MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
2	NC_013442	GC	3	6	827	832	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
3	NC_013442	GC	3	6	2189	2194	0 %	0 %	50 %	50 %	262118102
4	NC_013442	CA	3	6	2624	2629	50 %	0 %	0 %	50 %	262118102
5	NC_013442	GT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	50 %	0 %	262118105
6	NC_013442	GC	3	6	4224	4229	0 %	0 %	50 %	50 %	262118107
7	NC_013442	TG	4	8	4523	4530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013442	GC	3	6	7249	7254	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
9	NC_013442	GC	3	6	7299	7304	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
10	NC_013442	GC	3	6	8831	8836	0 %	0 %	50 %	50 %	262118111
11	NC_013442	GC	3	6	8866	8871	0 %	0 %	50 %	50 %	262118111
12	NC_013442	GT	3	6	9877	9882	0 %	50 %	50 %	0 %	262118112
13	NC_013442	CG	3	6	10154	10159	0 %	0 %	50 %	50 %	262118112
14	NC_013442	AC	3	6	10715	10720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_013442	GA	3	6	10831	10836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013442	CA	3	6	10866	10871	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_013442	CG	3	6	11135	11140	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_013442	AC	3	6	11168	11173	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_013442	CA	3	6	11194	11199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_013442	CA	3	6	11341	11346	50 %	0 %	0 %	50 %	262118113
21	NC_013442	CT	3	6	11370	11375	0 %	50 %	0 %	50 %	262118113
22	NC_013442	TC	3	6	12259	12264	0 %	50 %	0 %	50 %	262118114
23	NC_013442	GC	3	6	12618	12623	0 %	0 %	50 %	50 %	262118114
24	NC_013442	CG	3	6	12769	12774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_013442	GT	3	6	12839	12844	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013442	TG	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	262118116
27	NC_013442	GC	3	6	14938	14943	0 %	0 %	50 %	50 %	262118116
28	NC_013442	CG	3	6	15281	15286	0 %	0 %	50 %	50 %	262118116
29	NC_013442	CG	3	6	16369	16374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_013442	GC	3	6	16516	16521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_013442	GC	3	6	16796	16801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_013442	GT	3	6	16832	16837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013442	GC	3	6	17238	17243	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
34	NC_013442	CA	3	6	17566	17571	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
35	NC_013442	GC	3	6	17851	17856	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
36	NC_013442	GT	3	6	17943	17948	0 %	50 %	50 %	0 %	262118118
37	NC_013442	TG	3	6	18168	18173	0 %	50 %	50 %	0 %	262118118
38	NC_013442	CA	3	6	18327	18332	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
39	NC_013442	AC	3	6	18481	18486	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
40	NC_013442	GC	3	6	18912	18917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_013442	CA	3	6	19109	19114	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_013442	GT	3	6	19497	19502	0 %	50 %	50 %	0 %	262118119
43	NC_013442	CT	3	6	19577	19582	0 %	50 %	0 %	50 %	262118119
44	NC_013442	GA	3	6	19815	19820	50 %	0 %	50 %	0 %	262118119
45	NC_013442	GC	3	6	20120	20125	0 %	0 %	50 %	50 %	262118120
46	NC_013442	GC	3	6	21233	21238	0 %	0 %	50 %	50 %	262118121
47	NC_013442	GC	3	6	21842	21847	0 %	0 %	50 %	50 %	262118122
48	NC_013442	TG	4	8	22419	22426	0 %	50 %	50 %	0 %	262118123
49	NC_013442	TG	3	6	23063	23068	0 %	50 %	50 %	0 %	262118126
50	NC_013442	TC	3	6	23199	23204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_013442	GC	3	6	23767	23772	0 %	0 %	50 %	50 %	262118127
52	NC_013442	CG	3	6	23910	23915	0 %	0 %	50 %	50 %	262118128
53	NC_013442	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	262118128
54	NC_013442	TG	3	6	24679	24684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_013442	CG	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	262118130
56	NC_013442	CA	3	6	25606	25611	50 %	0 %	0 %	50 %	262118130
57	NC_013442	GC	3	6	26023	26028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_013442	GC	3	6	26096	26101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_013442	CG	3	6	26745	26750	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_013442	CG	3	6	27129	27134	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
61	NC_013442	CG	3	6	27385	27390	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
62	NC_013442	CG	3	6	27456	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
63	NC_013442	TG	3	6	27853	27858	0 %	50 %	50 %	0 %	262118132
64	NC_013442	CG	4	8	27967	27974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_013442	GC	3	6	28866	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	262118133
66	NC_013442	TC	3	6	29702	29707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_013442	GT	3	6	29734	29739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_013442	AC	3	6	30186	30191	50 %	0 %	0 %	50 %	262118134
69	NC_013442	TC	3	6	30207	30212	0 %	50 %	0 %	50 %	262118134
70	NC_013442	CG	3	6	30861	30866	0 %	0 %	50 %	50 %	262118135
71	NC_013442	CG	3	6	31158	31163	0 %	0 %	50 %	50 %	262118135
72	NC_013442	GA	3	6	31259	31264	50 %	0 %	50 %	0 %	262118135
73	NC_013442	CG	3	6	32054	32059	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
74	NC_013442	GC	3	6	32285	32290	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
75	NC_013442	CG	3	6	33230	33235	0 %	0 %	50 %	50 %	262118137
76	NC_013442	GC	3	6	33249	33254	0 %	0 %	50 %	50 %	262118137
