MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	CACCTC	3	18	254	271	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	262118101
2	NC_013442	GGCCAC	2	12	3495	3506	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262118105
3	NC_013442	CATCCC	2	12	4058	4069	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	262118106
4	NC_013442	GTTGAG	2	12	7504	7515	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	262118110
5	NC_013442	CCGTTG	2	12	7844	7855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	262118110
6	NC_013442	GCGGTC	2	12	9396	9407	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262118112
7	NC_013442	CAGATC	2	12	14607	14618	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	262118116
8	NC_013442	GACTGA	2	12	15287	15298	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262118116
9	NC_013442	CGGCGA	2	12	17676	17687	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262118118
10	NC_013442	CCGCGA	2	12	17892	17903	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262118118
11	NC_013442	GGGTCG	2	12	18540	18551	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	262118118
12	NC_013442	GGCGCT	2	12	19936	19947	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262118119
13	NC_013442	GAGGTC	2	12	22326	22337	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262118123
14	NC_013442	GCGCAG	2	12	22907	22918	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262118126
15	NC_013442	AGCGTC	2	12	25680	25691	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262118130
16	NC_013442	ATGAGG	2	12	33406	33417	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	262118137
17	NC_013442	GATCTT	2	12	35361	35372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	262118139
18	NC_013442	CGAACG	2	12	38174	38185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	262118142
19	NC_013442	GTCGAG	2	12	38382	38393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262118142
20	NC_013442	GGTGAT	2	12	38418	38429	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	262118142
21	NC_013442	GAGGTT	2	12	38466	38477	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	262118142
22	NC_013442	CGATGA	2	12	42984	42995	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262118146
23	NC_013442	GGCGAA	2	12	45442	45453	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	262118150
24	NC_013442	CAATCA	2	12	50445	50456	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	262118158
25	NC_013442	CCGACA	2	12	52950	52961	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	262118160
26	NC_013442	CCGACA	2	12	52968	52979	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	262118160
27	NC_013442	CCGACG	2	12	52980	52991	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262118160
28	NC_013442	CCGTCG	2	12	53777	53788	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	262118161
29	NC_013442	CCTCAT	2	12	53822	53833	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	262118161
30	NC_013442	CGTAGA	2	12	54861	54872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	262118164
31	NC_013442	GTTGCT	2	12	56590	56601	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	262118166
32	NC_013442	GCCGAG	2	12	58616	58627	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	262118168
33	NC_013442	CTCGAC	2	12	58715	58726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	262118168
34	NC_013442	GTCGCG	2	12	59485	59496	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	262118168
35	NC_013442	ACGCCG	2	12	59805	59816	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262118168
36	NC_013442	CCGACC	2	12	60996	61007	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	262118168
37	NC_013442	GCACCA	2	12	62670	62681	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	262118168
38	NC_013442	CCCGAC	2	12	62693	62704	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	262118168
39	NC_013442	GGCGCG	2	12	63057	63068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	262118168
40	NC_013442	CGCAGC	2	12	67905	67916	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	262118169
41	NC_013442	GGATCG	2	12	69396	69407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262118169
42	NC_013442	TCGGGT	3	18	71920	71937	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	262118173
43	NC_013442	CGGTGA	2	12	73255	73266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	262118174
44	NC_013442	TCCCGT	2	12	73680	73691	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	262118174
45	NC_013442	TCGGTG	2	12	78190	78201	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	262118179
46	NC_013442	GTCGAT	2	12	78612	78623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	262118179
47	NC_013442	CAGCTT	2	12	79614	79625	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	262118179
48	NC_013442	CACGGT	2	12	80041	80052	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	262118180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.