MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 3986

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013446	CAGGC	2	10	26	35	20 %	0 %	40 %	40 %	264676137
2	NC_013446	CTGGA	2	10	172	181	20 %	20 %	40 %	20 %	264676137
3	NC_013446	ACCAC	2	10	1301	1310	40 %	0 %	0 %	60 %	264676137
4	NC_013446	GCCCT	2	10	1529	1538	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_013446	GCCTG	2	10	2122	2131	0 %	20 %	40 %	40 %	264676138
6	NC_013446	GTGCT	2	10	3772	3781	0 %	40 %	40 %	20 %	264676139
7	NC_013446	CGGCC	2	10	4650	4659	0 %	0 %	40 %	60 %	264676139
8	NC_013446	GCGCG	2	10	7280	7289	0 %	0 %	60 %	40 %	264676142
9	NC_013446	GCGCG	2	10	7424	7433	0 %	0 %	60 %	40 %	264676142
10	NC_013446	GCGCC	2	10	8135	8144	0 %	0 %	40 %	60 %	264676143
11	NC_013446	GCCGC	3	15	9060	9074	0 %	0 %	40 %	60 %	264676144
12	NC_013446	CGCGC	2	10	10387	10396	0 %	0 %	40 %	60 %	264676145
13	NC_013446	TCGCG	2	10	10701	10710	0 %	20 %	40 %	40 %	264676145
14	NC_013446	TGCGC	2	10	11405	11414	0 %	20 %	40 %	40 %	264676146
15	NC_013446	AGGCC	2	10	14368	14377	20 %	0 %	40 %	40 %	264676149
16	NC_013446	GCGCC	2	10	15953	15962	0 %	0 %	40 %	60 %	264676150
17	NC_013446	ATCGG	2	10	16532	16541	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_013446	GCGCC	2	10	17005	17014	0 %	0 %	40 %	60 %	264676151
19	NC_013446	TGCGC	2	10	18928	18937	0 %	20 %	40 %	40 %	264676152
20	NC_013446	TGGGT	2	10	19054	19063	0 %	40 %	60 %	0 %	264676152
21	NC_013446	GCGCG	2	10	20096	20105	0 %	0 %	60 %	40 %	264676153
22	NC_013446	CAGCC	2	10	22247	22256	20 %	0 %	20 %	60 %	264676155
23	NC_013446	GCTGC	2	10	22735	22744	0 %	20 %	40 %	40 %	264676155
24	NC_013446	GAAAT	2	10	23017	23026	60 %	20 %	20 %	0 %	264676156
25	NC_013446	ACACC	2	10	23985	23994	40 %	0 %	0 %	60 %	264676157
26	NC_013446	CTCGC	2	10	25660	25669	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
27	NC_013446	GCGCG	2	10	30381	30390	0 %	0 %	60 %	40 %	264676161
28	NC_013446	CGATC	2	10	30634	30643	20 %	20 %	20 %	40 %	264676161
29	NC_013446	TGCGC	2	10	33149	33158	0 %	20 %	40 %	40 %	264676162
30	NC_013446	CGGTG	2	10	33689	33698	0 %	20 %	60 %	20 %	264676162
31	NC_013446	GCCCA	2	10	33794	33803	20 %	0 %	20 %	60 %	264676162
32	NC_013446	GGGTC	2	10	34794	34803	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_013446	GTGCT	2	10	36321	36330	0 %	40 %	40 %	20 %	264676163
34	NC_013446	GCGAG	2	10	37169	37178	20 %	0 %	60 %	20 %	264676164
35	NC_013446	TGGGT	2	10	37613	37622	0 %	40 %	60 %	0 %	264676165
36	NC_013446	AGCGC	2	10	40377	40386	20 %	0 %	40 %	40 %	264676167
37	NC_013446	CGGTG	2	10	40425	40434	0 %	20 %	60 %	20 %	264676167
38	NC_013446	CGGCG	2	10	40491	40500	0 %	0 %	60 %	40 %	264676167
39	NC_013446	TGGTG	2	10	41169	41178	0 %	40 %	60 %	0 %	264676169
40	NC_013446	CGTCG	2	10	42030	42039	0 %	20 %	40 %	40 %	264676169
41	NC_013446	TCCGT	2	10	44603	44612	0 %	40 %	20 %	40 %	264676171
42	NC_013446	GGAGA	2	10	44819	44828	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013446	GCAGG	2	10	45147	45156	20 %	0 %	60 %	20 %	264676172
44	NC_013446	GGTGT	2	10	47908	47917	0 %	40 %	60 %	0 %	264676174
