MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gordonia bronchialis DSM 43247 chromosome

Total Repeats: 3873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013441	ACCAC	2	10	1744	1753	40 %	0 %	0 %	60 %	262200047
2	NC_013441	GGTGT	2	10	3079	3088	0 %	40 %	60 %	0 %	262200048
3	NC_013441	TCGGT	2	10	4574	4583	0 %	40 %	40 %	20 %	262200049
4	NC_013441	CCGAC	2	10	4863	4872	20 %	0 %	20 %	60 %	262200050
5	NC_013441	ATCTG	2	10	5909	5918	20 %	40 %	20 %	20 %	262200051
6	NC_013441	GAAGA	2	10	6496	6505	60 %	0 %	40 %	0 %	262200051
7	NC_013441	CCGCG	2	10	6744	6753	0 %	0 %	40 %	60 %	262200051
8	NC_013441	TGTCA	2	10	13804	13813	20 %	40 %	20 %	20 %	262200055
9	NC_013441	GCGCC	2	10	14537	14546	0 %	0 %	40 %	60 %	262200056
10	NC_013441	GTCCG	2	10	17371	17380	0 %	20 %	40 %	40 %	262200057
11	NC_013441	CGGTG	2	10	17597	17606	0 %	20 %	60 %	20 %	262200057
12	NC_013441	TCCGG	2	10	18581	18590	0 %	20 %	40 %	40 %	262200058
13	NC_013441	GGTGA	2	10	21902	21911	20 %	20 %	60 %	0 %	262200064
14	NC_013441	CGGCC	2	10	23744	23753	0 %	0 %	40 %	60 %	262200067
15	NC_013441	AGCCG	2	10	25196	25205	20 %	0 %	40 %	40 %	262200069
16	NC_013441	CGGTG	2	10	25332	25341	0 %	20 %	60 %	20 %	262200069
17	NC_013441	GACCG	2	10	26214	26223	20 %	0 %	40 %	40 %	262200069
18	NC_013441	AGACC	2	10	30311	30320	40 %	0 %	20 %	40 %	262200072
19	NC_013441	GGTCC	2	10	32380	32389	0 %	20 %	40 %	40 %	262200074
20	NC_013441	GATCA	2	10	36688	36697	40 %	20 %	20 %	20 %	262200077
21	NC_013441	CTCGC	2	10	38000	38009	0 %	20 %	20 %	60 %	262200077
22	NC_013441	CATTC	2	10	39585	39594	20 %	40 %	0 %	40 %	262200077
23	NC_013441	AGCGG	2	10	40274	40283	20 %	0 %	60 %	20 %	262200078
24	NC_013441	CAACG	2	10	40433	40442	40 %	0 %	20 %	40 %	262200078
25	NC_013441	GGTCT	2	10	41653	41662	0 %	40 %	40 %	20 %	262200078
26	NC_013441	AGTCC	2	10	41677	41686	20 %	20 %	20 %	40 %	262200078
27	NC_013441	CAATC	2	10	42124	42133	40 %	20 %	0 %	40 %	262200078
28	NC_013441	TCGGC	2	10	51757	51766	0 %	20 %	40 %	40 %	262200084
29	NC_013441	CGACG	2	10	51962	51971	20 %	0 %	40 %	40 %	262200084
30	NC_013441	CAACG	2	10	52883	52892	40 %	0 %	20 %	40 %	262200085
31	NC_013441	GCGAC	2	10	53029	53038	20 %	0 %	40 %	40 %	262200085
32	NC_013441	GCCGC	2	10	53623	53632	0 %	0 %	40 %	60 %	262200085
33	NC_013441	GACGC	2	10	54851	54860	20 %	0 %	40 %	40 %	262200086
34	NC_013441	CGGTG	2	10	57225	57234	0 %	20 %	60 %	20 %	262200089
35	NC_013441	TCCGA	2	10	58642	58651	20 %	20 %	20 %	40 %	262200091
36	NC_013441	CCGGT	2	10	59030	59039	0 %	20 %	40 %	40 %	262200091
37	NC_013441	GTTCC	2	10	59654	59663	0 %	40 %	20 %	40 %	262200091
38	NC_013441	TGCGT	2	10	68475	68484	0 %	40 %	40 %	20 %	262200099
39	NC_013441	CATCG	2	10	68592	68601	20 %	20 %	20 %	40 %	262200099
