MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	CCAG	2	8	490	497	25 %	0 %	25 %	50 %	262118101
2	NC_013442	GCCG	2	8	747	754	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
3	NC_013442	GGGT	2	8	1312	1319	0 %	25 %	75 %	0 %	262118101
4	NC_013442	CCGG	2	8	1591	1598	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
5	NC_013442	AGCA	2	8	1779	1786	50 %	0 %	25 %	25 %	262118101
6	NC_013442	GGCC	2	8	2579	2586	0 %	0 %	50 %	50 %	262118102
7	NC_013442	GTCA	2	8	2887	2894	25 %	25 %	25 %	25 %	262118103
8	NC_013442	GGGC	2	8	3152	3159	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9	NC_013442	GACG	2	8	3627	3634	25 %	0 %	50 %	25 %	262118105
10	NC_013442	CCAC	2	8	4284	4291	25 %	0 %	0 %	75 %	262118107
11	NC_013442	CCAC	2	8	4765	4772	25 %	0 %	0 %	75 %	262118108
12	NC_013442	CCTC	2	8	5420	5427	0 %	25 %	0 %	75 %	262118109
13	NC_013442	CCGC	2	8	5460	5467	0 %	0 %	25 %	75 %	262118109
14	NC_013442	CCAA	2	8	5580	5587	50 %	0 %	0 %	50 %	262118109
15	NC_013442	GCAC	2	8	5843	5850	25 %	0 %	25 %	50 %	262118109
16	NC_013442	CCCA	2	8	5956	5963	25 %	0 %	0 %	75 %	262118109
17	NC_013442	CCGC	2	8	6189	6196	0 %	0 %	25 %	75 %	262118109
18	NC_013442	GTCG	2	8	6394	6401	0 %	25 %	50 %	25 %	262118109
19	NC_013442	GGTG	2	8	6490	6497	0 %	25 %	75 %	0 %	262118109
20	NC_013442	CCAC	2	8	6848	6855	25 %	0 %	0 %	75 %	262118110
21	NC_013442	CCGA	2	8	7348	7355	25 %	0 %	25 %	50 %	262118110
22	NC_013442	CCGG	2	8	7556	7563	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
23	NC_013442	TGCC	2	8	7689	7696	0 %	25 %	25 %	50 %	262118110
24	NC_013442	CGAG	2	8	8394	8401	25 %	0 %	50 %	25 %	262118110
25	NC_013442	ATCG	2	8	8492	8499	25 %	25 %	25 %	25 %	262118111
26	NC_013442	CATC	2	8	8675	8682	25 %	25 %	0 %	50 %	262118111
27	NC_013442	TCGC	2	8	9373	9380	0 %	25 %	25 %	50 %	262118112
28	NC_013442	GCAC	2	8	10774	10781	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_013442	CCAA	2	8	10806	10813	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013442	TGCA	2	8	11774	11781	25 %	25 %	25 %	25 %	262118113
31	NC_013442	CGCC	2	8	12349	12356	0 %	0 %	25 %	75 %	262118114
32	NC_013442	GGCC	2	8	12413	12420	0 %	0 %	50 %	50 %	262118114
33	NC_013442	GGAC	2	8	13086	13093	25 %	0 %	50 %	25 %	262118115
34	NC_013442	CATA	2	8	13718	13725	50 %	25 %	0 %	25 %	262118115
35	NC_013442	TCAA	2	8	14315	14322	50 %	25 %	0 %	25 %	262118116
36	NC_013442	TCGA	2	8	14645	14652	25 %	25 %	25 %	25 %	262118116
37	NC_013442	GTCG	2	8	14820	14827	0 %	25 %	50 %	25 %	262118116
38	NC_013442	CCGA	2	8	15074	15081	25 %	0 %	25 %	50 %	262118116
39	NC_013442	CCAT	2	8	15170	15177	25 %	25 %	0 %	50 %	262118116
40	NC_013442	GGCA	2	8	15364	15371	25 %	0 %	50 %	25 %	262118117
41	NC_013442	CACG	2	8	15472	15479	25 %	0 %	25 %	50 %	262118117
42	NC_013442	CATC	2	8	16099	16106	25 %	25 %	0 %	50 %	262118117
43	NC_013442	GGAT	2	8	16463	16470	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013442	CGGA	2	8	17044	17051	25 %	0 %	50 %	25 %	262118118
45	NC_013442	CGGG	2	8	17494	17501	0 %	0 %	75 %	25 %	262118118
46	NC_013442	GGCG	2	8	17822	17829	0 %	0 %	75 %	25 %	262118118
47	NC_013442	TCGG	2	8	17934	17941	0 %	25 %	50 %	25 %	262118118
48	NC_013442	GGTG	2	8	18468	18475	0 %	25 %	75 %	0 %	262118118
49	NC_013442	CGAG	2	8	18603	18610	25 %	0 %	50 %	25 %	262118118
50	NC_013442	GCCG	2	8	18754	18761	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
