MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	CCAG	2	8	490	497	25 %	0 %	25 %	50 %	262118101
2	NC_013442	GCCG	2	8	747	754	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
3	NC_013442	GGGT	2	8	1312	1319	0 %	25 %	75 %	0 %	262118101
4	NC_013442	CCGG	2	8	1591	1598	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
5	NC_013442	AGCA	2	8	1779	1786	50 %	0 %	25 %	25 %	262118101
6	NC_013442	GGCC	2	8	2579	2586	0 %	0 %	50 %	50 %	262118102
7	NC_013442	GTCA	2	8	2887	2894	25 %	25 %	25 %	25 %	262118103
8	NC_013442	GACG	2	8	3627	3634	25 %	0 %	50 %	25 %	262118105
9	NC_013442	CCAC	2	8	4284	4291	25 %	0 %	0 %	75 %	262118107
10	NC_013442	CCAC	2	8	4765	4772	25 %	0 %	0 %	75 %	262118108
11	NC_013442	CCTC	2	8	5420	5427	0 %	25 %	0 %	75 %	262118109
12	NC_013442	CCGC	2	8	5460	5467	0 %	0 %	25 %	75 %	262118109
13	NC_013442	CCAA	2	8	5580	5587	50 %	0 %	0 %	50 %	262118109
14	NC_013442	GCAC	2	8	5843	5850	25 %	0 %	25 %	50 %	262118109
15	NC_013442	CCCA	2	8	5956	5963	25 %	0 %	0 %	75 %	262118109
16	NC_013442	CCGC	2	8	6189	6196	0 %	0 %	25 %	75 %	262118109
17	NC_013442	GTCG	2	8	6394	6401	0 %	25 %	50 %	25 %	262118109
18	NC_013442	GGTG	2	8	6490	6497	0 %	25 %	75 %	0 %	262118109
19	NC_013442	CCAC	2	8	6848	6855	25 %	0 %	0 %	75 %	262118110
20	NC_013442	CCGA	2	8	7348	7355	25 %	0 %	25 %	50 %	262118110
21	NC_013442	CCGG	2	8	7556	7563	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
22	NC_013442	TGCC	2	8	7689	7696	0 %	25 %	25 %	50 %	262118110
23	NC_013442	CGAG	2	8	8394	8401	25 %	0 %	50 %	25 %	262118110
24	NC_013442	ATCG	2	8	8492	8499	25 %	25 %	25 %	25 %	262118111
25	NC_013442	CATC	2	8	8675	8682	25 %	25 %	0 %	50 %	262118111
26	NC_013442	TCGC	2	8	9373	9380	0 %	25 %	25 %	50 %	262118112
27	NC_013442	TGCA	2	8	11774	11781	25 %	25 %	25 %	25 %	262118113
28	NC_013442	CGCC	2	8	12349	12356	0 %	0 %	25 %	75 %	262118114
29	NC_013442	GGCC	2	8	12413	12420	0 %	0 %	50 %	50 %	262118114
30	NC_013442	GGAC	2	8	13086	13093	25 %	0 %	50 %	25 %	262118115
31	NC_013442	CATA	2	8	13718	13725	50 %	25 %	0 %	25 %	262118115
32	NC_013442	TCAA	2	8	14315	14322	50 %	25 %	0 %	25 %	262118116
33	NC_013442	TCGA	2	8	14645	14652	25 %	25 %	25 %	25 %	262118116
34	NC_013442	GTCG	2	8	14820	14827	0 %	25 %	50 %	25 %	262118116
35	NC_013442	CCGA	2	8	15074	15081	25 %	0 %	25 %	50 %	262118116
36	NC_013442	CCAT	2	8	15170	15177	25 %	25 %	0 %	50 %	262118116
37	NC_013442	GGCA	2	8	15364	15371	25 %	0 %	50 %	25 %	262118117
38	NC_013442	CACG	2	8	15472	15479	25 %	0 %	25 %	50 %	262118117
39	NC_013442	CATC	2	8	16099	16106	25 %	25 %	0 %	50 %	262118117
40	NC_013442	CGGA	2	8	17044	17051	25 %	0 %	50 %	25 %	262118118
