MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013454	AAAAC	2	10	15259	15268	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_013454	TATGG	2	10	38451	38460	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013454	AAACA	2	10	60558	60567	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_013454	GTTTT	2	10	91151	91160	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013454	ATTTT	2	10	113029	113038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013454	AGTTA	2	10	115716	115725	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013454	TTTGA	2	10	138186	138195	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013454	ATGAA	2	10	138223	138232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013454	ATTTT	2	10	140126	140135	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013454	GTTTT	2	10	147802	147811	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013454	TGAAA	2	10	166611	166620	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013454	ATTTG	2	10	175534	175543	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013454	AAAAG	2	10	194978	194987	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013454	TCATT	2	10	196454	196463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_013454	AAAAT	2	10	212540	212549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013454	TAATA	2	10	213769	213778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013454	CACAA	2	10	218344	218353	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013454	ACATC	2	10	221253	221262	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_013454	TGAAA	2	10	221405	221414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013454	TTTAT	2	10	229551	229560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013454	TATTC	2	10	254142	254151	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_013454	AAATT	2	10	269105	269114	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013454	TAATA	2	10	282844	282853	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013454	AAATT	2	10	286571	286580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013454	ATAAA	2	10	288306	288315	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013454	GGTAA	2	10	293484	293493	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013454	TGGAG	2	10	294817	294826	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013454	GAAAA	2	10	295255	295264	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013454	AGAGA	2	10	296817	296826	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013454	TCAAT	2	10	297263	297272	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013454	TTATG	2	10	297966	297975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013454	TTTTA	2	10	299831	299840	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013454	AAGTA	2	10	306163	306172	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013454	AAAAG	2	10	314565	314574	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013454	TATAT	2	10	318505	318514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013454	AAAAC	2	10	329822	329831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_013454	TCGTT	2	10	338315	338324	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_013454	TCAAA	2	10	353135	353144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_013454	GAATG	2	10	358972	358981	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_013454	AGAGA	2	10	373679	373688	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013454	TGTAA	2	10	401429	401438	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013454	ATGAA	2	10	416968	416977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013454	TTAAT	2	10	429839	429848	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013454	CTTAT	2	10	457782	457791	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_013454	TTATT	2	10	463462	463471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013454	ATAAA	2	10	469898	469907	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013454	TAACC	2	10	473450	473459	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_013454	TTAAA	2	10	473491	473500	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013454	AAAGA	2	10	475438	475447	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013454	ATTTG	2	10	477014	477023	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013454	AATTA	2	10	501231	501240	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_013454	TTTAT	2	10	507056	507065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013454	GTATT	2	10	512234	512243	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013454	AATAA	2	10	513599	513608	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013454	TCTAT	2	10	518535	518544	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_013454	AATCT	2	10	525452	525461	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_013454	ATTTA	2	10	530568	530577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013454	TATAT	2	10	538139	538148	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013454	ATTAG	2	10	541097	541106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_013454	ATTTT	2	10	542718	542727	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_013454	AAAAT	2	10	563025	563034	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013454	TCAGT	2	10	595835	595844	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_013454	AGAGA	2	10	612879	612888	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_013454	ATTAT	2	10	616027	616036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013454	TGATT	2	10	616678	616687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_013454	TAAAA	2	10	621692	621701	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_013454	CCTAA	2	10	621712	621721	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
68	NC_013454	ATTTA	2	10	634013	634022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013454	TATTT	2	10	636233	636242	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.