MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Comamonas testosteroni CNB-2 chromosome

Total Repeats: 76799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013446	ATG	2	6	20	25	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676137
2	NC_013446	AGC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
3	NC_013446	AGA	2	6	126	131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
4	NC_013446	GTT	2	6	277	282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676137
5	NC_013446	CCT	2	6	298	303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676137
6	NC_013446	CAG	2	6	313	318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
7	NC_013446	GCC	2	6	460	465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676137
8	NC_013446	GCT	2	6	567	572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
9	NC_013446	CGA	2	6	660	665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
10	NC_013446	CTG	3	9	694	702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
11	NC_013446	CGA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
12	NC_013446	TTC	2	6	718	723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
13	NC_013446	CAA	2	6	726	731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676137
14	NC_013446	GAA	2	6	745	750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
15	NC_013446	TTC	2	6	751	756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
16	NC_013446	CTG	2	6	772	777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
17	NC_013446	AAG	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
18	NC_013446	TGA	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676137
19	NC_013446	GCC	2	6	888	893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676137
20	NC_013446	CAA	2	6	924	929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676137
21	NC_013446	CTT	2	6	969	974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676137
22	NC_013446	AGA	2	6	1142	1147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
23	NC_013446	ACT	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676137
24	NC_013446	AAG	2	6	1192	1197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676137
25	NC_013446	CGG	2	6	1290	1295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676137
26	NC_013446	TGC	2	6	1313	1318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676137
27	NC_013446	CAG	2	6	1369	1374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676137
28	NC_013446	GCC	2	6	1660	1665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676138
29	NC_013446	AAG	2	6	1698	1703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676138
30	NC_013446	CAC	2	6	1754	1759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676138
31	NC_013446	GCG	2	6	1771	1776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
32	NC_013446	CAC	3	9	1790	1798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676138
33	NC_013446	GCA	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676138
34	NC_013446	GAT	2	6	1880	1885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676138
35	NC_013446	GGC	2	6	1893	1898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
36	NC_013446	CCG	2	6	1927	1932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676138
37	NC_013446	CTG	2	6	2007	2012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
38	NC_013446	CTA	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676138
39	NC_013446	TCG	2	6	2074	2079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
40	NC_013446	TGG	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676138
41	NC_013446	CTG	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
42	NC_013446	GCG	2	6	2230	2235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
43	NC_013446	CAA	2	6	2267	2272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676138
44	NC_013446	GGC	2	6	2292	2297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676138
45	NC_013446	GCT	2	6	2396	2401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
46	NC_013446	CAT	2	6	2423	2428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676138
47	NC_013446	CAA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676138
48	NC_013446	CGT	2	6	2687	2692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676138
49	NC_013446	CCG	2	6	2891	2896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
50	NC_013446	GGC	2	6	2905	2910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
51	NC_013446	CAC	2	6	3007	3012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
52	NC_013446	CGA	2	6	3042	3047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
53	NC_013446	CGA	2	6	3066	3071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
54	NC_013446	GAC	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
55	NC_013446	CGG	2	6	3210	3215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
56	NC_013446	GGC	2	6	3247	3252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
57	NC_013446	AAC	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
58	NC_013446	GAC	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
59	NC_013446	CGG	2	6	3603	3608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
60	NC_013446	TCA	2	6	3629	3634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
61	NC_013446	AAG	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
62	NC_013446	CAC	2	6	3660	3665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
63	NC_013446	GGC	2	6	3703	3708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
64	NC_013446	CAA	2	6	3786	3791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
65	NC_013446	CGG	2	6	3807	3812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
66	NC_013446	AAG	2	6	3886	3891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
67	NC_013446	CGA	2	6	3912	3917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
68	NC_013446	GAA	2	6	4060	4065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676139
69	NC_013446	ACG	2	6	4073	4078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
70	NC_013446	ATC	2	6	4099	4104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
71	NC_013446	AGC	2	6	4125	4130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
