MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260516
2	NC_013453	ATA	2	6	183	188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260516
3	NC_013453	TAG	2	6	289	294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260516
4	NC_013453	TAA	2	6	1360	1365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
5	NC_013453	CAA	2	6	1445	1450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260517
6	NC_013453	ATA	2	6	1635	1640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
7	NC_013453	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260517
8	NC_013453	CCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260517
9	NC_013453	CTT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
10	NC_013453	AAT	3	9	2059	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
11	NC_013453	CTT	2	6	2131	2136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
12	NC_013453	AAT	2	6	2143	2148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
13	NC_013453	CTA	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
14	NC_013453	TCA	2	6	2562	2567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260517
15	NC_013453	AAT	2	6	2668	2673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
16	NC_013453	CTT	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260517
17	NC_013453	AAT	2	6	2738	2743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260517
18	NC_013453	TTA	2	6	2772	2777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
19	NC_013453	TTA	2	6	2913	2918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260517
20	NC_013453	TAT	2	6	3353	3358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
21	NC_013453	CTT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
22	NC_013453	TAT	2	6	3477	3482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260518
23	NC_013453	CTT	2	6	3491	3496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
24	NC_013453	CTT	2	6	3507	3512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260518
25	NC_013453	TAA	2	6	3549	3554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260518
26	NC_013453	TAT	2	6	3665	3670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
27	NC_013453	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260519
28	NC_013453	TTA	2	6	3911	3916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260519
29	NC_013453	CAT	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260519
30	NC_013453	TAA	2	6	4068	4073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260519
31	NC_013453	TTG	2	6	4103	4108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260519
32	NC_013453	AGG	2	6	4686	4691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	262260520
33	NC_013453	TGT	2	6	4750	4755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260520
34	NC_013453	TTG	2	6	4922	4927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260521
35	NC_013453	GTC	3	9	4928	4936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260521
36	NC_013453	GAT	2	6	4977	4982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
37	NC_013453	ATC	2	6	5288	5293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260521
38	NC_013453	GAT	2	6	5353	5358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260521
39	NC_013453	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
40	NC_013453	AAT	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260522
41	NC_013453	TAA	3	9	5890	5898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260523
42	NC_013453	AAC	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260523
43	NC_013453	CAT	2	6	5959	5964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260523
44	NC_013453	GAT	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260523
45	NC_013453	AGA	2	6	5995	6000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262260523
46	NC_013453	AAT	2	6	6176	6181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260524
47	NC_013453	ATT	2	6	6201	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
48	NC_013453	TAA	2	6	6211	6216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260524
49	NC_013453	TAT	2	6	6232	6237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
50	NC_013453	TCC	2	6	6247	6252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262260524
51	NC_013453	TTA	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
52	NC_013453	TTG	2	6	6325	6330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260524
53	NC_013453	ATT	2	6	6395	6400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260524
54	NC_013453	TAT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
55	NC_013453	AAT	2	6	6508	6513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260525
56	NC_013453	CTT	2	6	6573	6578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260525
57	NC_013453	TAT	2	6	6678	6683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
58	NC_013453	TAG	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260525
59	NC_013453	TCA	2	6	6765	6770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
60	NC_013453	ATC	2	6	6802	6807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
61	NC_013453	TAT	2	6	6864	6869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
62	NC_013453	TTA	2	6	6917	6922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
63	NC_013453	CAC	2	6	7092	7097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260525
64	NC_013453	TAT	2	6	7128	7133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
65	NC_013453	AAC	2	6	7291	7296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260525
66	NC_013453	TAC	2	6	7300	7305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260525
67	NC_013453	CTT	2	6	7311	7316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260525
68	NC_013453	TGC	2	6	7429	7434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260525
69	NC_013453	ATT	2	6	7561	7566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260525
70	NC_013453	ATC	2	6	8168	8173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260526
71	NC_013453	GAT	2	6	8233	8238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260526
72	NC_013453	TGA	2	6	8257	8262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260526
73	NC_013453	TAA	2	6	8846	8851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260527
74	NC_013453	TCT	2	6	8935	8940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260527
75	NC_013453	CTG	2	6	9009	9014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262260527
76	NC_013453	TGT	2	6	9047	9052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260527
77	NC_013453	TCA	2	6	9290	9295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260528
78	NC_013453	TTG	2	6	9415	9420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260528
79	NC_013453	ATT	2	6	9463	9468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260528
80	NC_013453	TGG	2	6	9490	9495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	262260528
81	NC_013453	ATA	2	6	9575	9580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260528
82	NC_013453	AAT	2	6	9592	9597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260528
83	NC_013453	GAA	2	6	9617	9622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262260528
84	NC_013453	TAA	2	6	9631	9636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260528
85	NC_013453	TCT	2	6	9668	9673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260528
86	NC_013453	ATA	2	6	9822	9827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260528
87	NC_013453	AGT	2	6	9838	9843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260528
88	NC_013453	CCT	2	6	9854	9859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	262260528
89	NC_013453	TGA	2	6	10226	10231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260529
90	NC_013453	AGA	2	6	10299	10304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262260529
91	NC_013453	ATG	2	6	10376	10381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260529
92	NC_013453	TTG	2	6	10536	10541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260529
93	NC_013453	TAA	2	6	10635	10640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260529
94	NC_013453	TGA	2	6	10695	10700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260529
95	NC_013453	ATA	3	9	10793	10801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260529
96	NC_013453	TGA	2	6	10803	10808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260529
97	NC_013453	CAC	2	6	10829	10834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260529
98	NC_013453	ATC	2	6	10859	10864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260529
99	NC_013453	CAA	2	6	10894	10899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260529
100	NC_013453	CAC	2	6	11023	11028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	262260529
101	NC_013453	ACG	2	6	11088	11093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262260529
102	NC_013453	ATG	2	6	11149	11154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260529
103	NC_013453	TTG	2	6	11174	11179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	262260529
104	NC_013453	TGA	2	6	11479	11484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260530
105	NC_013453	AGT	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260530
106	NC_013453	TGA	2	6	11737	11742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260531
107	NC_013453	GGC	2	6	11783	11788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262260531
108	NC_013453	AAT	2	6	11894	11899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260531
109	NC_013453	CAA	2	6	11911	11916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	262260531
110	NC_013453	ATT	2	6	11926	11931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260531
111	NC_013453	GAT	2	6	12302	12307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260532
112	NC_013453	TAA	2	6	12449	12454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260532
113	NC_013453	TAA	2	6	12461	12466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260532
114	NC_013453	TCA	2	6	12583	12588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260532
115	NC_013453	TAA	2	6	12601	12606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260532
116	NC_013453	TTC	2	6	12622	12627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260532
117	NC_013453	ATG	2	6	12681	12686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260532
118	NC_013453	TAG	2	6	12751	12756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260532
119	NC_013453	TAG	2	6	13088	13093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260533
120	NC_013453	CTA	2	6	13420	13425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260534
121	NC_013453	ATT	2	6	13427	13432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	262260534
122	NC_013453	TCT	2	6	13533	13538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260534
123	NC_013453	TTC	2	6	13649	13654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	262260534
124	NC_013453	TAA	2	6	13679	13684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260534
125	NC_013453	TAA	2	6	13762	13767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260534
126	NC_013453	AGA	2	6	13791	13796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	262260534
127	NC_013453	CTA	2	6	13810	13815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	262260534
128	NC_013453	TAA	2	6	13918	13923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	262260534
129	NC_013453	ATG	2	6	14004	14009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260534
130	NC_013453	AGT	2	6	14010	14015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	262260534
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.