45	NC_013446	CTGGC	2	10	48678	48687	0 %	20 %	40 %	40 %	264676175
46	NC_013446	CCCGG	2	10	48836	48845	0 %	0 %	40 %	60 %	264676175
47	NC_013446	AGCAG	2	10	50508	50517	40 %	0 %	40 %	20 %	264676178
48	NC_013446	CATGG	2	10	51525	51534	20 %	20 %	40 %	20 %	264676179
49	NC_013446	AGCGC	2	10	57723	57732	20 %	0 %	40 %	40 %	264676185
50	NC_013446	CATCG	2	10	60799	60808	20 %	20 %	20 %	40 %	264676189
51	NC_013446	AAGGC	2	10	61467	61476	40 %	0 %	40 %	20 %	264676189
52	NC_013446	GCACC	2	10	61756	61765	20 %	0 %	20 %	60 %	264676190
53	NC_013446	GGCAT	2	10	63477	63486	20 %	20 %	40 %	20 %	264676191
54	NC_013446	AGGGC	2	10	64485	64494	20 %	0 %	60 %	20 %	264676192
55	NC_013446	TGGCG	2	10	65061	65070	0 %	20 %	60 %	20 %	264676192
56	NC_013446	GCAGC	2	10	65271	65280	20 %	0 %	40 %	40 %	264676192
57	NC_013446	TGAAC	2	10	66088	66097	40 %	20 %	20 %	20 %	264676194
58	NC_013446	GCCGC	2	10	66404	66413	0 %	0 %	40 %	60 %	264676194
59	NC_013446	GCCGA	2	10	67511	67520	20 %	0 %	40 %	40 %	264676196
60	NC_013446	CGTAG	2	10	68037	68046	20 %	20 %	40 %	20 %	264676196
61	NC_013446	AGCTG	2	10	68556	68565	20 %	20 %	40 %	20 %	264676196
62	NC_013446	GCCGG	2	10	68594	68603	0 %	0 %	60 %	40 %	264676196
63	NC_013446	CCGCG	2	10	69544	69553	0 %	0 %	40 %	60 %	264676197
64	NC_013446	CCCAG	2	10	72504	72513	20 %	0 %	20 %	60 %	264676201
65	NC_013446	GGCAA	2	10	80179	80188	40 %	0 %	40 %	20 %	264676207
66	NC_013446	ACTGG	2	10	80737	80746	20 %	20 %	40 %	20 %	264676207
67	NC_013446	CGCTG	2	10	83830	83839	0 %	20 %	40 %	40 %	264676211
68	NC_013446	GGCGT	2	10	83916	83925	0 %	20 %	60 %	20 %	264676211
69	NC_013446	CCATG	2	10	86714	86723	20 %	20 %	20 %	40 %	264676214
70	NC_013446	GCCTT	2	10	88114	88123	0 %	40 %	20 %	40 %	264676216
71	NC_013446	GTCTT	2	10	89709	89718	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_013446	GCAGG	2	10	91398	91407	20 %	0 %	60 %	20 %	264676219
73	NC_013446	CGGCG	2	10	92793	92802	0 %	0 %	60 %	40 %	264676221
74	NC_013446	GGCAT	2	10	92807	92816	20 %	20 %	40 %	20 %	264676221
75	NC_013446	CCGTC	2	10	93551	93560	0 %	20 %	20 %	60 %	264676222
76	NC_013446	CAGCT	2	10	95848	95857	20 %	20 %	20 %	40 %	264676223
77	NC_013446	TGCGG	2	10	96184	96193	0 %	20 %	60 %	20 %	264676223
78	NC_013446	CATCG	2	10	96692	96701	20 %	20 %	20 %	40 %	264676224
79	NC_013446	GCCGC	2	10	97625	97634	0 %	0 %	40 %	60 %	264676224
80	NC_013446	GATGG	2	10	98511	98520	20 %	20 %	60 %	0 %	264676225
81	NC_013446	CTGGG	2	10	99168	99177	0 %	20 %	60 %	20 %	264676225
82	NC_013446	GCCGG	2	10	100044	100053	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
83	NC_013446	CATGG	2	10	103148	103157	20 %	20 %	40 %	20 %	264676228
84	NC_013446	TGCAG	2	10	103648	103657	20 %	20 %	40 %	20 %	264676229
85	NC_013446	GATTG	2	10	105111	105120	20 %	40 %	40 %	0 %	264676230
86	NC_013446	GGGTG	2	10	108410	108419	0 %	20 %	80 %	0 %	264676233
87	NC_013446	GCGCG	2	10	111407	111416	0 %	0 %	60 %	40 %	264676235
88	NC_013446	GGGCA	2	10	111903	111912	20 %	0 %	60 %	20 %	264676236
89	NC_013446	CACAT	2	10	112246	112255	40 %	20 %	0 %	40 %	264676236
90	NC_013446	TGGCC	2	10	113788	113797	0 %	20 %	40 %	40 %	264676237
