MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 plasmid pGBRO01

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013442	GC	3	6	312	317	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
2	NC_013442	GC	3	6	827	832	0 %	0 %	50 %	50 %	262118101
3	NC_013442	GC	3	6	2189	2194	0 %	0 %	50 %	50 %	262118102
4	NC_013442	CA	3	6	2624	2629	50 %	0 %	0 %	50 %	262118102
5	NC_013442	GT	3	6	3365	3370	0 %	50 %	50 %	0 %	262118105
6	NC_013442	GC	3	6	4224	4229	0 %	0 %	50 %	50 %	262118107
7	NC_013442	GC	3	6	7249	7254	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
8	NC_013442	GC	3	6	7299	7304	0 %	0 %	50 %	50 %	262118110
9	NC_013442	GC	3	6	8831	8836	0 %	0 %	50 %	50 %	262118111
10	NC_013442	GC	3	6	8866	8871	0 %	0 %	50 %	50 %	262118111
11	NC_013442	GT	3	6	9877	9882	0 %	50 %	50 %	0 %	262118112
12	NC_013442	CG	3	6	10154	10159	0 %	0 %	50 %	50 %	262118112
13	NC_013442	CA	3	6	11341	11346	50 %	0 %	0 %	50 %	262118113
14	NC_013442	CT	3	6	11370	11375	0 %	50 %	0 %	50 %	262118113
15	NC_013442	TC	3	6	12259	12264	0 %	50 %	0 %	50 %	262118114
16	NC_013442	GC	3	6	12618	12623	0 %	0 %	50 %	50 %	262118114
17	NC_013442	TG	3	6	14324	14329	0 %	50 %	50 %	0 %	262118116
18	NC_013442	GC	3	6	14938	14943	0 %	0 %	50 %	50 %	262118116
19	NC_013442	CG	3	6	15281	15286	0 %	0 %	50 %	50 %	262118116
20	NC_013442	GC	3	6	17238	17243	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
21	NC_013442	CA	3	6	17566	17571	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
22	NC_013442	GC	3	6	17851	17856	0 %	0 %	50 %	50 %	262118118
23	NC_013442	GT	3	6	17943	17948	0 %	50 %	50 %	0 %	262118118
24	NC_013442	TG	3	6	18168	18173	0 %	50 %	50 %	0 %	262118118
25	NC_013442	CA	3	6	18327	18332	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
26	NC_013442	AC	3	6	18481	18486	50 %	0 %	0 %	50 %	262118118
27	NC_013442	GT	3	6	19497	19502	0 %	50 %	50 %	0 %	262118119
28	NC_013442	CT	3	6	19577	19582	0 %	50 %	0 %	50 %	262118119
29	NC_013442	GA	3	6	19815	19820	50 %	0 %	50 %	0 %	262118119
30	NC_013442	GC	3	6	20120	20125	0 %	0 %	50 %	50 %	262118120
31	NC_013442	GC	3	6	21233	21238	0 %	0 %	50 %	50 %	262118121
32	NC_013442	GC	3	6	21842	21847	0 %	0 %	50 %	50 %	262118122
33	NC_013442	TG	4	8	22419	22426	0 %	50 %	50 %	0 %	262118123
34	NC_013442	TG	3	6	23063	23068	0 %	50 %	50 %	0 %	262118126
35	NC_013442	GC	3	6	23767	23772	0 %	0 %	50 %	50 %	262118127
36	NC_013442	CG	3	6	23910	23915	0 %	0 %	50 %	50 %	262118128
37	NC_013442	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	262118128
38	NC_013442	CG	3	6	25112	25117	0 %	0 %	50 %	50 %	262118130
39	NC_013442	CA	3	6	25606	25611	50 %	0 %	0 %	50 %	262118130
40	NC_013442	CG	3	6	27129	27134	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
41	NC_013442	CG	3	6	27385	27390	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
42	NC_013442	CG	3	6	27456	27461	0 %	0 %	50 %	50 %	262118132
43	NC_013442	TG	3	6	27853	27858	0 %	50 %	50 %	0 %	262118132
44	NC_013442	GC	3	6	28866	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	262118133
45	NC_013442	AC	3	6	30186	30191	50 %	0 %	0 %	50 %	262118134
46	NC_013442	TC	3	6	30207	30212	0 %	50 %	0 %	50 %	262118134
47	NC_013442	CG	3	6	30861	30866	0 %	0 %	50 %	50 %	262118135
