MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 1398

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	TTGCA	2	10	5053	5062	20 %	40 %	20 %	20 %	268318566
2	NC_013504	AAGGT	2	10	5905	5914	40 %	20 %	40 %	0 %	268318566
3	NC_013504	ATCAG	2	10	7101	7110	40 %	20 %	20 %	20 %	268318567
4	NC_013504	TTTGA	2	10	10189	10198	20 %	60 %	20 %	0 %	268318571
5	NC_013504	CTAAT	2	10	10628	10637	40 %	40 %	0 %	20 %	268318571
6	NC_013504	AGTGA	2	10	10756	10765	40 %	20 %	40 %	0 %	268318571
7	NC_013504	TATAA	2	10	11045	11054	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013504	AAAAT	2	10	11551	11560	80 %	20 %	0 %	0 %	268318572
9	NC_013504	CTATA	2	10	15004	15013	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_013504	ACTGG	2	10	16876	16885	20 %	20 %	40 %	20 %	268318576
11	NC_013504	TTTTA	2	10	17194	17203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013504	TTTAA	2	10	17504	17513	40 %	60 %	0 %	0 %	268318577
13	NC_013504	TTAGT	2	10	17952	17961	20 %	60 %	20 %	0 %	268318577
14	NC_013504	ACGTA	2	10	19268	19277	40 %	20 %	20 %	20 %	268318577
15	NC_013504	AAAAT	2	10	19411	19420	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013504	GTAGT	2	10	23040	23049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013504	TGAAG	2	10	24238	24247	40 %	20 %	40 %	0 %	268318582
18	NC_013504	ACCAA	2	10	25505	25514	60 %	0 %	0 %	40 %	268318582
19	NC_013504	ACCAA	2	10	25739	25748	60 %	0 %	0 %	40 %	268318582
20	NC_013504	ACCAA	2	10	25973	25982	60 %	0 %	0 %	40 %	268318582
21	NC_013504	AAAAG	2	10	28402	28411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013504	TATTT	2	10	29985	29994	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013504	GCTAA	2	10	30032	30041	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_013504	CTCTT	2	10	30604	30613	0 %	60 %	0 %	40 %	268318589
25	NC_013504	TCCAG	2	10	31330	31339	20 %	20 %	20 %	40 %	268318590
26	NC_013504	AGCCC	2	10	31402	31411	20 %	0 %	20 %	60 %	268318590
27	NC_013504	TTATC	2	10	31506	31515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_013504	TTGAT	2	10	32023	32032	20 %	60 %	20 %	0 %	268318591
29	NC_013504	TTGGT	2	10	40584	40593	0 %	60 %	40 %	0 %	268318598
30	NC_013504	TATAC	2	10	41191	41200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013504	AGGAA	2	10	41350	41359	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013504	AAAGG	2	10	41482	41491	60 %	0 %	40 %	0 %	268318599
33	NC_013504	GATAT	2	10	41937	41946	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013504	AAAGT	2	10	44588	44597	60 %	20 %	20 %	0 %	268318602
35	NC_013504	GAGAA	2	10	45990	45999	60 %	0 %	40 %	0 %	268318603
36	NC_013504	CATTA	2	10	47442	47451	40 %	40 %	0 %	20 %	268318605
37	NC_013504	AAATT	2	10	48575	48584	60 %	40 %	0 %	0 %	268318606
38	NC_013504	TGAAT	2	10	49069	49078	40 %	40 %	20 %	0 %	268318606
39	NC_013504	GTGAA	2	10	52005	52014	40 %	20 %	40 %	0 %	268318609
40	NC_013504	TTCCT	2	10	53313	53322	0 %	60 %	0 %	40 %	268318610
41	NC_013504	CAATT	2	10	54093	54102	40 %	40 %	0 %	20 %	268318610
42	NC_013504	GAAAT	2	10	54590	54599	60 %	20 %	20 %	0 %	268318610
43	NC_013504	TATAA	2	10	57236	57245	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013504	GAAAT	2	10	59036	59045	60 %	20 %	20 %	0 %	268318613
45	NC_013504	ATGCA	2	10	62022	62031	40 %	20 %	20 %	20 %	268318615
46	NC_013504	AAATT	2	10	62360	62369	60 %	40 %	0 %	0 %	268318615
47	NC_013504	ATAAA	2	10	62420	62429	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013504	CCTTG	2	10	63654	63663	0 %	40 %	20 %	40 %	268318617
49	NC_013504	CATTT	2	10	64926	64935	20 %	60 %	0 %	20 %	268318619
50	NC_013504	AATAC	2	10	65823	65832	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_013504	AGTAA	2	10	67467	67476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013504	CTTGA	2	10	67716	67725	20 %	40 %	20 %	20 %	268318621