91	NC_013446	TGCCT	2	10	114383	114392	0 %	40 %	20 %	40 %	264676237
92	NC_013446	GATGA	2	10	114483	114492	40 %	20 %	40 %	0 %	264676237
93	NC_013446	TCGGC	2	10	114674	114683	0 %	20 %	40 %	40 %	264676238
94	NC_013446	CGCAG	2	10	115609	115618	20 %	0 %	40 %	40 %	264676239
95	NC_013446	GCCCA	2	10	116418	116427	20 %	0 %	20 %	60 %	264676240
96	NC_013446	TCGGC	2	10	116758	116767	0 %	20 %	40 %	40 %	264676240
97	NC_013446	ACCTC	2	10	118322	118331	20 %	20 %	0 %	60 %	264676241
98	NC_013446	GCCGT	2	10	119461	119470	0 %	20 %	40 %	40 %	264676242
99	NC_013446	ATGGC	2	10	119539	119548	20 %	20 %	40 %	20 %	264676242
100	NC_013446	GGGCG	2	10	119844	119853	0 %	0 %	80 %	20 %	264676243
101	NC_013446	GGCAG	2	10	119888	119897	20 %	0 %	60 %	20 %	264676243
102	NC_013446	TGGCG	2	10	121458	121467	0 %	20 %	60 %	20 %	264676244
103	NC_013446	CAAAA	2	10	123179	123188	80 %	0 %	0 %	20 %	264676245
104	NC_013446	GATCT	2	10	125533	125542	20 %	40 %	20 %	20 %	264676247
105	NC_013446	GCGCT	2	10	127332	127341	0 %	20 %	40 %	40 %	264676249
106	NC_013446	GCCAT	2	10	127435	127444	20 %	20 %	20 %	40 %	264676249
107	NC_013446	GGGGC	2	10	132241	132250	0 %	0 %	80 %	20 %	264676255
108	NC_013446	AGCGC	2	10	133046	133055	20 %	0 %	40 %	40 %	264676255
109	NC_013446	ATGCA	2	10	133110	133119	40 %	20 %	20 %	20 %	264676255
110	NC_013446	AGGCC	2	10	141624	141633	20 %	0 %	40 %	40 %	264676262
111	NC_013446	TTTGG	2	10	143957	143966	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_013446	GGGCA	2	10	147092	147101	20 %	0 %	60 %	20 %	264676265
113	NC_013446	GCCAG	2	10	147604	147613	20 %	0 %	40 %	40 %	264676265
114	NC_013446	TGCCG	2	10	151577	151586	0 %	20 %	40 %	40 %	264676269
115	NC_013446	GTGGG	2	10	153169	153178	0 %	20 %	80 %	0 %	264676270
116	NC_013446	GGGCG	2	10	153485	153494	0 %	0 %	80 %	20 %	264676270
117	NC_013446	GCGCG	2	10	153849	153858	0 %	0 %	60 %	40 %	264676270
118	NC_013446	GCTGG	2	10	154166	154175	0 %	20 %	60 %	20 %	264676271
119	NC_013446	GCAGA	2	10	154395	154404	40 %	0 %	40 %	20 %	264676271
120	NC_013446	GCACG	2	10	156938	156947	20 %	0 %	40 %	40 %	264676273
121	NC_013446	ACCAC	2	10	157648	157657	40 %	0 %	0 %	60 %	264676274
122	NC_013446	GCAGC	2	10	158082	158091	20 %	0 %	40 %	40 %	264676274
123	NC_013446	ACGCC	2	10	160791	160800	20 %	0 %	20 %	60 %	264676276
124	NC_013446	GCGCG	2	10	163262	163271	0 %	0 %	60 %	40 %	264676279
125	NC_013446	TCTGG	2	10	163602	163611	0 %	40 %	40 %	20 %	264676280
126	NC_013446	CAGCT	2	10	163852	163861	20 %	20 %	20 %	40 %	264676281
127	NC_013446	CAGCG	2	10	168293	168302	20 %	0 %	40 %	40 %	264676285
128	NC_013446	TTCGC	2	10	170999	171008	0 %	40 %	20 %	40 %	264676288
129	NC_013446	CCAGC	2	10	171076	171085	20 %	0 %	20 %	60 %	264676288
130	NC_013446	GCACG	2	10	173991	174000	20 %	0 %	40 %	40 %	264676290
131	NC_013446	GGCTC	2	10	174378	174387	0 %	20 %	40 %	40 %	264676290
132	NC_013446	CCGGG	2	10	175693	175702	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_013446	GCACA	2	10	176055	176064	40 %	0 %	20 %	40 %	264676291
134	NC_013446	TGTTC	2	10	176387	176396	0 %	60 %	20 %	20 %	264676291
