MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 plasmid p9785L

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013505	A	6	6	1073	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	268318539
2	NC_013505	T	6	6	1235	1240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013505	A	7	7	1509	1515	100 %	0 %	0 %	0 %	268318540
4	NC_013505	T	6	6	2052	2057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013505	T	7	7	2124	2130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013505	A	6	6	2649	2654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013505	A	6	6	2936	2941	100 %	0 %	0 %	0 %	268318541
8	NC_013505	A	6	6	3288	3293	100 %	0 %	0 %	0 %	268318541
9	NC_013505	A	6	6	4470	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	268318542
10	NC_013505	T	7	7	4537	4543	0 %	100 %	0 %	0 %	268318542
11	NC_013505	A	6	6	4627	4632	100 %	0 %	0 %	0 %	268318542
12	NC_013505	A	7	7	4981	4987	100 %	0 %	0 %	0 %	268318542
13	NC_013505	T	6	6	5625	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013505	A	6	6	5759	5764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013505	T	7	7	5867	5873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013505	A	6	6	6995	7000	100 %	0 %	0 %	0 %	268318544
17	NC_013505	T	6	6	7149	7154	0 %	100 %	0 %	0 %	268318544
18	NC_013505	A	6	6	7478	7483	100 %	0 %	0 %	0 %	268318544
19	NC_013505	A	6	6	7901	7906	100 %	0 %	0 %	0 %	268318545
20	NC_013505	T	6	6	8252	8257	0 %	100 %	0 %	0 %	268318545
21	NC_013505	T	6	6	8517	8522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013505	T	6	6	8525	8530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013505	T	7	7	8653	8659	0 %	100 %	0 %	0 %	268318546
24	NC_013505	T	6	6	9271	9276	0 %	100 %	0 %	0 %	268318546
25	NC_013505	A	6	6	9808	9813	100 %	0 %	0 %	0 %	268318547
26	NC_013505	A	6	6	10197	10202	100 %	0 %	0 %	0 %	268318547
27	NC_013505	A	7	7	10238	10244	100 %	0 %	0 %	0 %	268318547
28	NC_013505	T	7	7	10310	10316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013505	A	7	7	10425	10431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013505	T	6	6	10789	10794	0 %	100 %	0 %	0 %	268318548
31	NC_013505	T	7	7	10955	10961	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013505	A	7	7	11417	11423	100 %	0 %	0 %	0 %	268318549
33	NC_013505	T	6	6	11713	11718	0 %	100 %	0 %	0 %	268318549
34	NC_013505	A	6	6	11791	11796	100 %	0 %	0 %	0 %	268318549
35	NC_013505	A	6	6	12149	12154	100 %	0 %	0 %	0 %	268318549
36	NC_013505	T	6	6	12813	12818	0 %	100 %	0 %	0 %	268318550
37	NC_013505	T	6	6	12873	12878	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013505	A	7	7	13073	13079	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013505	C	6	6	13081	13086	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_013505	A	6	6	13561	13566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013505	T	6	6	13751	13756	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013505	A	6	6	13871	13876	100 %	0 %	0 %	0 %	268318551
43	NC_013505	T	6	6	14025	14030	0 %	100 %	0 %	0 %	268318551
44	NC_013505	A	7	7	14479	14485	100 %	0 %	0 %	0 %	268318551
45	NC_013505	A	6	6	14489	14494	100 %	0 %	0 %	0 %	268318551
46	NC_013505	A	6	6	14535	14540	100 %	0 %	0 %	0 %	268318551
47	NC_013505	T	6	6	14979	14984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013505	A	7	7	15075	15081	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013505	A	6	6	16398	16403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013505	T	6	6	16704	16709	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013505	A	6	6	16921	16926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013505	T	6	6	17074	17079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013505	A	6	6	17127	17132	100 %	0 %	0 %	0 %	268318552
54	NC_013505	A	6	6	17643	17648	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013505	T	6	6	18170	18175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_013505	A	7	7	18221	18227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013505	T	7	7	18354	18360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013505	A	6	6	18428	18433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013505	T	6	6	18556	18561	0 %	100 %	0 %	0 %	268318555
60	NC_013505	T	6	6	18633	18638	0 %	100 %	0 %	0 %	268318555
61	NC_013505	T	6	6	19043	19048	0 %	100 %	0 %	0 %	268318555
62	NC_013505	T	6	6	20123	20128	0 %	100 %	0 %	0 %	268318556
63	NC_013505	T	6	6	20572	20577	0 %	100 %	0 %	0 %	268318556
64	NC_013505	A	6	6	20836	20841	100 %	0 %	0 %	0 %	268318556
65	NC_013505	T	6	6	20924	20929	0 %	100 %	0 %	0 %	268318556
66	NC_013505	A	7	7	21423	21429	100 %	0 %	0 %	0 %	268318556
67	NC_013505	A	6	6	21452	21457	100 %	0 %	0 %	0 %	268318556
68	NC_013505	T	6	6	21646	21651	0 %	100 %	0 %	0 %	268318557
69	NC_013505	T	6	6	22076	22081	0 %	100 %	0 %	0 %	268318557
70	NC_013505	T	6	6	22304	22309	0 %	100 %	0 %	0 %	268318557
71	NC_013505	A	6	6	22628	22633	100 %	0 %	0 %	0 %	268318558
72	NC_013505	T	6	6	23142	23147	0 %	100 %	0 %	0 %	268318558
73	NC_013505	A	6	6	23282	23287	100 %	0 %	0 %	0 %	268318558
74	NC_013505	T	6	6	23311	23316	0 %	100 %	0 %	0 %	268318558
75	NC_013505	T	6	6	23604	23609	0 %	100 %	0 %	0 %	268318559
76	NC_013505	T	6	6	23692	23697	0 %	100 %	0 %	0 %	268318559
77	NC_013505	A	6	6	24182	24187	100 %	0 %	0 %	0 %	268318559
78	NC_013505	A	6	6	24620	24625	100 %	0 %	0 %	0 %	268318560
79	NC_013505	T	6	6	24809	24814	0 %	100 %	0 %	0 %	268318560
80	NC_013505	A	6	6	25188	25193	100 %	0 %	0 %	0 %	268318560
81	NC_013505	A	6	6	25392	25397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_013505	T	6	6	25551	25556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.