51	NC_013442	GTGC	2	8	19069	19076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_013442	CGGT	2	8	19219	19226	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_013442	GCGA	2	8	19385	19392	25 %	0 %	50 %	25 %	262118119
54	NC_013442	TCCG	2	8	20183	20190	0 %	25 %	25 %	50 %	262118120
55	NC_013442	ACGC	2	8	20456	20463	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
56	NC_013442	GGCG	2	8	20494	20501	0 %	0 %	75 %	25 %	262118121
57	NC_013442	GCAC	2	8	20811	20818	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
58	NC_013442	CGCA	2	8	21076	21083	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
59	NC_013442	TCGA	2	8	21170	21177	25 %	25 %	25 %	25 %	262118121
60	NC_013442	ACTG	2	8	22046	22053	25 %	25 %	25 %	25 %	262118123
61	NC_013442	TGGG	2	8	22500	22507	0 %	25 %	75 %	0 %	262118124
62	NC_013442	CGGT	2	8	22586	22593	0 %	25 %	50 %	25 %	262118124
63	NC_013442	CGGT	2	8	23596	23603	0 %	25 %	50 %	25 %	262118127
64	NC_013442	GTCG	2	8	24127	24134	0 %	25 %	50 %	25 %	262118128
65	NC_013442	GATG	2	8	24219	24226	25 %	25 %	50 %	0 %	262118129
66	NC_013442	GGCA	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	262118130
67	NC_013442	GGCG	2	8	24911	24918	0 %	0 %	75 %	25 %	262118130
68	NC_013442	CCAC	2	8	25459	25466	25 %	0 %	0 %	75 %	262118130
69	NC_013442	GGTG	2	8	26558	26565	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_013442	CCCG	2	8	26682	26689	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
71	NC_013442	ACCC	2	8	27714	27721	25 %	0 %	0 %	75 %	262118132
72	NC_013442	CACC	2	8	27939	27946	25 %	0 %	0 %	75 %	262118132
73	NC_013442	AACG	2	8	27982	27989	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_013442	CATG	2	8	28144	28151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_013442	GCAT	2	8	28413	28420	25 %	25 %	25 %	25 %	262118133
76	NC_013442	GTCG	2	8	28505	28512	0 %	25 %	50 %	25 %	262118133
77	NC_013442	TCGC	2	8	29045	29052	0 %	25 %	25 %	50 %	262118133
78	NC_013442	ATTC	2	8	29557	29564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_013442	AGAT	2	8	29588	29595	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_013442	GCAG	2	8	29779	29786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_013442	CCGA	2	8	30526	30533	25 %	0 %	25 %	50 %	262118134
82	NC_013442	TGGA	3	12	30975	30986	25 %	25 %	50 %	0 %	262118135
83	NC_013442	GGAA	2	8	31442	31449	50 %	0 %	50 %	0 %	262118135
84	NC_013442	CGGG	2	8	32184	32191	0 %	0 %	75 %	25 %	262118136
85	NC_013442	AGGT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	50 %	0 %	262118136
86	NC_013442	GGCC	2	8	32836	32843	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
87	NC_013442	GGTG	2	8	32878	32885	0 %	25 %	75 %	0 %	262118136
88	NC_013442	GGTC	2	8	33304	33311	0 %	25 %	50 %	25 %	262118137
89	NC_013442	GGCG	2	8	33527	33534	0 %	0 %	75 %	25 %	262118137
90	NC_013442	ACGC	2	8	33559	33566	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_013442	TATC	2	8	33597	33604	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_013442	AAGT	2	8	34441	34448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013442	TCGT	2	8	34723	34730	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_013442	GCCC	2	8	34839	34846	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_013442	GGTG	2	8	34847	34854	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_013442	CGGC	2	8	34973	34980	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
