MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	GCCCG	2	10	2531	2540	0 %	0 %	40 %	60 %	262118102
2	NC_013442	CGGAG	2	10	3705	3714	20 %	0 %	60 %	20 %	262118105
3	NC_013442	CGGCG	2	10	3800	3809	0 %	0 %	60 %	40 %	262118105
4	NC_013442	AGATG	2	10	3863	3872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013442	GTGAT	2	10	4476	4485	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013442	GCGCA	2	10	4826	4835	20 %	0 %	40 %	40 %	262118108
7	NC_013442	GATCA	2	10	4922	4931	40 %	20 %	20 %	20 %	262118108
8	NC_013442	GCCGA	2	10	6017	6026	20 %	0 %	40 %	40 %	262118109
9	NC_013442	CCCGG	2	10	8335	8344	0 %	0 %	40 %	60 %	262118110
10	NC_013442	CAGTG	2	10	8416	8425	20 %	20 %	40 %	20 %	262118110
11	NC_013442	CGACC	2	10	8808	8817	20 %	0 %	20 %	60 %	262118111
12	NC_013442	CACCC	2	10	10493	10502	20 %	0 %	0 %	80 %	262118112
13	NC_013442	AATGC	2	10	11574	11583	40 %	20 %	20 %	20 %	262118113
14	NC_013442	GTTGG	2	10	13537	13546	0 %	40 %	60 %	0 %	262118115
15	NC_013442	GATGA	2	10	15259	15268	40 %	20 %	40 %	0 %	262118116
16	NC_013442	GTGGA	2	10	18561	18570	20 %	20 %	60 %	0 %	262118118
17	NC_013442	GCATC	2	10	19138	19147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_013442	CACGA	2	10	19715	19724	40 %	0 %	20 %	40 %	262118119
19	NC_013442	TGAGG	2	10	21937	21946	20 %	20 %	60 %	0 %	262118122
20	NC_013442	GGCAC	2	10	23073	23082	20 %	0 %	40 %	40 %	262118126
21	NC_013442	CACGC	2	10	24517	24526	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_013442	CGCCC	2	10	25084	25093	0 %	0 %	20 %	80 %	262118130
23	NC_013442	TCGGC	2	10	26088	26097	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_013442	CCACC	2	10	27141	27150	20 %	0 %	0 %	80 %	262118132
25	NC_013442	GCGCG	2	10	30577	30586	0 %	0 %	60 %	40 %	262118134
26	NC_013442	ATTCT	2	10	31506	31515	20 %	60 %	0 %	20 %	262118135
27	NC_013442	GCCAC	2	10	32386	32395	20 %	0 %	20 %	60 %	262118136
28	NC_013442	CGGGA	2	10	37308	37317	20 %	0 %	60 %	20 %	262118142
29	NC_013442	GTGGC	2	10	38308	38317	0 %	20 %	60 %	20 %	262118142
30	NC_013442	GCGCC	2	10	38871	38880	0 %	0 %	40 %	60 %	262118142
31	NC_013442	TTCGC	2	10	39607	39616	0 %	40 %	20 %	40 %	262118142
32	NC_013442	TGTGG	2	10	40106	40115	0 %	40 %	60 %	0 %	262118143
33	NC_013442	CGTTG	2	10	40636	40645	0 %	40 %	40 %	20 %	262118143
34	NC_013442	GTGGG	2	10	40779	40788	0 %	20 %	80 %	0 %	262118143
35	NC_013442	GCTGG	2	10	40995	41004	0 %	20 %	60 %	20 %	262118143
36	NC_013442	CACAC	2	10	41971	41980	40 %	0 %	0 %	60 %	262118145
37	NC_013442	TCGGC	2	10	44194	44203	0 %	20 %	40 %	40 %	262118149
38	NC_013442	GGACC	2	10	44306	44315	20 %	0 %	40 %	40 %	262118149
39	NC_013442	GCCGC	2	10	45300	45309	0 %	0 %	40 %	60 %	262118150
40	NC_013442	GGCGG	2	10	45353	45362	0 %	0 %	80 %	20 %	262118150
41	NC_013442	GCTCA	2	10	46290	46299	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_013442	ACCGC	2	10	46672	46681	20 %	0 %	20 %	60 %	262118152