53	NC_013504	ATTCA	2	10	68439	68448	40 %	40 %	0 %	20 %	268318622
54	NC_013504	TTCAA	2	10	68461	68470	40 %	40 %	0 %	20 %	268318622
55	NC_013504	TTTTA	2	10	70356	70365	20 %	80 %	0 %	0 %	268318623
56	NC_013504	CAGAT	2	10	70531	70540	40 %	20 %	20 %	20 %	268318623
57	NC_013504	TAAAT	2	10	71003	71012	60 %	40 %	0 %	0 %	268318623
58	NC_013504	GAAAA	2	10	71232	71241	80 %	0 %	20 %	0 %	268318623
59	NC_013504	GAATT	2	10	71540	71549	40 %	40 %	20 %	0 %	268318624
60	NC_013504	ATAAA	2	10	74881	74890	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013504	AGATA	2	10	75112	75121	60 %	20 %	20 %	0 %	268318627
62	NC_013504	CCATA	2	10	75386	75395	40 %	20 %	0 %	40 %	268318627
63	NC_013504	AAGAA	2	10	75752	75761	80 %	0 %	20 %	0 %	268318628
64	NC_013504	TTGCA	2	10	76966	76975	20 %	40 %	20 %	20 %	268318629
65	NC_013504	GAAAG	2	10	77373	77382	60 %	0 %	40 %	0 %	268318629
66	NC_013504	AAATT	2	10	77665	77674	60 %	40 %	0 %	0 %	268318630
67	NC_013504	AGAAT	2	10	78160	78169	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013504	TCCCA	2	10	81455	81464	20 %	20 %	0 %	60 %	268318634
69	NC_013504	AGATG	2	10	82377	82386	40 %	20 %	40 %	0 %	268318635
70	NC_013504	TAATA	2	10	82709	82718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013504	GCAAA	2	10	84343	84352	60 %	0 %	20 %	20 %	268318639
72	NC_013504	TAATG	2	10	85683	85692	40 %	40 %	20 %	0 %	268318641
73	NC_013504	AGAGT	2	10	86294	86303	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013504	TAATT	2	10	87561	87570	40 %	60 %	0 %	0 %	268318644
75	NC_013504	CAATA	2	10	90918	90927	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_013504	TTAAG	2	10	92273	92282	40 %	40 %	20 %	0 %	268318648
77	NC_013504	AATAC	2	10	92348	92357	60 %	20 %	0 %	20 %	268318649
78	NC_013504	AAGTA	2	10	92756	92765	60 %	20 %	20 %	0 %	268318649
79	NC_013504	GTGAT	2	10	94940	94949	20 %	40 %	40 %	0 %	268318652
80	NC_013504	TTTTA	2	10	95071	95080	20 %	80 %	0 %	0 %	268318653
81	NC_013504	ATAAA	2	10	96385	96394	80 %	20 %	0 %	0 %	268318653
82	NC_013504	CTTTT	2	10	98059	98068	0 %	80 %	0 %	20 %	268318655
83	NC_013504	ATGAT	2	10	103236	103245	40 %	40 %	20 %	0 %	268318661
84	NC_013504	AGACA	2	10	103258	103267	60 %	0 %	20 %	20 %	268318661
85	NC_013504	ATATT	2	10	103965	103974	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013504	ATTTT	2	10	104554	104563	20 %	80 %	0 %	0 %	268318662
87	NC_013504	TTATC	2	10	105516	105525	20 %	60 %	0 %	20 %	268318663
88	NC_013504	GAATA	2	10	106871	106880	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013504	TTTTA	2	10	108298	108307	20 %	80 %	0 %	0 %	268318665
90	NC_013504	TGGAT	2	10	108489	108498	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013504	TAGAC	2	10	108745	108754	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013504	ATTTT	2	10	110071	110080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013504	AATTA	2	10	111458	111467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_013504	GTAAT	2	10	111646	111655	40 %	40 %	20 %	0 %	268318668
95	NC_013504	CAAAA	2	10	113078	113087	80 %	0 %	0 %	20 %	268318669
96	NC_013504	AAAAG	2	10	113099	113108	80 %	0 %	20 %	0 %	268318669
97	NC_013504	GGTTT	2	10	115362	115371	0 %	60 %	40 %	0 %	268318671
98	NC_013504	TCGAT	2	10	116820	116829	20 %	40 %	20 %	20 %	268318672
99	NC_013504	TAAAT	2	10	118706	118715	60 %	40 %	0 %	0 %	268318674
100	NC_013504	AAAGA	2	10	121460	121469	80 %	0 %	20 %	0 %	268318677
101	NC_013504	AGTAA	2	10	123093	123102	60 %	20 %	20 %	0 %	268318678
102	NC_013504	GCATG	2	10	123114	123123	20 %	20 %	40 %	20 %	268318678
103	NC_013504	GTTTA	2	10	123207	123216	20 %	60 %	20 %	0 %	268318678
104	NC_013504	TTAAA	2	10	125343	125352	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013504	GAAAA	2	10	125526	125535	80 %	0 %	20 %	0 %	268318679
106	NC_013504	CGATT	2	10	125614	125623	20 %	40 %	20 %	20 %	268318679