41	NC_013442	CGGG	2	8	17494	17501	0 %	0 %	75 %	25 %	262118118
42	NC_013442	GGCG	2	8	17822	17829	0 %	0 %	75 %	25 %	262118118
43	NC_013442	TCGG	2	8	17934	17941	0 %	25 %	50 %	25 %	262118118
44	NC_013442	GGTG	2	8	18468	18475	0 %	25 %	75 %	0 %	262118118
45	NC_013442	CGAG	2	8	18603	18610	25 %	0 %	50 %	25 %	262118118
46	NC_013442	GCCG	2	8	18754	18761	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
47	NC_013442	GCGA	2	8	19385	19392	25 %	0 %	50 %	25 %	262118119
48	NC_013442	TCCG	2	8	20183	20190	0 %	25 %	25 %	50 %	262118120
49	NC_013442	ACGC	2	8	20456	20463	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
50	NC_013442	GGCG	2	8	20494	20501	0 %	0 %	75 %	25 %	262118121
51	NC_013442	GCAC	2	8	20811	20818	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
52	NC_013442	CGCA	2	8	21076	21083	25 %	0 %	25 %	50 %	262118121
53	NC_013442	TCGA	2	8	21170	21177	25 %	25 %	25 %	25 %	262118121
54	NC_013442	ACTG	2	8	22046	22053	25 %	25 %	25 %	25 %	262118123
55	NC_013442	TGGG	2	8	22500	22507	0 %	25 %	75 %	0 %	262118124
56	NC_013442	CGGT	2	8	22586	22593	0 %	25 %	50 %	25 %	262118124
57	NC_013442	CGGT	2	8	23596	23603	0 %	25 %	50 %	25 %	262118127
58	NC_013442	GTCG	2	8	24127	24134	0 %	25 %	50 %	25 %	262118128
59	NC_013442	GATG	2	8	24219	24226	25 %	25 %	50 %	0 %	262118129
60	NC_013442	GGCA	2	8	24847	24854	25 %	0 %	50 %	25 %	262118130
61	NC_013442	GGCG	2	8	24911	24918	0 %	0 %	75 %	25 %	262118130
62	NC_013442	CCAC	2	8	25459	25466	25 %	0 %	0 %	75 %	262118130
63	NC_013442	ACCC	2	8	27714	27721	25 %	0 %	0 %	75 %	262118132
64	NC_013442	CACC	2	8	27939	27946	25 %	0 %	0 %	75 %	262118132
65	NC_013442	GCAT	2	8	28413	28420	25 %	25 %	25 %	25 %	262118133
66	NC_013442	GTCG	2	8	28505	28512	0 %	25 %	50 %	25 %	262118133
67	NC_013442	TCGC	2	8	29045	29052	0 %	25 %	25 %	50 %	262118133
68	NC_013442	CCGA	2	8	30526	30533	25 %	0 %	25 %	50 %	262118134
69	NC_013442	TGGA	3	12	30975	30986	25 %	25 %	50 %	0 %	262118135
70	NC_013442	GGAA	2	8	31442	31449	50 %	0 %	50 %	0 %	262118135
71	NC_013442	CGGG	2	8	32184	32191	0 %	0 %	75 %	25 %	262118136
72	NC_013442	AGGT	2	8	32433	32440	25 %	25 %	50 %	0 %	262118136
73	NC_013442	GGCC	2	8	32836	32843	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
74	NC_013442	GGTG	2	8	32878	32885	0 %	25 %	75 %	0 %	262118136
75	NC_013442	GGTC	2	8	33304	33311	0 %	25 %	50 %	25 %	262118137
76	NC_013442	GGCG	2	8	33527	33534	0 %	0 %	75 %	25 %	262118137
77	NC_013442	CGGC	2	8	34973	34980	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
78	NC_013442	CTTG	2	8	36430	36437	0 %	50 %	25 %	25 %	262118141
79	NC_013442	GCGG	2	8	37245	37252	0 %	0 %	75 %	25 %	262118142
80	NC_013442	GGCA	2	8	37528	37535	25 %	0 %	50 %	25 %	262118142
