MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 201

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013446	GACATC	2	12	22966	22977	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013446	TGCTTG	2	12	39908	39919	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_013446	GCTTTT	2	12	42865	42876	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_013446	AGCGCT	2	12	91233	91244	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_013446	CCTGCT	2	12	152419	152430	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6	NC_013446	TACGCC	2	12	165389	165400	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_013446	AACTTG	2	12	200261	200272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_013446	TCCTGA	2	12	236048	236059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_013446	GGACGG	2	12	302589	302600	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_013446	ATTGAT	2	12	354464	354475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013446	GGGATG	2	12	371281	371292	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013446	CGGTTG	2	12	439405	439416	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_013446	CCTAAA	2	12	449429	449440	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_013446	CGGTTG	2	12	457280	457291	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_013446	TGAATA	2	12	463757	463768	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013446	CAAAGG	2	12	472880	472891	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_013446	CGCTGC	2	12	534786	534797	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013446	ATTGCT	2	12	604727	604738	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_013446	GTTCTA	2	12	680572	680583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_013446	TGGTTC	2	12	780945	780956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_013446	TCCGCC	2	12	839241	839252	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_013446	ATAACC	2	12	841045	841056	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_013446	GGGCAA	2	12	845788	845799	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_013446	GCACCT	2	12	859274	859285	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013446	GCTCAT	2	12	952491	952502	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_013446	GCAGGA	2	12	987536	987547	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_013446	CAGGCA	2	12	993561	993572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_013446	CGGCGC	2	12	1019507	1019518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013446	GCTGTC	2	12	1072119	1072130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_013446	CACTCT	2	12	1094584	1094595	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013446	GGTCAG	2	12	1120509	1120520	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_013446	TATGAA	2	12	1148058	1148069	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013446	CCTCAC	2	12	1213712	1213723	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_013446	GGGTGA	2	12	1251190	1251201	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013446	GACGAA	2	12	1266134	1266145	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_013446	CGGGTC	2	12	1281922	1281933	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_013446	CAAAAA	2	12	1283021	1283032	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_013446	ATGGAT	2	12	1298323	1298334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013446	CTTTTT	2	12	1352628	1352639	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_013446	GGCAAG	2	12	1463893	1463904	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_013446	GCATCG	2	12	1527946	1527957	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_013446	CTTGGA	2	12	1557883	1557894	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_013446	CCTTCC	2	12	1593468	1593479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_013446	GTTGAC	2	12	1603738	1603749	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_013446	AGTTGC	2	12	1638142	1638153	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_013446	CCTCAT	2	12	1669288	1669299	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_013446	CCCCTA	2	12	1726415	1726426	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_013446	GGGCTG	2	12	1743196	1743207	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_013446	TGTGGC	2	12	1774843	1774854	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_013446	ACCCGC	2	12	1805197	1805208	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_013446	GATCCG	2	12	1812937	1812948	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_013446	GCCCCG	2	12	1846879	1846890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_013446	CAAGCA	2	12	1873867	1873878	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_013446	GCGCGA	2	12	1892699	1892710	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_013446	CGCTCT	2	12	1894301	1894312	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_013446	CGAATC	2	12	1894670	1894681	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_013446	CTGAAT	2	12	1897524	1897535	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_013446	CGTGTG	2	12	1899165	1899176	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_013446	CATGTG	4	24	1899177	1899200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_013446	TCCTGG	2	12	1905351	1905362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_013446	CGGAAG	2	12	1919988	1919999	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_013446	ATTTGA	2	12	1958898	1958909	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_013446	CCGGGT	2	12	1965382	1965393	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_013446	GGGAAG	2	12	1992236	1992247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_013446	TATCAG	2	12	1992772	1992783	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_013446	TGCGGC	2	12	2074681	2074692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_013446	CGAGGA	2	12	2139807	2139818	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_013446	AGCCCA	2	12	2150473	2150484	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_013446	CTTCGT	2	12	2150739	2150750	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_013446	ATGTGA	2	12	2159813	2159824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_013446	GTGCAG	2	12	2162895	2162906	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_013446	TAGCGT	2	12	2173264	2173275	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_013446	CTGCAA	2	12	2194199	2194210	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_013446	GCGCCA	2	12	2202044	2202055	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
75	NC_013446	GACTTT	2	12	2367561	2367572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_013446	GGGGCC	2	12	2418084	2418095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_013446	GTTTTT	2	12	2425439	2425450	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013446	TTGATA	2	12	2457713	2457724	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_013446	CTTTTT	2	12	2487777	2487788	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_013446	CTGACG	2	12	2518825	2518836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_013446	CAGGCT	2	12	2546445	2546456	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_013446	TCAGGC	2	12	2555622	2555633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_013446	GCTTGA	2	12	2574802	2574813	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_013446	ACTCGC	5	30	2577402	2577431	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