107	NC_013504	AAAGA	2	10	126329	126338	80 %	0 %	20 %	0 %	268318680
108	NC_013504	AGCCA	2	10	127567	127576	40 %	0 %	20 %	40 %	268318681
109	NC_013504	GTGTG	2	10	128504	128513	0 %	40 %	60 %	0 %	268318681
110	NC_013504	AACAA	2	10	130089	130098	80 %	0 %	0 %	20 %	268318683
111	NC_013504	AATAT	2	10	132906	132915	60 %	40 %	0 %	0 %	268318687
112	NC_013504	TGAAA	2	10	133857	133866	60 %	20 %	20 %	0 %	268318688
113	NC_013504	ATTTA	2	10	134052	134061	40 %	60 %	0 %	0 %	268318688
114	NC_013504	AAGTT	2	10	135230	135239	40 %	40 %	20 %	0 %	268318690
115	NC_013504	ATTTT	2	10	137057	137066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013504	TGATA	2	10	137795	137804	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013504	TAAAT	2	10	139093	139102	60 %	40 %	0 %	0 %	268318695
118	NC_013504	CAATA	2	10	143435	143444	60 %	20 %	0 %	20 %	268318699
119	NC_013504	AAGAA	2	10	143881	143890	80 %	0 %	20 %	0 %	268318700
120	NC_013504	ATTGA	2	10	146092	146101	40 %	40 %	20 %	0 %	268318701
121	NC_013504	TCAAG	2	10	148030	148039	40 %	20 %	20 %	20 %	268318702
122	NC_013504	ACTTA	2	10	148194	148203	40 %	40 %	0 %	20 %	268318702
123	NC_013504	TGGAA	2	10	149313	149322	40 %	20 %	40 %	0 %	268318702
124	NC_013504	AAGAA	2	10	150139	150148	80 %	0 %	20 %	0 %	268318704
125	NC_013504	AAAAG	2	10	150497	150506	80 %	0 %	20 %	0 %	268318704
126	NC_013504	TAAAG	2	10	150677	150686	60 %	20 %	20 %	0 %	268318704
127	NC_013504	AGAAA	2	10	151909	151918	80 %	0 %	20 %	0 %	268318705
128	NC_013504	TATAA	2	10	153321	153330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013504	TTACT	2	10	153741	153750	20 %	60 %	0 %	20 %	268318707
130	NC_013504	AATAA	2	10	154452	154461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013504	AGCAA	2	10	154852	154861	60 %	0 %	20 %	20 %	268318708
132	NC_013504	CAAAA	2	10	155112	155121	80 %	0 %	0 %	20 %	268318708
133	NC_013504	AATGG	2	10	156041	156050	40 %	20 %	40 %	0 %	268318708
134	NC_013504	ACCTT	2	10	158245	158254	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
135	NC_013504	ATTAC	2	10	158498	158507	40 %	40 %	0 %	20 %	268318710
136	NC_013504	TTTTA	2	10	161212	161221	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013504	CTTAA	2	10	161661	161670	40 %	40 %	0 %	20 %	268318712
138	NC_013504	TGTTA	2	10	165232	165241	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_013504	AATTA	2	10	166945	166954	60 %	40 %	0 %	0 %	268318714
140	NC_013504	ATAGA	2	10	167577	167586	60 %	20 %	20 %	0 %	268318715
141	NC_013504	AATTC	2	10	168702	168711	40 %	40 %	0 %	20 %	268318715
142	NC_013504	CCAAA	2	10	169342	169351	60 %	0 %	0 %	40 %	268318716
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145	NC_013504	AGTAA	2	10	177257	177266	60 %	20 %	20 %	0 %	268318723
146	NC_013504	AGTAA	2	10	177569	177578	60 %	20 %	20 %	0 %	268318723
147	NC_013504	ATATT	2	10	181736	181745	40 %	60 %	0 %	0 %	268318727
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151	NC_013504	GGTTG	2	10	184257	184266	0 %	40 %	60 %	0 %	268318731
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252	NC_013504	TAAAA	2	10	317263	317272	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_013504	AAAGA	2	10	319247	319256	80 %	0 %	20 %	0 %	268318853
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265	NC_013504	AGCAA	2	10	342259	342268	60 %	0 %	20 %	20 %	268318892
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268	NC_013504	AAAAG	2	10	343583	343592	80 %	0 %	20 %	0 %	268318892
269	NC_013504	TAAAA	2	10	346817	346826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_013504	AGTGC	2	10	346882	346891	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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405	NC_013504	AGTAT	2	10	522353	522362	40 %	40 %	20 %	0 %	268319072
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