81	NC_013442	CGGC	2	8	38360	38367	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
82	NC_013442	GGCA	2	8	38948	38955	25 %	0 %	50 %	25 %	262118142
83	NC_013442	CGAC	2	8	39452	39459	25 %	0 %	25 %	50 %	262118142
84	NC_013442	CACC	2	8	39596	39603	25 %	0 %	0 %	75 %	262118142
85	NC_013442	GGGT	2	8	40399	40406	0 %	25 %	75 %	0 %	262118143
86	NC_013442	GGCA	2	8	40655	40662	25 %	0 %	50 %	25 %	262118143
87	NC_013442	CGGC	2	8	40699	40706	0 %	0 %	50 %	50 %	262118143
88	NC_013442	CGGG	2	8	40720	40727	0 %	0 %	75 %	25 %	262118143
89	NC_013442	GCGG	2	8	41738	41745	0 %	0 %	75 %	25 %	262118145
90	NC_013442	GCTG	2	8	41918	41925	0 %	25 %	50 %	25 %	262118145
91	NC_013442	GATT	2	8	42165	42172	25 %	50 %	25 %	0 %	262118145
92	NC_013442	CGGC	2	8	43817	43824	0 %	0 %	50 %	50 %	262118148
93	NC_013442	TGGG	2	8	43907	43914	0 %	25 %	75 %	0 %	262118148
94	NC_013442	GCCC	2	8	44398	44405	0 %	0 %	25 %	75 %	262118149
95	NC_013442	CGGT	2	8	45933	45940	0 %	25 %	50 %	25 %	262118151
96	NC_013442	CTGG	2	8	46062	46069	0 %	25 %	50 %	25 %	262118151
97	NC_013442	GCAG	2	8	46395	46402	25 %	0 %	50 %	25 %	262118152
98	NC_013442	CGCC	2	8	46770	46777	0 %	0 %	25 %	75 %	262118152
99	NC_013442	ATGG	2	8	46898	46905	25 %	25 %	50 %	0 %	262118152
100	NC_013442	TGGC	2	8	47324	47331	0 %	25 %	50 %	25 %	262118153
101	NC_013442	GCCG	2	8	47499	47506	0 %	0 %	50 %	50 %	262118153
102	NC_013442	CGCT	2	8	47776	47783	0 %	25 %	25 %	50 %	262118153
103	NC_013442	AGCC	2	8	48242	48249	25 %	0 %	25 %	50 %	262118154
104	NC_013442	CGAT	2	8	48682	48689	25 %	25 %	25 %	25 %	262118154
105	NC_013442	ACCG	2	8	48781	48788	25 %	0 %	25 %	50 %	262118154
106	NC_013442	GGCC	2	8	49003	49010	0 %	0 %	50 %	50 %	262118155
107	NC_013442	CGGG	2	8	50030	50037	0 %	0 %	75 %	25 %	262118157
108	NC_013442	GTCC	2	8	51124	51131	0 %	25 %	25 %	50 %	262118158
109	NC_013442	ACCC	2	8	51651	51658	25 %	0 %	0 %	75 %	262118158
110	NC_013442	GCCA	2	8	51727	51734	25 %	0 %	25 %	50 %	262118158
111	NC_013442	CGGT	2	8	52187	52194	0 %	25 %	50 %	25 %	262118158
112	NC_013442	AGCC	2	8	52630	52637	25 %	0 %	25 %	50 %	262118159
113	NC_013442	CCGG	2	8	52799	52806	0 %	0 %	50 %	50 %	262118159
114	NC_013442	CGCC	2	8	52918	52925	0 %	0 %	25 %	75 %	262118160
115	NC_013442	CACC	2	8	53257	53264	25 %	0 %	0 %	75 %	262118161
116	NC_013442	ACGG	2	8	53396	53403	25 %	0 %	50 %	25 %	262118161
117	NC_013442	CGTG	2	8	54179	54186	0 %	25 %	50 %	25 %	262118163
118	NC_013442	CCGA	2	8	54535	54542	25 %	0 %	25 %	50 %	262118163
119	NC_013442	CCCG	2	8	54636	54643	0 %	0 %	25 %	75 %	262118163
120	NC_013442	GTGC	2	8	55193	55200	0 %	25 %	50 %	25 %	262118164