40	NC_013441	CGACG	2	10	68655	68664	20 %	0 %	40 %	40 %	262200099
41	NC_013441	TCCCG	2	10	68870	68879	0 %	20 %	20 %	60 %	262200099
42	NC_013441	ACGGC	2	10	69629	69638	20 %	0 %	40 %	40 %	262200099
43	NC_013441	CGCGG	2	10	70640	70649	0 %	0 %	60 %	40 %	262200101
44	NC_013441	CGACC	2	10	71483	71492	20 %	0 %	20 %	60 %	262200101
45	NC_013441	AGCGA	2	10	71922	71931	40 %	0 %	40 %	20 %	262200101
46	NC_013441	AGCGA	2	10	71958	71967	40 %	0 %	40 %	20 %	262200101
47	NC_013441	CGACG	2	10	73923	73932	20 %	0 %	40 %	40 %	262200104
48	NC_013441	CGGCG	2	10	75764	75773	0 %	0 %	60 %	40 %	262200105
49	NC_013441	ACGAC	2	10	76146	76155	40 %	0 %	20 %	40 %	262200106
50	NC_013441	CCTGG	2	10	78212	78221	0 %	20 %	40 %	40 %	262200107
51	NC_013441	ATGTC	2	10	78322	78331	20 %	40 %	20 %	20 %	262200107
52	NC_013441	TGCCC	2	10	79208	79217	0 %	20 %	20 %	60 %	262200108
53	NC_013441	CGGGT	2	10	79638	79647	0 %	20 %	60 %	20 %	262200108
54	NC_013441	CGGGG	2	10	79707	79716	0 %	0 %	80 %	20 %	262200108
55	NC_013441	GGTCG	2	10	79870	79879	0 %	20 %	60 %	20 %	262200108
56	NC_013441	GTCCG	2	10	80585	80594	0 %	20 %	40 %	40 %	262200109
57	NC_013441	ATCGC	2	10	82332	82341	20 %	20 %	20 %	40 %	262200110
58	NC_013441	AAACC	2	10	82665	82674	60 %	0 %	0 %	40 %	262200110
59	NC_013441	GCGCA	2	10	83881	83890	20 %	0 %	40 %	40 %	262200111
60	NC_013441	CGATC	2	10	85205	85214	20 %	20 %	20 %	40 %	262200112
61	NC_013441	GGACC	2	10	88549	88558	20 %	0 %	40 %	40 %	262200113
62	NC_013441	CGGGG	2	10	89082	89091	0 %	0 %	80 %	20 %	262200113
63	NC_013441	CACAC	2	10	90235	90244	40 %	0 %	0 %	60 %	262200115
64	NC_013441	CCCGG	2	10	90601	90610	0 %	0 %	40 %	60 %	262200115
65	NC_013441	CCAGG	2	10	94315	94324	20 %	0 %	40 %	40 %	262200118
66	NC_013441	GCGGG	2	10	94827	94836	0 %	0 %	80 %	20 %	262200119
67	NC_013441	ACCGC	2	10	98536	98545	20 %	0 %	20 %	60 %	262200123
68	NC_013441	GACAA	2	10	98647	98656	60 %	0 %	20 %	20 %	262200123
69	NC_013441	GCTGA	2	10	98799	98808	20 %	20 %	40 %	20 %	262200123
70	NC_013441	CGCGT	2	10	98949	98958	0 %	20 %	40 %	40 %	262200124
71	NC_013441	ATCAC	2	10	107485	107494	40 %	20 %	0 %	40 %	262200129
72	NC_013441	CGCTG	2	10	109955	109964	0 %	20 %	40 %	40 %	262200131
73	NC_013441	GTGGC	2	10	110398	110407	0 %	20 %	60 %	20 %	262200132
74	NC_013441	CGGCG	2	10	110938	110947	0 %	0 %	60 %	40 %	262200132
75	NC_013441	CCGAT	2	10	113978	113987	20 %	20 %	20 %	40 %	262200135
76	NC_013441	TCGTC	2	10	114848	114857	0 %	40 %	20 %	40 %	262200136
77	NC_013441	GCGAC	2	10	115617	115626	20 %	0 %	40 %	40 %	262200137
78	NC_013441	CGATC	2	10	116274	116283	20 %	20 %	20 %	40 %	262200138
79	NC_013441	GGAGT	2	10	122784	122793	20 %	20 %	60 %	0 %	262200143
