MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 69

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	GCCCG	2	10	2531	2540	0 %	0 %	40 %	60 %	262118102
2	NC_013442	CGGAG	2	10	3705	3714	20 %	0 %	60 %	20 %	262118105
3	NC_013442	CGGCG	2	10	3800	3809	0 %	0 %	60 %	40 %	262118105
4	NC_013442	GCGCA	2	10	4826	4835	20 %	0 %	40 %	40 %	262118108
5	NC_013442	GATCA	2	10	4922	4931	40 %	20 %	20 %	20 %	262118108
6	NC_013442	GCCGA	2	10	6017	6026	20 %	0 %	40 %	40 %	262118109
7	NC_013442	CCCGG	2	10	8335	8344	0 %	0 %	40 %	60 %	262118110
8	NC_013442	CAGTG	2	10	8416	8425	20 %	20 %	40 %	20 %	262118110
9	NC_013442	CGACC	2	10	8808	8817	20 %	0 %	20 %	60 %	262118111
10	NC_013442	CACCC	2	10	10493	10502	20 %	0 %	0 %	80 %	262118112
11	NC_013442	AATGC	2	10	11574	11583	40 %	20 %	20 %	20 %	262118113
12	NC_013442	GTTGG	2	10	13537	13546	0 %	40 %	60 %	0 %	262118115
13	NC_013442	GATGA	2	10	15259	15268	40 %	20 %	40 %	0 %	262118116
14	NC_013442	GTGGA	2	10	18561	18570	20 %	20 %	60 %	0 %	262118118
15	NC_013442	CACGA	2	10	19715	19724	40 %	0 %	20 %	40 %	262118119
16	NC_013442	TGAGG	2	10	21937	21946	20 %	20 %	60 %	0 %	262118122
17	NC_013442	GGCAC	2	10	23073	23082	20 %	0 %	40 %	40 %	262118126
18	NC_013442	CGCCC	2	10	25084	25093	0 %	0 %	20 %	80 %	262118130
19	NC_013442	CCACC	2	10	27141	27150	20 %	0 %	0 %	80 %	262118132
20	NC_013442	GCGCG	2	10	30577	30586	0 %	0 %	60 %	40 %	262118134
21	NC_013442	ATTCT	2	10	31506	31515	20 %	60 %	0 %	20 %	262118135
22	NC_013442	GCCAC	2	10	32386	32395	20 %	0 %	20 %	60 %	262118136
23	NC_013442	CGGGA	2	10	37308	37317	20 %	0 %	60 %	20 %	262118142
24	NC_013442	GTGGC	2	10	38308	38317	0 %	20 %	60 %	20 %	262118142
25	NC_013442	GCGCC	2	10	38871	38880	0 %	0 %	40 %	60 %	262118142
26	NC_013442	TTCGC	2	10	39607	39616	0 %	40 %	20 %	40 %	262118142
27	NC_013442	TGTGG	2	10	40106	40115	0 %	40 %	60 %	0 %	262118143
28	NC_013442	CGTTG	2	10	40636	40645	0 %	40 %	40 %	20 %	262118143
29	NC_013442	GTGGG	2	10	40779	40788	0 %	20 %	80 %	0 %	262118143
30	NC_013442	GCTGG	2	10	40995	41004	0 %	20 %	60 %	20 %	262118143
31	NC_013442	CACAC	2	10	41971	41980	40 %	0 %	0 %	60 %	262118145
32	NC_013442	TCGGC	2	10	44194	44203	0 %	20 %	40 %	40 %	262118149
33	NC_013442	GGACC	2	10	44306	44315	20 %	0 %	40 %	40 %	262118149
34	NC_013442	GCCGC	2	10	45300	45309	0 %	0 %	40 %	60 %	262118150
35	NC_013442	GGCGG	2	10	45353	45362	0 %	0 %	80 %	20 %	262118150
36	NC_013442	ACCGC	2	10	46672	46681	20 %	0 %	20 %	60 %	262118152
37	NC_013442	GACCT	2	10	46993	47002	20 %	20 %	20 %	40 %	262118152
38	NC_013442	TGAAG	2	10	49660	49669	40 %	20 %	40 %	0 %	262118157
39	NC_013442	CCCCG	2	10	50967	50976	0 %	0 %	20 %	80 %	262118158
40	NC_013442	GTGCA	2	10	52641	52650	20 %	20 %	40 %	20 %	262118159
41	NC_013442	CCTGA	2	10	53139	53148	20 %	20 %	20 %	40 %	262118160
42	NC_013442	GCGCG	2	10	53427	53436	0 %	0 %	60 %	40 %	262118161
43	NC_013442	CACCC	2	10	54985	54994	20 %	0 %	0 %	80 %	262118164
44	NC_013442	CGACG	2	10	55402	55411	20 %	0 %	40 %	40 %	262118164
45	NC_013442	CCCCG	2	10	56932	56941	0 %	0 %	20 %	80 %	262118167
46	NC_013442	GCCCG	2	10	57870	57879	0 %	0 %	40 %	60 %	262118168
47	NC_013442	GACAT	2	10	57950	57959	40 %	20 %	20 %	20 %	262118168
48	NC_013442	GCGCC	2	10	58972	58981	0 %	0 %	40 %	60 %	262118168
49	NC_013442	GCGCG	2	10	59069	59078	0 %	0 %	60 %	40 %	262118168
50	NC_013442	CGGAC	2	10	60620	60629	20 %	0 %	40 %	40 %	262118168
51	NC_013442	CCGCC	2	10	61075	61084	0 %	0 %	20 %	80 %	262118168
52	NC_013442	ACACC	2	10	61689	61698	40 %	0 %	0 %	60 %	262118168
53	NC_013442	CCGCC	2	10	61968	61977	0 %	0 %	20 %	80 %	262118168
54	NC_013442	CCACC	2	10	63465	63474	20 %	0 %	0 %	80 %	262118168
55	NC_013442	AGCCA	2	10	64298	64307	40 %	0 %	20 %	40 %	262118169
56	NC_013442	CCTTC	2	10	64616	64625	0 %	40 %	0 %	60 %	262118169
57	NC_013442	GTGTG	2	10	66650	66659	0 %	40 %	60 %	0 %	262118169
58	NC_013442	AGACC	2	10	67321	67330	40 %	0 %	20 %	40 %	262118169
59	NC_013442	GCCGT	2	10	67860	67869	0 %	20 %	40 %	40 %	262118169
60	NC_013442	AATCC	2	10	68345	68354	40 %	20 %	0 %	40 %	262118169
61	NC_013442	CCACC	2	10	69048	69057	20 %	0 %	0 %	80 %	262118169
62	NC_013442	TGTTC	2	10	69304	69313	0 %	60 %	20 %	20 %	262118169
63	NC_013442	GTCGG	2	10	69458	69467	0 %	20 %	60 %	20 %	262118169
64	NC_013442	ACCGA	2	10	71893	71902	40 %	0 %	20 %	40 %	262118173
65	NC_013442	GAGGT	2	10	74990	74999	20 %	20 %	60 %	0 %	262118176
66	NC_013442	CGCGG	2	10	76058	76067	0 %	0 %	60 %	40 %	262118176
67	NC_013442	CGGCC	2	10	76396	76405	0 %	0 %	40 %	60 %	262118176
68	NC_013442	GGCGC	2	10	77701	77710	0 %	0 %	60 %	40 %	262118178
69	NC_013442	AATCG	2	10	81161	81170	40 %	20 %	20 %	20 %	262118180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.