121	NC_013442	CGTC	2	8	55235	55242	0 %	25 %	25 %	50 %	262118164
122	NC_013442	TCGT	2	8	55517	55524	0 %	50 %	25 %	25 %	262118164
123	NC_013442	CGCA	2	8	55798	55805	25 %	0 %	25 %	50 %	262118165
124	NC_013442	GGCC	2	8	56326	56333	0 %	0 %	50 %	50 %	262118166
125	NC_013442	TCGA	2	8	56487	56494	25 %	25 %	25 %	25 %	262118166
126	NC_013442	TGCC	2	8	57011	57018	0 %	25 %	25 %	50 %	262118167
127	NC_013442	GGGT	2	8	57027	57034	0 %	25 %	75 %	0 %	262118167
128	NC_013442	CACC	2	8	58150	58157	25 %	0 %	0 %	75 %	262118168
129	NC_013442	CGGC	2	8	58230	58237	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
130	NC_013442	GGAC	2	8	58258	58265	25 %	0 %	50 %	25 %	262118168
131	NC_013442	CCTC	2	8	59760	59767	0 %	25 %	0 %	75 %	262118168
132	NC_013442	AACG	2	8	59942	59949	50 %	0 %	25 %	25 %	262118168
133	NC_013442	ATCT	2	8	60344	60351	25 %	50 %	0 %	25 %	262118168
134	NC_013442	CCGC	2	8	60891	60898	0 %	0 %	25 %	75 %	262118168
135	NC_013442	GCCA	2	8	61046	61053	25 %	0 %	25 %	50 %	262118168
136	NC_013442	ACCG	2	8	61067	61074	25 %	0 %	25 %	50 %	262118168
137	NC_013442	ACCC	2	8	61087	61094	25 %	0 %	0 %	75 %	262118168
138	NC_013442	ACCG	2	8	61133	61140	25 %	0 %	25 %	50 %	262118168
139	NC_013442	GAGC	2	8	61183	61190	25 %	0 %	50 %	25 %	262118168
140	NC_013442	TGCC	2	8	61335	61342	0 %	25 %	25 %	50 %	262118168
141	NC_013442	CCAC	2	8	61602	61609	25 %	0 %	0 %	75 %	262118168
142	NC_013442	CCAC	2	8	61674	61681	25 %	0 %	0 %	75 %	262118168
143	NC_013442	GACC	2	8	61876	61883	25 %	0 %	25 %	50 %	262118168
144	NC_013442	CGCC	2	8	62173	62180	0 %	0 %	25 %	75 %	262118168
145	NC_013442	GACC	2	8	62251	62258	25 %	0 %	25 %	50 %	262118168
146	NC_013442	CGCC	2	8	62299	62306	0 %	0 %	25 %	75 %	262118168
147	NC_013442	CGCC	2	8	63358	63365	0 %	0 %	25 %	75 %	262118168
148	NC_013442	TGAC	2	8	63538	63545	25 %	25 %	25 %	25 %	262118168
149	NC_013442	CGGC	2	8	64047	64054	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
150	NC_013442	CCGC	2	8	64702	64709	0 %	0 %	25 %	75 %	262118169
151	NC_013442	CATT	2	8	65116	65123	25 %	50 %	0 %	25 %	262118169
152	NC_013442	GGAT	2	8	65233	65240	25 %	25 %	50 %	0 %	262118169
153	NC_013442	GGCA	2	8	65243	65250	25 %	0 %	50 %	25 %	262118169
154	NC_013442	GCCG	2	8	65252	65259	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
155	NC_013442	ACCG	2	8	65823	65830	25 %	0 %	25 %	50 %	262118169
156	NC_013442	GCCG	2	8	65942	65949	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
157	NC_013442	CGTA	2	8	66291	66298	25 %	25 %	25 %	25 %	262118169
158	NC_013442	CGCT	2	8	66340	66347	0 %	25 %	25 %	50 %	262118169
159	NC_013442	CCAC	2	8	66712	66719	25 %	0 %	0 %	75 %	262118169