80	NC_013441	CCGCA	2	10	124074	124083	20 %	0 %	20 %	60 %	262200144
81	NC_013441	TGCTG	2	10	125785	125794	0 %	40 %	40 %	20 %	262200145
82	NC_013441	GCCGC	2	10	126454	126463	0 %	0 %	40 %	60 %	262200146
83	NC_013441	TCTCG	2	10	130328	130337	0 %	40 %	20 %	40 %	262200151
84	NC_013441	GTCGC	2	10	130817	130826	0 %	20 %	40 %	40 %	262200152
85	NC_013441	TCGCG	2	10	133367	133376	0 %	20 %	40 %	40 %	262200153
86	NC_013441	GTTGC	2	10	133405	133414	0 %	40 %	40 %	20 %	262200153
87	NC_013441	GACGT	2	10	135335	135344	20 %	20 %	40 %	20 %	262200153
88	NC_013441	CACCG	2	10	135387	135396	20 %	0 %	20 %	60 %	262200153
89	NC_013441	CCTCG	2	10	136398	136407	0 %	20 %	20 %	60 %	262200153
90	NC_013441	GATCA	2	10	141924	141933	40 %	20 %	20 %	20 %	262200158
91	NC_013441	CGCAC	2	10	142397	142406	20 %	0 %	20 %	60 %	262200159
92	NC_013441	GGCCG	2	10	143743	143752	0 %	0 %	60 %	40 %	262200161
93	NC_013441	ACGGC	2	10	144060	144069	20 %	0 %	40 %	40 %	262200161
94	NC_013441	CGGCT	2	10	144457	144466	0 %	20 %	40 %	40 %	262200161
95	NC_013441	CGCGC	2	10	149735	149744	0 %	0 %	40 %	60 %	262200165
96	NC_013441	GGAGC	2	10	151128	151137	20 %	0 %	60 %	20 %	262200168
97	NC_013441	GGCAA	2	10	151200	151209	40 %	0 %	40 %	20 %	262200168
98	NC_013441	CAGCG	2	10	155137	155146	20 %	0 %	40 %	40 %	262200172
99	NC_013441	CCCGG	2	10	155303	155312	0 %	0 %	40 %	60 %	262200172
100	NC_013441	CCGAT	2	10	155819	155828	20 %	20 %	20 %	40 %	262200172
101	NC_013441	CGCGA	2	10	156195	156204	20 %	0 %	40 %	40 %	262200173
102	NC_013441	CGGTG	2	10	158087	158096	0 %	20 %	60 %	20 %	262200176
103	NC_013441	TGGCG	2	10	159227	159236	0 %	20 %	60 %	20 %	262200176
104	NC_013441	TCGTC	2	10	160440	160449	0 %	40 %	20 %	40 %	262200177
105	NC_013441	CGTCG	2	10	161193	161202	0 %	20 %	40 %	40 %	262200178
106	NC_013441	ACCCG	2	10	162097	162106	20 %	0 %	20 %	60 %	262200179
107	NC_013441	TGCGC	2	10	163596	163605	0 %	20 %	40 %	40 %	262200181
108	NC_013441	CCGCA	2	10	164220	164229	20 %	0 %	20 %	60 %	262200182
109	NC_013441	CGTCG	2	10	164703	164712	0 %	20 %	40 %	40 %	262200182
110	NC_013441	CCGGG	2	10	165704	165713	0 %	0 %	60 %	40 %	262200183
111	NC_013441	CCGAG	2	10	169953	169962	20 %	0 %	40 %	40 %	262200188
112	NC_013441	CGATC	2	10	170164	170173	20 %	20 %	20 %	40 %	262200188
113	NC_013441	CCCGG	2	10	170816	170825	0 %	0 %	40 %	60 %	262200189
114	NC_013441	CGACG	2	10	170870	170879	20 %	0 %	40 %	40 %	262200189
115	NC_013441	CGACG	2	10	171107	171116	20 %	0 %	40 %	40 %	262200189
116	NC_013441	GTCCC	2	10	172256	172265	0 %	20 %	20 %	60 %	262200190
117	NC_013441	GCTCG	2	10	177189	177198	0 %	20 %	40 %	40 %	262200196
118	NC_013441	ATCGA	2	10	180630	180639	40 %	20 %	20 %	20 %	262200200
119	NC_013441	GCCCG	2	10	181190	181199	0 %	0 %	40 %	60 %	262200201
