MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Rhodothermus marinus DSM 4252 plasmid pRMAR01

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013502	C	8	8	1089	1096	0 %	0 %	0 %	100 %	268318346
2	NC_013502	T	6	6	4781	4786	0 %	100 %	0 %	0 %	268318348
3	NC_013502	T	6	6	4808	4813	0 %	100 %	0 %	0 %	268318348
4	NC_013502	A	6	6	7021	7026	100 %	0 %	0 %	0 %	268318350
5	NC_013502	A	6	6	7633	7638	100 %	0 %	0 %	0 %	268318350
6	NC_013502	C	6	6	10377	10382	0 %	0 %	0 %	100 %	268318353
7	NC_013502	A	6	6	17462	17467	100 %	0 %	0 %	0 %	268318356
8	NC_013502	T	6	6	17473	17478	0 %	100 %	0 %	0 %	268318356
9	NC_013502	A	6	6	17553	17558	100 %	0 %	0 %	0 %	268318356
10	NC_013502	C	6	6	17621	17626	0 %	0 %	0 %	100 %	268318356
11	NC_013502	A	6	6	22212	22217	100 %	0 %	0 %	0 %	268318358
12	NC_013502	T	6	6	24991	24996	0 %	100 %	0 %	0 %	268318359
13	NC_013502	A	6	6	25766	25771	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
14	NC_013502	T	7	7	25978	25984	0 %	100 %	0 %	0 %	268318359
15	NC_013502	A	7	7	26025	26031	100 %	0 %	0 %	0 %	268318359
16	NC_013502	C	6	6	34793	34798	0 %	0 %	0 %	100 %	268318367
17	NC_013502	G	6	6	34873	34878	0 %	0 %	100 %	0 %	268318367
18	NC_013502	A	6	6	37627	37632	100 %	0 %	0 %	0 %	268318369
19	NC_013502	C	6	6	40352	40357	0 %	0 %	0 %	100 %	268318373
20	NC_013502	G	6	6	40931	40936	0 %	0 %	100 %	0 %	268318373
21	NC_013502	T	6	6	41671	41676	0 %	100 %	0 %	0 %	268318374
22	NC_013502	A	6	6	42225	42230	100 %	0 %	0 %	0 %	268318374
23	NC_013502	C	6	6	43031	43036	0 %	0 %	0 %	100 %	268318375
24	NC_013502	A	6	6	44538	44543	100 %	0 %	0 %	0 %	268318377
25	NC_013502	T	6	6	47925	47930	0 %	100 %	0 %	0 %	268318381
26	NC_013502	A	7	7	47931	47937	100 %	0 %	0 %	0 %	268318381
27	NC_013502	C	6	6	48007	48012	0 %	0 %	0 %	100 %	268318381
28	NC_013502	C	6	6	50692	50697	0 %	0 %	0 %	100 %	268318386
29	NC_013502	C	6	6	51349	51354	0 %	0 %	0 %	100 %	268318386
30	NC_013502	A	6	6	53280	53285	100 %	0 %	0 %	0 %	268318387
31	NC_013502	A	6	6	54608	54613	100 %	0 %	0 %	0 %	268318388
32	NC_013502	A	6	6	54705	54710	100 %	0 %	0 %	0 %	268318388
33	NC_013502	T	6	6	54843	54848	0 %	100 %	0 %	0 %	268318388
34	NC_013502	C	6	6	56982	56987	0 %	0 %	0 %	100 %	268318389
35	NC_013502	C	6	6	57867	57872	0 %	0 %	0 %	100 %	268318390
36	NC_013502	C	6	6	62781	62786	0 %	0 %	0 %	100 %	268318393
37	NC_013502	G	6	6	79760	79765	0 %	0 %	100 %	0 %	268318406
38	NC_013502	T	7	7	83151	83157	0 %	100 %	0 %	0 %	268318411
39	NC_013502	G	6	6	83574	83579	0 %	0 %	100 %	0 %	268318411
40	NC_013502	A	7	7	85838	85844	100 %	0 %	0 %	0 %	268318412
41	NC_013502	A	6	6	94021	94026	100 %	0 %	0 %	0 %	268318420
42	NC_013502	C	6	6	94457	94462	0 %	0 %	0 %	100 %	268318420
43	NC_013502	A	6	6	94618	94623	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
44	NC_013502	A	6	6	94899	94904	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
45	NC_013502	A	6	6	95129	95134	100 %	0 %	0 %	0 %	268318421
46	NC_013502	A	6	6	96200	96205	100 %	0 %	0 %	0 %	268318422
47	NC_013502	G	6	6	96341	96346	0 %	0 %	100 %	0 %	268318422
48	NC_013502	T	6	6	97798	97803	0 %	100 %	0 %	0 %	268318423
49	NC_013502	C	6	6	97932	97937	0 %	0 %	0 %	100 %	268318423
50	NC_013502	A	6	6	98940	98945	100 %	0 %	0 %	0 %	268318424
51	NC_013502	C	6	6	103477	103482	0 %	0 %	0 %	100 %	268318428
52	NC_013502	G	6	6	103627	103632	0 %	0 %	100 %	0 %	268318428
53	NC_013502	C	6	6	110246	110251	0 %	0 %	0 %	100 %	268318434
54	NC_013502	T	6	6	111289	111294	0 %	100 %	0 %	0 %	268318434
55	NC_013502	C	6	6	119576	119581	0 %	0 %	0 %	100 %	268318439
56	NC_013502	C	6	6	124531	124536	0 %	0 %	0 %	100 %	268318442

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.