97	NC_013442	CTTG	2	8	36430	36437	0 %	50 %	25 %	25 %	262118141
98	NC_013442	CCGG	2	8	36890	36897	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_013442	GCGG	2	8	37245	37252	0 %	0 %	75 %	25 %	262118142
100	NC_013442	GGCA	2	8	37528	37535	25 %	0 %	50 %	25 %	262118142
101	NC_013442	CGGC	2	8	38360	38367	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
102	NC_013442	GGCA	2	8	38948	38955	25 %	0 %	50 %	25 %	262118142
103	NC_013442	CGAC	2	8	39452	39459	25 %	0 %	25 %	50 %	262118142
104	NC_013442	CACC	2	8	39596	39603	25 %	0 %	0 %	75 %	262118142
105	NC_013442	GGGT	2	8	40399	40406	0 %	25 %	75 %	0 %	262118143
106	NC_013442	GGCA	2	8	40655	40662	25 %	0 %	50 %	25 %	262118143
107	NC_013442	CGGC	2	8	40699	40706	0 %	0 %	50 %	50 %	262118143
108	NC_013442	CGGG	2	8	40720	40727	0 %	0 %	75 %	25 %	262118143
109	NC_013442	GCGG	2	8	41738	41745	0 %	0 %	75 %	25 %	262118145
110	NC_013442	GCTG	2	8	41918	41925	0 %	25 %	50 %	25 %	262118145
111	NC_013442	GATT	2	8	42165	42172	25 %	50 %	25 %	0 %	262118145
112	NC_013442	GCCC	2	8	42311	42318	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_013442	GCCG	2	8	42417	42424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_013442	CGAG	2	8	43101	43108	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_013442	TGAC	2	8	43153	43160	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_013442	CTTC	2	8	43498	43505	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013442	CGGC	2	8	43817	43824	0 %	0 %	50 %	50 %	262118148
118	NC_013442	TGGG	2	8	43907	43914	0 %	25 %	75 %	0 %	262118148
119	NC_013442	GCCC	2	8	44398	44405	0 %	0 %	25 %	75 %	262118149
120	NC_013442	CACC	2	8	44950	44957	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_013442	GAAG	2	8	45263	45270	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_013442	CGGT	2	8	45933	45940	0 %	25 %	50 %	25 %	262118151
123	NC_013442	CTGG	2	8	46062	46069	0 %	25 %	50 %	25 %	262118151
124	NC_013442	GCAG	2	8	46395	46402	25 %	0 %	50 %	25 %	262118152
125	NC_013442	CGCC	2	8	46770	46777	0 %	0 %	25 %	75 %	262118152
126	NC_013442	ATGG	2	8	46898	46905	25 %	25 %	50 %	0 %	262118152
127	NC_013442	TGGC	2	8	47324	47331	0 %	25 %	50 %	25 %	262118153
128	NC_013442	GCCG	2	8	47499	47506	0 %	0 %	50 %	50 %	262118153
129	NC_013442	CGCT	2	8	47776	47783	0 %	25 %	25 %	50 %	262118153
130	NC_013442	AGCC	2	8	48242	48249	25 %	0 %	25 %	50 %	262118154
131	NC_013442	CGAT	2	8	48682	48689	25 %	25 %	25 %	25 %	262118154
132	NC_013442	ACCG	2	8	48781	48788	25 %	0 %	25 %	50 %	262118154
133	NC_013442	GGCC	2	8	49003	49010	0 %	0 %	50 %	50 %	262118155
134	NC_013442	CCTT	2	8	49493	49500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_013442	CGGG	2	8	50030	50037	0 %	0 %	75 %	25 %	262118157
136	NC_013442	GTCC	2	8	51124	51131	0 %	25 %	25 %	50 %	262118158
137	NC_013442	ACCC	2	8	51651	51658	25 %	0 %	0 %	75 %	262118158
138	NC_013442	GCCA	2	8	51727	51734	25 %	0 %	25 %	50 %	262118158
139	NC_013442	CGGT	2	8	52187	52194	0 %	25 %	50 %	25 %	262118158
140	NC_013442	AGCC	2	8	52630	52637	25 %	0 %	25 %	50 %	262118159
141	NC_013442	CCGG	2	8	52799	52806	0 %	0 %	50 %	50 %	262118159
142	NC_013442	CGCC	2	8	52918	52925	0 %	0 %	25 %	75 %	262118160
143	NC_013442	CACC	2	8	53257	53264	25 %	0 %	0 %	75 %	262118161
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.