120	NC_013441	CGGAT	2	10	183288	183297	20 %	20 %	40 %	20 %	262200203
121	NC_013441	GATCG	2	10	184718	184727	20 %	20 %	40 %	20 %	262200205
122	NC_013441	ACGGA	2	10	184823	184832	40 %	0 %	40 %	20 %	262200205
123	NC_013441	CACCC	2	10	186037	186046	20 %	0 %	0 %	80 %	262200206
124	NC_013441	CGCGG	2	10	186482	186491	0 %	0 %	60 %	40 %	262200206
125	NC_013441	CGGCC	2	10	187881	187890	0 %	0 %	40 %	60 %	262200208
126	NC_013441	CCGCC	3	15	188448	188462	0 %	0 %	20 %	80 %	262200208
127	NC_013441	ACCGC	2	10	188483	188492	20 %	0 %	20 %	60 %	262200208
128	NC_013441	GAATC	2	10	188576	188585	40 %	20 %	20 %	20 %	262200208
129	NC_013441	CGCGA	2	10	188591	188600	20 %	0 %	40 %	40 %	262200208
130	NC_013441	GTTCG	2	10	188958	188967	0 %	40 %	40 %	20 %	262200209
131	NC_013441	CGCAG	2	10	190475	190484	20 %	0 %	40 %	40 %	262200211
132	NC_013441	AACCG	2	10	190924	190933	40 %	0 %	20 %	40 %	262200211
133	NC_013441	GGCCG	2	10	191788	191797	0 %	0 %	60 %	40 %	262200212
134	NC_013441	GTCGC	2	10	193789	193798	0 %	20 %	40 %	40 %	262200214
135	NC_013441	GACGC	2	10	194986	194995	20 %	0 %	40 %	40 %	262200215
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149	NC_013441	GGCGT	2	10	214153	214162	0 %	20 %	60 %	20 %	262200233
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246	NC_013441	CGTGC	2	10	319080	319089	0 %	20 %	40 %	40 %	262200313
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248	NC_013441	GTCGG	2	10	321316	321325	0 %	20 %	60 %	20 %	262200316
249	NC_013441	CGACG	2	10	323375	323384	20 %	0 %	40 %	40 %	262200318
250	NC_013441	GGTCG	2	10	323486	323495	0 %	20 %	60 %	20 %	262200318
251	NC_013441	CACCT	2	10	324913	324922	20 %	20 %	0 %	60 %	262200319
252	NC_013441	CCGGC	2	10	327201	327210	0 %	0 %	40 %	60 %	262200323
253	NC_013441	CGCGG	2	10	328348	328357	0 %	0 %	60 %	40 %	262200323
254	NC_013441	GCCGG	2	10	331627	331636	0 %	0 %	60 %	40 %	262200326
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256	NC_013441	GTCCG	2	10	333541	333550	0 %	20 %	40 %	40 %	262200328
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258	NC_013441	CGTGT	2	10	335800	335809	0 %	40 %	40 %	20 %	262200330
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260	NC_013441	CGATG	2	10	336325	336334	20 %	20 %	40 %	20 %	262200331
261	NC_013441	CCGCA	2	10	339346	339355	20 %	0 %	20 %	60 %	262200333
262	NC_013441	GACCG	2	10	339577	339586	20 %	0 %	40 %	40 %	262200333
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389	NC_013441	GGATG	2	10	522227	522236	20 %	20 %	60 %	0 %	262200490
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391	NC_013441	GCCCG	2	10	524173	524182	0 %	0 %	40 %	60 %	262200492
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