MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Blattella germanica) str. Bge

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013454	AAAG	2	8	5561	5568	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013454	AAAT	2	8	16569	16576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013454	GAAA	2	8	16615	16622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013454	TCCC	2	8	29243	29250	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5	NC_013454	AATA	2	8	47436	47443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013454	AAAC	2	8	48278	48285	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_013454	TTAA	2	8	48589	48596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013454	ATTT	2	8	48638	48645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013454	ATAA	2	8	48653	48660	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013454	ATTT	2	8	49649	49656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013454	ATAA	2	8	59365	59372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013454	AAAT	2	8	60489	60496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013454	TAAA	2	8	64234	64241	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_013454	AATT	2	8	86204	86211	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013454	ATTT	2	8	86222	86229	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013454	TATT	2	8	105892	105899	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013454	TTTA	2	8	106381	106388	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_013454	TTGT	2	8	107252	107259	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_013454	CGTA	2	8	107354	107361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_013454	TAAA	2	8	115728	115735	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013454	AAAT	2	8	121369	121376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013454	TTTA	3	12	128445	128456	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013454	ATTG	2	8	128464	128471	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013454	AAAT	2	8	128515	128522	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013454	AAAT	2	8	128527	128534	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013454	AAAT	2	8	135317	135324	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013454	ATTT	2	8	139935	139942	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013454	TTAT	2	8	139943	139950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013454	TATT	2	8	142195	142202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_013454	TAAA	2	8	155771	155778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013454	TTTA	2	8	155844	155851	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013454	TCAG	2	8	157188	157195	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_013454	TAAA	2	8	166727	166734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013454	TATT	2	8	170883	170890	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013454	TAAA	2	8	175796	175803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013454	CCGT	2	8	177191	177198	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013454	TAAT	2	8	189900	189907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013454	ATTT	2	8	198593	198600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013454	CTTA	2	8	206515	206522	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_013454	GATA	3	12	206558	206569	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013454	TAAT	2	8	209090	209097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013454	GTAT	2	8	213809	213816	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013454	AATA	2	8	213818	213825	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013454	ATTT	2	8	216790	216797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013454	ATAA	2	8	221383	221390	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013454	TATT	2	8	221447	221454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_013454	ATTA	3	12	231511	231522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013454	AGCA	2	8	231529	231536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_013454	TTAT	2	8	237407	237414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013454	ATTT	2	8	255891	255898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_013454	TCTA	2	8	279170	279177	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013454	ATTA	2	8	288400	288407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_013454	AATA	2	8	288418	288425	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_013454	ACGT	2	8	293346	293353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_013454	ACCT	2	8	293355	293362	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013454	GCGT	2	8	293462	293469	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_013454	TTAG	2	8	293474	293481	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_013454	TGAG	2	8	293881	293888	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_013454	CGGA	2	8	294252	294259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_013454	CTTT	2	8	294804	294811	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_013454	ATTA	2	8	294831	294838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_013454	ACAT	2	8	295017	295024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_013454	GCGA	2	8	295288	295295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
64	NC_013454	GATT	2	8	296249	296256	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013454	AATC	2	8	296262	296269	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_013454	CTTT	2	8	296487	296494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_013454	ACGG	2	8	296534	296541	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
68	NC_013454	GAAA	2	8	296680	296687	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_013454	CCTT	2	8	296797	296804	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_013454	TCTA	2	8	297670	297677	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_013454	GTTT	2	8	301755	301762	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_013454	ATTA	2	8	306184	306191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_013454	ATTT	2	8	306272	306279	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_013454	AAAT	2	8	317768	317775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_013454	AAAT	2	8	321551	321558	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_013454	TTGA	2	8	322717	322724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_013454	CTTA	2	8	329724	329731	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_013454	TATT	2	8	332838	332845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013454	TTGA	2	8	338411	338418	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013454	TACA	2	8	349949	349956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013454	AATC	2	8	349974	349981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_013454	ATAA	2	8	353092	353099	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_013454	ATTT	2	8	353112	353119	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_013454	ATTA	2	8	358995	359002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_013454	TAAA	2	8	395817	395824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_013454	TGAT	2	8	405323	405330	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_013454	AGAA	2	8	405442	405449	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_013454	TAAT	2	8	415732	415739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_013454	TAAT	2	8	418728	418735	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013454	ATTT	2	8	418753	418760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013454	TGAA	2	8	434348	434355	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_013454	TAAA	2	8	449255	449262	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013454	ACAA	2	8	469845	469852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013454	GTAA	2	8	473400	473407	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_013454	TATG	2	8	487837	487844	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013454	CAAA	2	8	492530	492537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_013454	GCAT	2	8	498256	498263	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_013454	ATCC	2	8	498377	498384	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013454	AATA	2	8	498404	498411	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013454	AAAG	2	8	507157	507164	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_013454	TGTT	2	8	513337	513344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_013454	TTCA	2	8	513382	513389	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_013454	ATTT	2	8	514237	514244	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_013454	TAAA	2	8	514321	514328	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_013454	AATA	2	8	521493	521500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_013454	TTTC	2	8	524001	524008	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_013454	ATTC	2	8	524010	524017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_013454	GTTT	2	8	524040	524047	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_013454	GATG	2	8	525497	525504	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_013454	TATT	2	8	527895	527902	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013454	ATTT	2	8	531719	531726	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013454	AATA	2	8	533970	533977	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_013454	TAAT	2	8	536275	536282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_013454	ATTT	2	8	538161	538168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_013454	ATTA	2	8	541119	541126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_013454	AATT	2	8	544073	544080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_013454	AAAT	2	8	544714	544721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_013454	AGAT	2	8	549777	549784	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013454	AGTC	2	8	551278	551285	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013454	TTTA	2	8	552355	552362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013454	TATT	2	8	556240	556247	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013454	ATTA	2	8	556270	556277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013454	AAAT	2	8	556407	556414	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013454	TAAT	2	8	564319	564326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_013454	TATT	2	8	565549	565556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_013454	TAGT	2	8	576339	576346	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_013454	TTGT	2	8	582590	582597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_013454	TTTA	2	8	592637	592644	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_013454	ATGA	2	8	603416	603423	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_013454	GAAA	2	8	609639	609646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013454	TATG	2	8	610922	610929	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_013454	ATTT	2	8	612850	612857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_013454	TAAA	2	8	613882	613889	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_013454	ATTA	2	8	616016	616023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013454	CTTT	2	8	616623	616630	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_013454	AAAG	2	8	616721	616728	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013454	ATTT	2	8	625631	625638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013454	AGTA	2	8	636249	636256	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.