135	NC_013446	GCGCG	2	10	178000	178009	0 %	0 %	60 %	40 %	264676293
136	NC_013446	AGGAC	2	10	181790	181799	40 %	0 %	40 %	20 %	264676296
137	NC_013446	AGGCG	2	10	182483	182492	20 %	0 %	60 %	20 %	264676297
138	NC_013446	CGTGG	2	10	183125	183134	0 %	20 %	60 %	20 %	264676298
139	NC_013446	TGCGC	2	10	183885	183894	0 %	20 %	40 %	40 %	264676299
140	NC_013446	TGGCC	2	10	186799	186808	0 %	20 %	40 %	40 %	264676301
141	NC_013446	GGCCA	2	10	187430	187439	20 %	0 %	40 %	40 %	264676302
142	NC_013446	CCGAG	2	10	188500	188509	20 %	0 %	40 %	40 %	264676302
143	NC_013446	CAGCT	2	10	188621	188630	20 %	20 %	20 %	40 %	264676303
144	NC_013446	GCCGC	2	10	188733	188742	0 %	0 %	40 %	60 %	264676303
145	NC_013446	CAGGC	2	10	192241	192250	20 %	0 %	40 %	40 %	264676305
146	NC_013446	ATGCC	2	10	192585	192594	20 %	20 %	20 %	40 %	264676306
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150	NC_013446	GCCTG	2	10	198251	198260	0 %	20 %	40 %	40 %	264676310
151	NC_013446	GCCAC	2	10	198485	198494	20 %	0 %	20 %	60 %	264676310
152	NC_013446	AGCCA	2	10	198939	198948	40 %	0 %	20 %	40 %	264676311
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157	NC_013446	AGCCA	2	10	205344	205353	40 %	0 %	20 %	40 %	264676315
158	NC_013446	GCTGC	2	10	205485	205494	0 %	20 %	40 %	40 %	264676315
159	NC_013446	CGCTC	2	10	206998	207007	0 %	20 %	20 %	60 %	264676316
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162	NC_013446	GCCGC	2	10	209436	209445	0 %	0 %	40 %	60 %	264676318
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164	NC_013446	GCAGT	2	10	211440	211449	20 %	20 %	40 %	20 %	264676320
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166	NC_013446	CCGTA	2	10	214604	214613	20 %	20 %	20 %	40 %	264676323
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168	NC_013446	CGCTG	2	10	216128	216137	0 %	20 %	40 %	40 %	264676324
169	NC_013446	CGGTG	2	10	223099	223108	0 %	20 %	60 %	20 %	264676329
170	NC_013446	TTGGC	2	10	224295	224304	0 %	40 %	40 %	20 %	264676330
171	NC_013446	GCACC	2	10	225110	225119	20 %	0 %	20 %	60 %	264676331
172	NC_013446	GCGGG	2	10	225202	225211	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
173	NC_013446	GCCGG	2	10	225571	225580	0 %	0 %	60 %	40 %	264676332
174	NC_013446	TCATG	2	10	226437	226446	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
175	NC_013446	GCAGC	2	10	226648	226657	20 %	0 %	40 %	40 %	264676333
176	NC_013446	GATCA	2	10	226803	226812	40 %	20 %	20 %	20 %	264676333
177	NC_013446	CGTGG	2	10	227034	227043	0 %	20 %	60 %	20 %	264676333
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179	NC_013446	CGGAC	2	10	233226	233235	20 %	0 %	40 %	40 %	264676337
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183	NC_013446	GCCAG	2	10	238543	238552	20 %	0 %	40 %	40 %	264676342
184	NC_013446	GGCCG	2	10	240711	240720	0 %	0 %	60 %	40 %	264676344
185	NC_013446	CCCGG	2	10	241735	241744	0 %	0 %	40 %	60 %	264676345
186	NC_013446	CTGGG	2	10	242933	242942	0 %	20 %	60 %	20 %	264676346
187	NC_013446	GCCAG	2	10	247102	247111	20 %	0 %	40 %	40 %	264676349
