MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013502	CG	3	6	6348	6353	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013502	AC	3	6	6596	6601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_013502	TG	3	6	6606	6611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013502	GT	3	6	7912	7917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013502	CT	3	6	7987	7992	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013502	TC	3	6	8452	8457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013502	AT	3	6	23791	23796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013502	CT	3	6	24894	24899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_013502	GT	3	6	32493	32498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013502	GT	3	6	32828	32833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013502	GA	4	8	32895	32902	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013502	CG	3	6	49758	49763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_013502	GC	4	8	66406	66413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013502	GT	3	6	66712	66717	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013502	CA	3	6	72852	72857	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_013502	CT	3	6	75171	75176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013502	TG	4	8	78692	78699	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013502	CT	3	6	79115	79120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013502	AC	3	6	79221	79226	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013502	TA	3	6	79293	79298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013502	AT	3	6	79689	79694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013502	GT	3	6	82417	82422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013502	CT	3	6	86140	86145	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_013502	AT	3	6	86249	86254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013502	AG	3	6	87107	87112	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013502	GC	3	6	87731	87736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_013502	GA	3	6	93999	94004	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013502	AG	3	6	96397	96402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013502	CT	3	6	100246	100251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013502	CA	3	6	100925	100930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013502	GC	3	6	101737	101742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013502	GA	3	6	102826	102831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013502	GC	3	6	102852	102857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_013502	CG	3	6	103198	103203	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_013502	AG	3	6	103281	103286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013502	TC	3	6	106402	106407	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013502	AG	3	6	108231	108236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013502	AT	3	6	108811	108816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013502	TG	3	6	108834	108839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013502	GC	3	6	113576	113581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013502	CG	3	6	116772	116777	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013502	CT	3	6	118296	118301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_013502	TC	3	6	121278	121283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_013502	GC	3	6	122015	122020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.