MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 24071

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	TAA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318563
2	NC_013504	AAG	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
3	NC_013504	AAG	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
4	NC_013504	GCA	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
5	NC_013504	GCC	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318563
6	NC_013504	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318563
7	NC_013504	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318563
8	NC_013504	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318563
9	NC_013504	TAG	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318563
10	NC_013504	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318563
11	NC_013504	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318563
12	NC_013504	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
13	NC_013504	CAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318563
14	NC_013504	AAG	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
15	NC_013504	ATT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318563
16	NC_013504	ACT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318563
17	NC_013504	AAG	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
18	NC_013504	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318563
19	NC_013504	AGC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
20	NC_013504	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318564
21	NC_013504	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318564
22	NC_013504	CTA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
23	NC_013504	GAT	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318564
24	NC_013504	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
25	NC_013504	ATT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
26	NC_013504	AAT	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318564
27	NC_013504	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
28	NC_013504	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
29	NC_013504	TAG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318564
30	NC_013504	ACA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318564
31	NC_013504	TCT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318564
32	NC_013504	GAA	3	9	2473	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318564
33	NC_013504	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
34	NC_013504	GAA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
35	NC_013504	AGA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
36	NC_013504	CAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318565
37	NC_013504	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
38	NC_013504	GAT	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
39	NC_013504	TTA	2	6	3838	3843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318565
40	NC_013504	ACT	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318565
41	NC_013504	GAT	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
42	NC_013504	ATC	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318565
43	NC_013504	AGT	2	6	4089	4094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
44	NC_013504	CAA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318565
45	NC_013504	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318565
46	NC_013504	AGA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
47	NC_013504	GCA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318566
48	NC_013504	TAG	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
49	NC_013504	ACC	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318566
50	NC_013504	ATT	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318566
51	NC_013504	ATA	2	6	4414	4419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318566
52	NC_013504	GAT	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
53	NC_013504	GTC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
54	NC_013504	TGG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318566
55	NC_013504	CGG	2	6	4592	4597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318566
56	NC_013504	TGG	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318566
57	NC_013504	GTA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
58	NC_013504	GTA	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
59	NC_013504	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
60	NC_013504	CGA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318566
61	NC_013504	AAG	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
62	NC_013504	TGA	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
63	NC_013504	GAT	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
64	NC_013504	TGT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
65	NC_013504	TTG	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
66	NC_013504	CTG	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
67	NC_013504	GAA	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
68	NC_013504	ATC	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318566
69	NC_013504	TGA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
70	NC_013504	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318566
71	NC_013504	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
72	NC_013504	TCG	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
73	NC_013504	AGG	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318566
74	NC_013504	CAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
75	NC_013504	CGT	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318567
76	NC_013504	AAG	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
77	NC_013504	TTG	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318567
78	NC_013504	GAT	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
79	NC_013504	AGT	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
80	NC_013504	ACA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318567
81	NC_013504	TAC	2	6	6828	6833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
82	NC_013504	TAA	2	6	6842	6847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
83	NC_013504	TGG	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318567
84	NC_013504	GTT	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318567
85	NC_013504	CGC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318567
86	NC_013504	AAT	2	6	7168	7173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
87	NC_013504	TGG	2	6	7217	7222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318567
88	NC_013504	TAC	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
89	NC_013504	CAC	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318567
90	NC_013504	AAG	2	6	7289	7294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
91	NC_013504	TTA	2	6	7298	7303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318567
92	NC_013504	AAG	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
93	NC_013504	TGA	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
94	NC_013504	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318567
95	NC_013504	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
96	NC_013504	ATT	2	6	7615	7620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318567
97	NC_013504	TGA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
98	NC_013504	TCG	2	6	7662	7667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318567
99	NC_013504	GTG	2	6	7802	7807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318567
100	NC_013504	GAT	3	9	7837	7845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
101	NC_013504	TCA	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
102	NC_013504	TCT	2	6	7862	7867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318567
103	NC_013504	TTC	2	6	7891	7896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318567
104	NC_013504	GAA	2	6	7949	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
105	NC_013504	TCT	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318567
106	NC_013504	TCG	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318567
107	NC_013504	AAT	2	6	8164	8169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
108	NC_013504	GAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
109	NC_013504	CAG	2	6	8267	8272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318567
110	NC_013504	CGG	2	6	8415	8420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318567
111	NC_013504	AGT	2	6	8478	8483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
112	NC_013504	TGA	2	6	8646	8651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
113	NC_013504	GAA	2	6	8656	8661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
114	NC_013504	GAA	3	9	8671	8679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
115	NC_013504	TAA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
116	NC_013504	ATC	2	6	8914	8919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318568
117	NC_013504	GTT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318568
118	NC_013504	GAA	2	6	8995	9000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318568
119	NC_013504	TGA	2	6	9108	9113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318568
120	NC_013504	GTC	2	6	9119	9124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318568
121	NC_013504	TAA	2	6	9219	9224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318569
122	NC_013504	TGT	2	6	9225	9230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318569
123	NC_013504	TTG	2	6	9233	9238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318569
124	NC_013504	GTG	2	6	9344	9349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318569
125	NC_013504	TCA	2	6	9356	9361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318569
126	NC_013504	AGC	2	6	9381	9386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318569
127	NC_013504	GAT	2	6	9460	9465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318569
128	NC_013504	TTG	2	6	9500	9505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318569
129	NC_013504	CGT	2	6	9529	9534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318569
130	NC_013504	TGG	2	6	9558	9563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318569
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133	NC_013504	TGG	2	6	9609	9614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318569
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139	NC_013504	CGT	2	6	9892	9897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318570
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248	NC_013504	TAT	2	6	16610	16615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318576
249	NC_013504	CAG	2	6	16639	16644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318576
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252	NC_013504	CTG	2	6	16738	16743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318576
253	NC_013504	CTA	2	6	16831	16836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318576
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255	NC_013504	CTA	2	6	17375	17380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318577
256	NC_013504	GTA	2	6	17405	17410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318577
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258	NC_013504	AGT	2	6	17532	17537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318577
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