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189	NC_013446	GTGCG	2	10	250256	250265	0 %	20 %	60 %	20 %	264676352
190	NC_013446	TCAAG	2	10	252598	252607	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
191	NC_013446	CTCCA	2	10	252733	252742	20 %	20 %	0 %	60 %	264676355
192	NC_013446	CGCGC	2	10	253501	253510	0 %	0 %	40 %	60 %	264676355
193	NC_013446	CGGCG	2	10	253983	253992	0 %	0 %	60 %	40 %	264676356
194	NC_013446	GCGCA	2	10	256889	256898	20 %	0 %	40 %	40 %	264676359
195	NC_013446	GCTGG	2	10	257188	257197	0 %	20 %	60 %	20 %	264676359
196	NC_013446	GCGCC	2	10	257366	257375	0 %	0 %	40 %	60 %	264676360
197	NC_013446	TCGGC	2	10	257833	257842	0 %	20 %	40 %	40 %	264676360
198	NC_013446	TGACC	2	10	258155	258164	20 %	20 %	20 %	40 %	264676360
199	NC_013446	GACCA	2	10	259360	259369	40 %	0 %	20 %	40 %	264676361
200	NC_013446	AGCTC	2	10	259613	259622	20 %	20 %	20 %	40 %	264676361
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211	NC_013446	GGCCC	2	10	284823	284832	0 %	0 %	40 %	60 %	264676383
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225	NC_013446	CATGG	2	10	302269	302278	20 %	20 %	40 %	20 %	264676404
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227	NC_013446	GCGGA	2	10	302950	302959	20 %	0 %	60 %	20 %	264676405
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236	NC_013446	TGTTT	2	10	309684	309693	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
237	NC_013446	TGCTT	2	10	309760	309769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
238	NC_013446	GCCGC	2	10	310292	310301	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
239	NC_013446	GCGCC	2	10	315539	315548	0 %	0 %	40 %	60 %	264676415
240	NC_013446	TCGGC	2	10	315838	315847	0 %	20 %	40 %	40 %	264676415
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248	NC_013446	GGCCG	2	10	327309	327318	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
249	NC_013446	GAATG	2	10	327380	327389	40 %	20 %	40 %	0 %	264676426
250	NC_013446	GCCCA	2	10	329360	329369	20 %	0 %	20 %	60 %	264676428
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252	NC_013446	TGGCT	2	10	332035	332044	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_013446	GCGCA	2	10	332126	332135	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
254	NC_013446	CTGGG	2	10	332361	332370	0 %	20 %	60 %	20 %	264676431
255	NC_013446	GCCGC	2	10	332933	332942	0 %	0 %	40 %	60 %	264676432
256	NC_013446	GCTGC	2	10	333003	333012	0 %	20 %	40 %	40 %	264676432
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260	NC_013446	TGAAG	2	10	337222	337231	40 %	20 %	40 %	0 %	264676438
261	NC_013446	CGTCC	2	10	337277	337286	0 %	20 %	20 %	60 %	264676438
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263	NC_013446	TCGCG	2	10	339519	339528	0 %	20 %	40 %	40 %	264676439
264	NC_013446	AAAAG	2	10	339914	339923	80 %	0 %	20 %	0 %	264676440
265	NC_013446	AGGCC	2	10	342337	342346	20 %	0 %	40 %	40 %	264676443
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267	NC_013446	CGCGG	2	10	343287	343296	0 %	0 %	60 %	40 %	264676445
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