48	NC_013442	CG	3	6	31158	31163	0 %	0 %	50 %	50 %	262118135
49	NC_013442	GA	3	6	31259	31264	50 %	0 %	50 %	0 %	262118135
50	NC_013442	CG	3	6	32054	32059	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
51	NC_013442	GC	3	6	32285	32290	0 %	0 %	50 %	50 %	262118136
52	NC_013442	CG	3	6	33230	33235	0 %	0 %	50 %	50 %	262118137
53	NC_013442	GC	3	6	33249	33254	0 %	0 %	50 %	50 %	262118137
54	NC_013442	GT	3	6	35338	35343	0 %	50 %	50 %	0 %	262118139
55	NC_013442	GC	3	6	35482	35487	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
56	NC_013442	CG	3	6	35574	35579	0 %	0 %	50 %	50 %	262118139
57	NC_013442	CG	3	6	38271	38276	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
58	NC_013442	CG	3	6	39343	39348	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
59	NC_013442	GC	3	6	39670	39675	0 %	0 %	50 %	50 %	262118142
60	NC_013442	GC	3	6	40519	40524	0 %	0 %	50 %	50 %	262118143
61	NC_013442	AC	3	6	40583	40588	50 %	0 %	0 %	50 %	262118143
62	NC_013442	GC	3	6	42139	42144	0 %	0 %	50 %	50 %	262118145
63	NC_013442	GC	3	6	44095	44100	0 %	0 %	50 %	50 %	262118149
64	NC_013442	GC	3	6	44532	44537	0 %	0 %	50 %	50 %	262118149
65	NC_013442	TC	3	6	45319	45324	0 %	50 %	0 %	50 %	262118150
66	NC_013442	CG	3	6	45490	45495	0 %	0 %	50 %	50 %	262118150
67	NC_013442	CA	3	6	45827	45832	50 %	0 %	0 %	50 %	262118151
68	NC_013442	GT	3	6	46142	46147	0 %	50 %	50 %	0 %	262118151
69	NC_013442	CA	3	6	46346	46351	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
70	NC_013442	CA	3	6	46468	46473	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
71	NC_013442	AC	3	6	46970	46975	50 %	0 %	0 %	50 %	262118152
72	NC_013442	GC	3	6	47013	47018	0 %	0 %	50 %	50 %	262118152
73	NC_013442	CA	3	6	47480	47485	50 %	0 %	0 %	50 %	262118153
74	NC_013442	CA	3	6	47627	47632	50 %	0 %	0 %	50 %	262118153
75	NC_013442	TG	3	6	47676	47681	0 %	50 %	50 %	0 %	262118153
76	NC_013442	CG	3	6	47684	47689	0 %	0 %	50 %	50 %	262118153
77	NC_013442	CT	3	6	48329	48334	0 %	50 %	0 %	50 %	262118154
78	NC_013442	CG	3	6	48557	48562	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
79	NC_013442	GC	3	6	48579	48584	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
80	NC_013442	CA	3	6	48730	48735	50 %	0 %	0 %	50 %	262118154
81	NC_013442	GC	3	6	48790	48795	0 %	0 %	50 %	50 %	262118154
82	NC_013442	CG	3	6	49857	49862	0 %	0 %	50 %	50 %	262118157
83	NC_013442	CG	3	6	50704	50709	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
84	NC_013442	GC	3	6	51005	51010	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
85	NC_013442	GC	3	6	51470	51475	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
86	NC_013442	GC	3	6	51965	51970	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
87	NC_013442	GC	3	6	52215	52220	0 %	0 %	50 %	50 %	262118158
88	NC_013442	GC	3	6	53914	53919	0 %	0 %	50 %	50 %	262118162
89	NC_013442	CG	3	6	54190	54195	0 %	0 %	50 %	50 %	262118163
90	NC_013442	GC	3	6	54465	54470	0 %	0 %	50 %	50 %	262118163
91	NC_013442	CA	3	6	54591	54596	50 %	0 %	0 %	50 %	262118163
92	NC_013442	TG	3	6	55016	55021	0 %	50 %	50 %	0 %	262118164
93	NC_013442	AC	3	6	55368	55373	50 %	0 %	0 %	50 %	262118164
94	NC_013442	CG	3	6	55525	55530	0 %	0 %	50 %	50 %	262118164
