108	NC_013505	TAG	2	6	11783	11788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
109	NC_013505	TTA	2	6	11810	11815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318549
110	NC_013505	TGA	2	6	11883	11888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
111	NC_013505	ATC	3	9	11907	11915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318549
112	NC_013505	GAT	2	6	12076	12081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
113	NC_013505	GAT	2	6	12097	12102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
114	NC_013505	CAA	2	6	12307	12312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318549
115	NC_013505	TAG	2	6	12325	12330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318549
116	NC_013505	CTA	2	6	12501	12506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318550
117	NC_013505	AAT	2	6	12510	12515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318550
118	NC_013505	AAG	2	6	12550	12555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318550
119	NC_013505	AAG	2	6	13859	13864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318551
120	NC_013505	ATT	2	6	13899	13904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318551
121	NC_013505	TAA	3	9	13919	13927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318551
122	NC_013505	GAT	3	9	14007	14015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318551
123	NC_013505	TCT	2	6	14352	14357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318551
124	NC_013505	TCT	2	6	14367	14372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318551
125	NC_013505	TCT	2	6	14555	14560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318551
126	NC_013505	ATA	2	6	14604	14609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318551
127	NC_013505	CTA	2	6	14696	14701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318551
128	NC_013505	TAA	2	6	14702	14707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318551
129	NC_013505	TTA	2	6	14781	14786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318551
130	NC_013505	TAC	2	6	17144	17149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318552
131	NC_013505	ATG	2	6	17156	17161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318552
132	NC_013505	TCA	2	6	17184	17189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318552
133	NC_013505	GTC	2	6	17230	17235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318552
134	NC_013505	AGC	2	6	17284	17289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318552
135	NC_013505	CTT	2	6	17302	17307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318552
136	NC_013505	TAA	2	6	17402	17407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318552
137	NC_013505	GTA	2	6	17723	17728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318553
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139	NC_013505	AAT	2	6	17789	17794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318553
140	NC_013505	ATT	2	6	17876	17881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318553
141	NC_013505	ATT	2	6	17928	17933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318554
142	NC_013505	AAT	2	6	17947	17952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318554
143	NC_013505	CAA	2	6	17976	17981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318554
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145	NC_013505	TAA	2	6	18526	18531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318555
146	NC_013505	CTT	2	6	18532	18537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318555
147	NC_013505	TCA	2	6	18581	18586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318555
148	NC_013505	CAT	2	6	18600	18605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318555
149	NC_013505	ATT	2	6	18784	18789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318555
150	NC_013505	AAG	2	6	18916	18921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318555
151	NC_013505	TAT	2	6	19009	19014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318555
152	NC_013505	ACA	2	6	19226	19231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318555
153	NC_013505	TAA	2	6	19264	19269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318555
154	NC_013505	CTT	2	6	19408	19413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318555
155	NC_013505	AGC	2	6	19486	19491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318555
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158	NC_013505	ATA	2	6	19618	19623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318555
159	NC_013505	TTA	2	6	19659	19664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318555
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163	NC_013505	TGA	2	6	19757	19762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318555
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165	NC_013505	TTG	2	6	19864	19869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318555
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173	NC_013505	TAT	2	6	20355	20360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318556
174	NC_013505	ATA	3	9	20366	20374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318556
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254	NC_013505	AAT	2	6	25215	25220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318560
255	NC_013505	CAT	2	6	25268	25273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318561

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.