85	NC_013446	ACTAGC	4	24	2577432	2577455	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_013446	CATTCG	2	12	2591174	2591185	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_013446	ACAAGA	2	12	2598885	2598896	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_013446	GCAGCC	2	12	2622772	2622783	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
89	NC_013446	AAAGGA	2	12	2625555	2625566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_013446	TGCCGG	2	12	2653844	2653855	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_013446	CCTGAG	2	12	2683446	2683457	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_013446	CAGGAA	2	12	2690878	2690889	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_013446	ACAAGC	2	12	2711904	2711915	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_013446	CTTTTT	2	12	2774493	2774504	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_013446	GAAATT	2	12	2777475	2777486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013446	TGCAAA	2	12	2778219	2778230	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_013446	CTGCCC	2	12	2778388	2778399	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_013446	CAATGC	2	12	2786029	2786040	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_013446	CATGGT	2	12	2828305	2828316	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_013446	GGTTGC	2	12	2839661	2839672	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_013446	CGATTT	2	12	2941074	2941085	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_013446	GCCAGC	2	12	2956499	2956510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_013446	AGAGCA	2	12	2964938	2964949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_013446	GACAGG	2	12	2967580	2967591	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_013446	GTATCT	2	12	2971297	2971308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_013446	AATTAA	2	12	2972755	2972766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_013446	AGCAAG	2	12	2972788	2972799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_013446	GTCCAA	2	12	2982555	2982566	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_013446	CACCTG	2	12	2985680	2985691	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_013446	CCAGCG	2	12	3003863	3003874	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_013446	TCGTTC	2	12	3036982	3036993	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_013446	TGCACT	2	12	3047894	3047905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_013446	GACATC	2	12	3096662	3096673	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_013446	CACCGC	2	12	3129258	3129269	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_013446	TTTCAA	2	12	3151842	3151853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_013446	GGCAGA	2	12	3174059	3174070	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_013446	TTGCTA	2	12	3181000	3181011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_013446	TGCCTG	2	12	3239614	3239625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_013446	CAGCAA	2	12	3249097	3249108	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_013446	ACGGCA	2	12	3250826	3250837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_013446	CGGCCG	2	12	3259872	3259883	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_013446	TTATAT	2	12	3275471	3275482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_013446	GAACAG	2	12	3275556	3275567	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_013446	ATACCC	2	12	3275570	3275581	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_013446	GCTGCA	2	12	3321323	3321334	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_013446	GCTTTC	2	12	3344738	3344749	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_013446	CACAGC	2	12	3417410	3417421	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013446	CAAAGT	2	12	3438102	3438113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_013446	AGCCCT	2	12	3443084	3443095	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
130	NC_013446	TTATTT	2	12	3448440	3448451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013446	TGCGCT	2	12	3450847	3450858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_013446	TGGGCA	2	12	3454798	3454809	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_013446	CTGCCG	2	12	3466411	3466422	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
134	NC_013446	GTCGGT	2	12	3531466	3531477	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
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136	NC_013446	TGTGCC	2	12	3539265	3539276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013446	TTTGCC	2	12	3551842	3551853	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_013446	ATAGCA	2	12	3599658	3599669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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140	NC_013446	ATGGTG	2	12	3615840	3615851	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_013446	CTTTTT	2	12	3618266	3618277	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_013446	TCGGCG	2	12	3632397	3632408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_013446	GCCTCG	2	12	3699196	3699207	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
144	NC_013446	AGCTAG	2	12	3703235	3703246	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
145	NC_013446	AACTCG	2	12	3709975	3709986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_013446	GGCCCA	2	12	3759934	3759945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
147	NC_013446	AATCGC	2	12	3774566	3774577	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_013446	ATGCCA	2	12	3899093	3899104	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_013446	ACAAAA	2	12	3901600	3901611	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_013446	ACAAGC	2	12	3955027	3955038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_013446	AGGCAC	2	12	3958519	3958530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_013446	CTCAGG	2	12	3970353	3970364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_013446	TTGATA	2	12	4013940	4013951	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
154	NC_013446	ATCACA	2	12	4045185	4045196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_013446	TCTATT	2	12	4053778	4053789	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_013446	TCCCTC	2	12	4064962	4064973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
157	NC_013446	GCCAAA	2	12	4098189	4098200	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_013446	TTGATT	2	12	4101740	4101751	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
159	NC_013446	GGGCCT	2	12	4143773	4143784	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_013446	CATAGG	2	12	4192539	4192550	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_013446	AGGGAA	2	12	4216172	4216183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_013446	GGGGGA	2	12	4283133	4283144	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_013446	TTTTGT	2	12	4354225	4354236	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_013446	TTTGCG	2	12	5048783	5048794	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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200	NC_013446	AAATTT	2	12	5341879	5341890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_013446	TGGCGC	2	12	5370371	5370382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.