MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus ED98 plasmid pAVX

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013453	CT	3	6	89	94	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_013453	AT	3	6	1115	1120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013453	TA	3	6	1155	1160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013453	GA	3	6	1173	1178	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013453	TA	4	8	1287	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013453	AT	3	6	1323	1328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013453	TA	3	6	1394	1399	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
8	NC_013453	TA	3	6	1415	1420	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
9	NC_013453	TA	3	6	1517	1522	50 %	50 %	0 %	0 %	262260517
10	NC_013453	AT	3	6	3464	3469	50 %	50 %	0 %	0 %	262260518
11	NC_013453	TG	3	6	3499	3504	0 %	50 %	50 %	0 %	262260518
12	NC_013453	TG	4	8	4180	4187	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013453	TC	3	6	4238	4243	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_013453	AT	3	6	4421	4426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013453	AT	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013453	TA	3	6	4646	4651	50 %	50 %	0 %	0 %	262260520
17	NC_013453	AT	3	6	5063	5068	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
18	NC_013453	AT	3	6	5135	5140	50 %	50 %	0 %	0 %	262260521
19	NC_013453	AG	3	6	5174	5179	50 %	0 %	50 %	0 %	262260521
20	NC_013453	AT	5	10	6277	6286	50 %	50 %	0 %	0 %	262260524
21	NC_013453	GA	3	6	7281	7286	50 %	0 %	50 %	0 %	262260525
22	NC_013453	AT	3	6	8031	8036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013453	CT	3	6	8347	8352	0 %	50 %	0 %	50 %	262260526
24	NC_013453	AT	3	6	8386	8391	50 %	50 %	0 %	0 %	262260526
25	NC_013453	AT	3	6	8458	8463	50 %	50 %	0 %	0 %	262260526
26	NC_013453	TA	3	6	8656	8661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013453	TA	3	6	9135	9140	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
28	NC_013453	AT	4	8	9282	9289	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
29	NC_013453	TA	3	6	9559	9564	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
30	NC_013453	AT	3	6	9815	9820	50 %	50 %	0 %	0 %	262260528
31	NC_013453	TA	3	6	10670	10675	50 %	50 %	0 %	0 %	262260529
32	NC_013453	GA	3	6	11322	11327	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013453	TA	3	6	12212	12217	50 %	50 %	0 %	0 %	262260532
34	NC_013453	AT	3	6	12948	12953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013453	TA	3	6	12987	12992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013453	CT	3	6	13334	13339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_013453	AG	3	6	13445	13450	50 %	0 %	50 %	0 %	262260534
38	NC_013453	TA	3	6	13451	13456	50 %	50 %	0 %	0 %	262260534
39	NC_013453	AT	3	6	13629	13634	50 %	50 %	0 %	0 %	262260534
40	NC_013453	AT	3	6	13898	13903	50 %	50 %	0 %	0 %	262260534
41	NC_013453	TA	3	6	14018	14023	50 %	50 %	0 %	0 %	262260534
42	NC_013453	AT	3	6	14287	14292	50 %	50 %	0 %	0 %	262260535
43	NC_013453	AT	4	8	15150	15157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013453	AT	3	6	15201	15206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013453	AG	3	6	15409	15414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013453	TA	3	6	15430	15435	50 %	50 %	0 %	0 %	262260537
47	NC_013453	AT	3	6	15438	15443	50 %	50 %	0 %	0 %	262260537
48	NC_013453	GT	3	6	15901	15906	0 %	50 %	50 %	0 %	262260537
49	NC_013453	GA	3	6	16168	16173	50 %	0 %	50 %	0 %	262260537
50	NC_013453	AT	3	6	16590	16595	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538
51	NC_013453	AT	3	6	16702	16707	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538
52	NC_013453	AT	3	6	16716	16721	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538
53	NC_013453	AT	5	10	16874	16883	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538
54	NC_013453	TA	3	6	17033	17038	50 %	50 %	0 %	0 %	262260538

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.