43	NC_013442	GACCT	2	10	46993	47002	20 %	20 %	20 %	40 %	262118152
44	NC_013442	CGACA	2	10	48835	48844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_013442	CCGGA	2	10	49555	49564	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
46	NC_013442	TGAAG	2	10	49660	49669	40 %	20 %	40 %	0 %	262118157
47	NC_013442	CCCCG	2	10	50967	50976	0 %	0 %	20 %	80 %	262118158
48	NC_013442	GCACC	2	10	52375	52384	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
49	NC_013442	TAGAA	2	10	52563	52572	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013442	GTGCA	2	10	52641	52650	20 %	20 %	40 %	20 %	262118159
51	NC_013442	CCTGA	2	10	53139	53148	20 %	20 %	20 %	40 %	262118160
52	NC_013442	GCGCG	2	10	53427	53436	0 %	0 %	60 %	40 %	262118161
53	NC_013442	CACCC	2	10	54985	54994	20 %	0 %	0 %	80 %	262118164
54	NC_013442	CGACG	2	10	55402	55411	20 %	0 %	40 %	40 %	262118164
55	NC_013442	CCCCG	2	10	56932	56941	0 %	0 %	20 %	80 %	262118167
56	NC_013442	GCCCG	2	10	57870	57879	0 %	0 %	40 %	60 %	262118168
57	NC_013442	GACAT	2	10	57950	57959	40 %	20 %	20 %	20 %	262118168
58	NC_013442	GCGCC	2	10	58972	58981	0 %	0 %	40 %	60 %	262118168
59	NC_013442	GCGCG	2	10	59069	59078	0 %	0 %	60 %	40 %	262118168
60	NC_013442	CGGAC	2	10	60620	60629	20 %	0 %	40 %	40 %	262118168
61	NC_013442	CCGCC	2	10	61075	61084	0 %	0 %	20 %	80 %	262118168
62	NC_013442	ACACC	2	10	61689	61698	40 %	0 %	0 %	60 %	262118168
63	NC_013442	CCGCC	2	10	61968	61977	0 %	0 %	20 %	80 %	262118168
64	NC_013442	CCACC	2	10	63465	63474	20 %	0 %	0 %	80 %	262118168
65	NC_013442	AGCCA	2	10	64298	64307	40 %	0 %	20 %	40 %	262118169
66	NC_013442	CCTTC	2	10	64616	64625	0 %	40 %	0 %	60 %	262118169
67	NC_013442	GTGTG	2	10	66650	66659	0 %	40 %	60 %	0 %	262118169
68	NC_013442	AGACC	2	10	67321	67330	40 %	0 %	20 %	40 %	262118169
69	NC_013442	GCCGT	2	10	67860	67869	0 %	20 %	40 %	40 %	262118169
70	NC_013442	AATCC	2	10	68345	68354	40 %	20 %	0 %	40 %	262118169
71	NC_013442	CCACC	2	10	69048	69057	20 %	0 %	0 %	80 %	262118169
72	NC_013442	TGTTC	2	10	69304	69313	0 %	60 %	20 %	20 %	262118169
73	NC_013442	GTCGG	2	10	69458	69467	0 %	20 %	60 %	20 %	262118169
74	NC_013442	GCCCA	2	10	70419	70428	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
75	NC_013442	ACCGA	2	10	71893	71902	40 %	0 %	20 %	40 %	262118173
76	NC_013442	TCCTT	2	10	74004	74013	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_013442	GAGGT	2	10	74990	74999	20 %	20 %	60 %	0 %	262118176
78	NC_013442	CGCGG	2	10	76058	76067	0 %	0 %	60 %	40 %	262118176
79	NC_013442	CGGCC	2	10	76396	76405	0 %	0 %	40 %	60 %	262118176
80	NC_013442	GGCGC	2	10	77701	77710	0 %	0 %	60 %	40 %	262118178
81	NC_013442	AATCG	2	10	81161	81170	40 %	20 %	20 %	20 %	262118180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.