77	NC_013442	AT	3	6	34560	34565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_013442	GT	3	6	35338	35343	0 %	50 %	50 %	0 %	262118139
79	NC_013442	GC	3	6	35482	35487	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
80	NC_013442	CG	3	6	35574	35579	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
81	NC_013442	CG	3	6	38271	38276	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
82	NC_013442	CG	3	6	39343	39348	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
83	NC_013442	GC	3	6	39670	39675	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
84	NC_013442	GC	3	6	40519	40524	0 %	0 %	50 %	50 %	262118143
85	NC_013442	AC	3	6	40583	40588	50 %	0 %	0 %	50 %	262118143
86	NC_013442	GC	3	6	42139	42144	0 %	0 %	50 %	50 %	262118145
87	NC_013442	GC	3	6	42255	42260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_013442	GC	3	6	44095	44100	0 %	0 %	50 %	50 %	262118149
89	NC_013442	GC	3	6	44532	44537	0 %	0 %	50 %	50 %	262118149
90	NC_013442	TC	3	6	45319	45324	0 %	50 %	0 %	50 %	262118150
91	NC_013442	CG	3	6	45490	45495	0 %	0 %	50 %	50 %	262118150
92	NC_013442	GA	3	6	45558	45563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_013442	CA	3	6	45827	45832	50 %	0 %	0 %	50 %	262118151
94	NC_013442	GT	3	6	46142	46147	0 %	50 %	50 %	0 %	262118151
95	NC_013442	CA	3	6	46346	46351	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
96	NC_013442	CA	3	6	46468	46473	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
97	NC_013442	AC	3	6	46970	46975	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
98	NC_013442	GC	3	6	47013	47018	0 %	0 %	50 %	50 %	262118152
99	NC_013442	CA	3	6	47480	47485	50 %	0 %	0 %	50 %	262118153
100	NC_013442	CA	3	6	47627	47632	50 %	0 %	0 %	50 %	262118153
101	NC_013442	TG	3	6	47676	47681	0 %	50 %	50 %	0 %	262118153
102	NC_013442	CG	3	6	47684	47689	0 %	0 %	50 %	50 %	262118153
103	NC_013442	CT	3	6	48329	48334	0 %	50 %	0 %	50 %	262118154
104	NC_013442	CG	3	6	48557	48562	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
105	NC_013442	GC	3	6	48579	48584	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
106	NC_013442	CA	3	6	48730	48735	50 %	0 %	0 %	50 %	262118154
107	NC_013442	GC	3	6	48790	48795	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
108	NC_013442	TC	3	6	49487	49492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_013442	CG	3	6	49857	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	262118157
110	NC_013442	CG	3	6	50704	50709	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
111	NC_013442	GC	3	6	51005	51010	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
112	NC_013442	GC	3	6	51470	51475	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
113	NC_013442	GC	3	6	51965	51970	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
114	NC_013442	GC	3	6	52215	52220	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
115	NC_013442	CG	4	8	52367	52374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_013442	AC	3	6	52388	52393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_013442	GC	3	6	52414	52419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
118	NC_013442	GC	3	6	53914	53919	0 %	0 %	50 %	50 %	262118162
119	NC_013442	CG	3	6	54190	54195	0 %	0 %	50 %	50 %	262118163
120	NC_013442	GC	3	6	54465	54470	0 %	0 %	50 %	50 %	262118163
121	NC_013442	CA	3	6	54591	54596	50 %	0 %	0 %	50 %	262118163
122	NC_013442	TG	3	6	55016	55021	0 %	50 %	50 %	0 %	262118164
123	NC_013442	AC	3	6	55368	55373	50 %	0 %	0 %	50 %	262118164
124	NC_013442	CG	3	6	55525	55530	0 %	0 %	50 %	50 %	262118164
125	NC_013442	GC	3	6	56172	56177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_013442	CG	3	6	56628	56633	0 %	0 %	50 %	50 %	262118166
127	NC_013442	CA	3	6	56871	56876	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_013442	CG	3	6	57815	57820	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
129	NC_013442	CG	3	6	57838	57843	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
130	NC_013442	CG	3	6	58166	58171	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
131	NC_013442	CT	3	6	58475	58480	0 %	50 %	0 %	50 %	262118168
132	NC_013442	CG	3	6	59264	59269	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
133	NC_013442	GC	3	6	59464	59469	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
134	NC_013442	GC	3	6	60138	60143	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
135	NC_013442	CG	3	6	61630	61635	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
136	NC_013442	CA	3	6	61938	61943	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
137	NC_013442	GC	3	6	62017	62022	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
138	NC_013442	CG	3	6	62039	62044	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
139	NC_013442	GC	3	6	62059	62064	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
140	NC_013442	GC	3	6	62260	62265	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
141	NC_013442	CA	3	6	63204	63209	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
142	NC_013442	AC	3	6	63346	63351	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
143	NC_013442	CA	3	6	63505	63510	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
144	NC_013442	TC	3	6	63856	63861	0 %	50 %	0 %	50 %	262118169
145	NC_013442	GT	3	6	63922	63927	0 %	50 %	50 %	0 %	262118169
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147	NC_013442	GT	3	6	64102	64107	0 %	50 %	50 %	0 %	262118169
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.