MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	GATTTA	2	12	28588	28599	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013504	TAAAAT	2	12	31530	31541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013504	ATATTT	2	12	38309	38320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013504	CTTTTT	2	12	102071	102082	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_013504	TGGAGG	2	12	103907	103918	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013504	ATAGCT	2	12	165216	165227	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_013504	ATAGCA	2	12	188391	188402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013504	GAAAAA	2	12	264192	264203	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013504	ATTGAT	2	12	267235	267246	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013504	TTTTTA	2	12	270961	270972	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013504	CTTTTT	2	12	276413	276424	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_013504	TTGAGG	2	12	352302	352313	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013504	ATATTA	2	12	404576	404587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013504	ATAAAG	2	12	411419	411430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013504	CGGAGC	2	12	458089	458100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_013504	TTTAAC	2	12	472968	472979	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013504	GGAACT	2	12	480773	480784	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_013504	ATATTT	2	12	506579	506590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013504	TAAAAA	2	12	530347	530358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013504	ATTTAA	2	12	551383	551394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013504	TATATT	2	12	558100	558111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013504	AGGAAT	2	12	609817	609828	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013504	TTTAAG	2	12	627757	627768	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013504	ATTTAT	2	12	800110	800121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013504	GATTTT	2	12	824395	824406	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013504	CAATTA	2	12	832421	832432	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013504	TATCTT	2	12	867726	867737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_013504	TTTTTA	2	12	872876	872887	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013504	AAATTA	2	12	875226	875237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013504	ATTTTA	2	12	918604	918615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013504	GAGTAA	2	12	921471	921482	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013504	ATAATT	2	12	961926	961937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013504	TAAATA	2	12	972834	972845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013504	ACCTCA	2	12	990136	990147	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013504	AAGAAA	2	12	1009476	1009487	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013504	AATAAA	2	12	1013171	1013182	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013504	TAATTA	2	12	1038922	1038933	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013504	TATCTA	2	12	1098440	1098451	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_013504	ATATTA	2	12	1128357	1128368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013504	TAAAAA	2	12	1145946	1145957	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013504	CATATT	2	12	1184869	1184880	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_013504	ATTTCA	2	12	1198627	1198638	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013504	TAAAAA	2	12	1203031	1203042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013504	TTAAGC	2	12	1206669	1206680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013504	TATTTT	2	12	1224052	1224063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013504	TTAAAT	2	12	1283127	1283138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013504	AAATGT	2	12	1313254	1313265	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013504	TTATTT	2	12	1315880	1315891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013504	ATTTTT	2	12	1413456	1413467	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013504	AAAAGA	2	12	1462999	1463010	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013504	TTTTTG	2	12	1471713	1471724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013504	GCTCCG	2	12	1478727	1478738	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_013504	TAATTT	2	12	1488292	1488303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013504	ATGATA	2	12	1490321	1490332	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013504	GCTCCG	2	12	1493177	1493188	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013504	AAAATA	2	12	1518935	1518946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_013504	AAAAGA	2	12	1529443	1529454	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013504	ACTTTA	2	12	1571576	1571587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013504	CATTCA	2	12	1593866	1593877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_013504	ATTTTA	2	12	1617072	1617083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013504	ATTCAT	2	12	1617774	1617785	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013504	AAAAGA	2	12	1630950	1630961	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013504	TACCTT	2	12	1634201	1634212	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013504	GCTCCG	2	12	1660747	1660758	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013504	AATTAA	2	12	1665308	1665319	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013504	ATATCT	2	12	1684288	1684299	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_013504	TACCAT	2	12	1687227	1687238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_013504	ACTAAT	2	12	1687539	1687550	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_013504	GAAATA	2	12	1701209	1701220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013504	TAAGGT	2	12	1726713	1726724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013504	AAACTT	2	12	1755824	1755835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.