72	NC_013446	CGC	2	6	4153	4158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
73	NC_013446	TCG	2	6	4241	4246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
74	NC_013446	CCG	2	6	4256	4261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
75	NC_013446	GCT	2	6	4356	4361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
76	NC_013446	ATC	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
77	NC_013446	AGC	3	9	4438	4446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
78	NC_013446	GAC	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
79	NC_013446	ACC	2	6	4475	4480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
80	NC_013446	CAT	4	12	4482	4493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676139
81	NC_013446	CTG	3	9	4531	4539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
82	NC_013446	CTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676139
83	NC_013446	GCC	2	6	4599	4604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
84	NC_013446	CAA	2	6	4662	4667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676139
85	NC_013446	CGG	2	6	4710	4715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676139
86	NC_013446	GCC	2	6	4774	4779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
87	NC_013446	ACC	3	9	4921	4929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
88	NC_013446	CCG	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
89	NC_013446	GCC	2	6	4994	4999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
90	NC_013446	CAC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
91	NC_013446	CGC	2	6	5061	5066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
92	NC_013446	CGA	2	6	5073	5078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
93	NC_013446	TCG	2	6	5090	5095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
94	NC_013446	CTG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
95	NC_013446	CAC	2	6	5208	5213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
96	NC_013446	AGC	2	6	5255	5260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
97	NC_013446	ACC	2	6	5269	5274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676139
98	NC_013446	CTG	2	6	5296	5301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676139
99	NC_013446	CGA	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676139
100	NC_013446	CGC	2	6	5374	5379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676139
101	NC_013446	AGG	2	6	5470	5475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676140
102	NC_013446	TTG	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	264676140
103	NC_013446	GCT	2	6	5522	5527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676140
104	NC_013446	GCC	2	6	5647	5652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676140
105	NC_013446	CTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	264676140
106	NC_013446	TGC	2	6	5839	5844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676140
107	NC_013446	CAT	2	6	5894	5899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676140
108	NC_013446	CGC	2	6	5984	5989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
109	NC_013446	TGA	2	6	6067	6072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	264676141
110	NC_013446	GCT	2	6	6135	6140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676141
111	NC_013446	CCT	2	6	6190	6195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676141
112	NC_013446	GCA	2	6	6213	6218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
113	NC_013446	CAG	2	6	6248	6253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
114	NC_013446	CGC	2	6	6368	6373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
115	NC_013446	CGC	2	6	6383	6388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
116	NC_013446	GCG	2	6	6415	6420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676141
117	NC_013446	CCG	2	6	6499	6504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676141
118	NC_013446	AAC	2	6	6528	6533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676141
119	NC_013446	TGC	2	6	6558	6563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676141
120	NC_013446	CAG	2	6	6758	6763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676141
121	NC_013446	TCC	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	264676141
122	NC_013446	GGA	2	6	6792	6797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	264676141
123	NC_013446	CAA	2	6	6805	6810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	264676141
124	NC_013446	GCC	2	6	6978	6983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	264676142
125	NC_013446	GAA	2	6	7032	7037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676142
126	NC_013446	GGC	2	6	7092	7097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676142
127	NC_013446	CCA	2	6	7127	7132	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676142
128	NC_013446	CGT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676142
129	NC_013446	TGG	2	6	7244	7249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	264676142
130	NC_013446	CGA	2	6	7290	7295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676142
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135	NC_013446	GCA	2	6	7418	7423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	264676142
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256	NC_013446	GCT	2	6	14120	14125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676148
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376	NC_013446	CCA	2	6	20335	20340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	264676153
377	NC_013446	TCA	2	6	20356	20361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	264676153
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380	NC_013446	GAA	2	6	20483	20488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	264676153
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383	NC_013446	GCT	2	6	20536	20541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	264676153
384	NC_013446	CGG	2	6	20573	20578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	264676153
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