160	NC_013442	GTTG	2	8	66904	66911	0 %	50 %	50 %	0 %	262118169
161	NC_013442	GACT	2	8	67126	67133	25 %	25 %	25 %	25 %	262118169
162	NC_013442	ACAG	2	8	67950	67957	50 %	0 %	25 %	25 %	262118169
163	NC_013442	CCCG	2	8	68017	68024	0 %	0 %	25 %	75 %	262118169
164	NC_013442	CGGG	2	8	68093	68100	0 %	0 %	75 %	25 %	262118169
165	NC_013442	CACC	2	8	68791	68798	25 %	0 %	0 %	75 %	262118169
166	NC_013442	TCGG	2	8	69947	69954	0 %	25 %	50 %	25 %	262118170
167	NC_013442	GCGT	2	8	70213	70220	0 %	25 %	50 %	25 %	262118170
168	NC_013442	GTGC	2	8	70653	70660	0 %	25 %	50 %	25 %	262118171
169	NC_013442	CACC	2	8	70998	71005	25 %	0 %	0 %	75 %	262118172
170	NC_013442	AGCG	2	8	71730	71737	25 %	0 %	50 %	25 %	262118173
171	NC_013442	CGCC	2	8	72528	72535	0 %	0 %	25 %	75 %	262118174
172	NC_013442	GTCG	2	8	72641	72648	0 %	25 %	50 %	25 %	262118174
173	NC_013442	GGTC	2	8	72916	72923	0 %	25 %	50 %	25 %	262118174
174	NC_013442	GCTG	2	8	73322	73329	0 %	25 %	50 %	25 %	262118174
175	NC_013442	TGGG	2	8	73945	73952	0 %	25 %	75 %	0 %	262118174
176	NC_013442	AGTG	2	8	74026	74033	25 %	25 %	50 %	0 %	262118175
177	NC_013442	TCCG	2	8	74336	74343	0 %	25 %	25 %	50 %	262118175
178	NC_013442	CGGC	2	8	74407	74414	0 %	0 %	50 %	50 %	262118175
179	NC_013442	CCAT	2	8	74951	74958	25 %	25 %	0 %	50 %	262118176
180	NC_013442	GGCG	2	8	75097	75104	0 %	0 %	75 %	25 %	262118176
181	NC_013442	ATCG	2	8	75472	75479	25 %	25 %	25 %	25 %	262118176
182	NC_013442	CCCG	2	8	75480	75487	0 %	0 %	25 %	75 %	262118176
183	NC_013442	CCGC	2	8	75881	75888	0 %	0 %	25 %	75 %	262118176
184	NC_013442	GGAT	2	8	76009	76016	25 %	25 %	50 %	0 %	262118176
185	NC_013442	GATC	2	8	76107	76114	25 %	25 %	25 %	25 %	262118176
186	NC_013442	CGCC	2	8	76118	76125	0 %	0 %	25 %	75 %	262118176
187	NC_013442	CATA	2	8	76260	76267	50 %	25 %	0 %	25 %	262118176
188	NC_013442	CTGC	2	8	76855	76862	0 %	25 %	25 %	50 %	262118177
189	NC_013442	TCGA	2	8	76879	76886	25 %	25 %	25 %	25 %	262118177
190	NC_013442	CCGG	2	8	76916	76923	0 %	0 %	50 %	50 %	262118177
191	NC_013442	CTGG	2	8	77313	77320	0 %	25 %	50 %	25 %	262118177
192	NC_013442	TGCG	2	8	77422	77429	0 %	25 %	50 %	25 %	262118177
193	NC_013442	GGTG	2	8	77664	77671	0 %	25 %	75 %	0 %	262118178
194	NC_013442	CCGA	2	8	79886	79893	25 %	0 %	25 %	50 %	262118180
195	NC_013442	GCCG	2	8	80737	80744	0 %	0 %	50 %	50 %	262118180
196	NC_013442	CGAC	2	8	80880	80887	25 %	0 %	25 %	50 %	262118180
197	NC_013442	CACC	2	8	80995	81002	25 %	0 %	0 %	75 %	262118180
198	NC_013442	CACC	2	8	81130	81137	25 %	0 %	0 %	75 %	262118180
199	NC_013442	AGGA	2	8	81305	81312	50 %	0 %	50 %	0 %	262118180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.