95	NC_013442	CG	3	6	56628	56633	0 %	0 %	50 %	50 %	262118166
96	NC_013442	CG	3	6	57815	57820	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
97	NC_013442	CG	3	6	57838	57843	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
98	NC_013442	CG	3	6	58166	58171	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
99	NC_013442	CT	3	6	58475	58480	0 %	50 %	0 %	50 %	262118168
100	NC_013442	CG	3	6	59264	59269	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
101	NC_013442	GC	3	6	59464	59469	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
102	NC_013442	GC	3	6	60138	60143	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
103	NC_013442	CG	3	6	61630	61635	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
104	NC_013442	CA	3	6	61938	61943	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
105	NC_013442	GC	3	6	62017	62022	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
106	NC_013442	CG	3	6	62039	62044	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
107	NC_013442	GC	3	6	62059	62064	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
108	NC_013442	GC	3	6	62260	62265	0 %	0 %	50 %	50 %	262118168
109	NC_013442	CA	3	6	63204	63209	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
110	NC_013442	AC	3	6	63346	63351	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
111	NC_013442	CA	3	6	63505	63510	50 %	0 %	0 %	50 %	262118168
112	NC_013442	TC	3	6	63856	63861	0 %	50 %	0 %	50 %	262118169
113	NC_013442	GT	3	6	63922	63927	0 %	50 %	50 %	0 %	262118169
114	NC_013442	GC	3	6	64053	64058	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
115	NC_013442	GT	3	6	64102	64107	0 %	50 %	50 %	0 %	262118169
116	NC_013442	CG	3	6	65175	65180	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
117	NC_013442	GC	3	6	65442	65447	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
118	NC_013442	GA	4	8	66048	66055	50 %	0 %	50 %	0 %	262118169
119	NC_013442	CG	3	6	66151	66156	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
120	NC_013442	GC	3	6	67235	67240	0 %	0 %	50 %	50 %	262118169
121	NC_013442	CT	3	6	69473	69478	0 %	50 %	0 %	50 %	262118169
122	NC_013442	CG	3	6	70087	70092	0 %	0 %	50 %	50 %	262118170
123	NC_013442	CG	3	6	71588	71593	0 %	0 %	50 %	50 %	262118173
124	NC_013442	GT	3	6	73315	73320	0 %	50 %	50 %	0 %	262118174
125	NC_013442	GC	4	8	73819	73826	0 %	0 %	50 %	50 %	262118174
126	NC_013442	GC	3	6	74802	74807	0 %	0 %	50 %	50 %	262118176
127	NC_013442	CG	3	6	75713	75718	0 %	0 %	50 %	50 %	262118176
128	NC_013442	GC	3	6	76386	76391	0 %	0 %	50 %	50 %	262118176
129	NC_013442	GT	4	8	77407	77414	0 %	50 %	50 %	0 %	262118177
130	NC_013442	GC	3	6	77449	77454	0 %	0 %	50 %	50 %	262118177
131	NC_013442	GC	3	6	77493	77498	0 %	0 %	50 %	50 %	262118177
132	NC_013442	GT	3	6	77562	77567	0 %	50 %	50 %	0 %	262118177
133	NC_013442	GC	3	6	78421	78426	0 %	0 %	50 %	50 %	262118179
134	NC_013442	AC	3	6	79347	79352	50 %	0 %	0 %	50 %	262118179
135	NC_013442	GC	3	6	79627	79632	0 %	0 %	50 %	50 %	262118179
136	NC_013442	GT	3	6	80228	80233	0 %	50 %	50 %	0 %	262118180
137	NC_013442	GC	3	6	80394	80399	0 %	0 %	50 %	50 %	262118180
138	NC_013442	GT	3	6	80625	80630	0 %	50 %	50 %	0 %	262118180

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.