MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013502	AGGGG	2	10	48722	48731	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013502	AGCGA	2	10	54320	54329	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_013502	AGGTC	2	10	65760	65769	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013502	GGACA	2	10	66266	66275	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_013502	CCACC	2	10	69556	69565	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_013502	AATCA	2	10	71149	71158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_013502	CCCAT	2	10	73088	73097	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
8	NC_013502	TGCTT	2	10	73443	73452	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_013502	GACCA	2	10	73593	73602	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_013502	GGCCA	2	10	74219	74228	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_013502	CGTTG	2	10	74271	74280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_013502	CCCAT	2	10	76061	76070	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013502	TGCGT	2	10	79407	79416	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_013502	GGACG	2	10	82261	82270	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013502	GGGTG	2	10	84449	84458	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013502	AACCA	2	10	84946	84955	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_013502	GAGGG	2	10	86538	86547	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013502	GCGGG	2	10	91175	91184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013502	GTCCG	2	10	103268	103277	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_013502	GCCGG	2	10	103293	103302	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_013502	TTCTT	2	10	113736	113745	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013502	TGCTA	2	10	114576	114585	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_013502	CTTCG	2	10	116850	116859	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013502	CACGA	2	10	118086	118095	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_013502	TCGCA	2	10	122022	122031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.