MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haliangium ochraceum DSM 14365 chromosome

Total Repeats: 7363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013440	GCGCC	2	10	455	464	0 %	0 %	40 %	60 %	262193327
2	NC_013440	GGGCA	2	10	3526	3535	20 %	0 %	60 %	20 %	262193329
3	NC_013440	CGACG	2	10	4425	4434	20 %	0 %	40 %	40 %	262193329
4	NC_013440	AGGTG	2	10	11857	11866	20 %	20 %	60 %	0 %	262193334
5	NC_013440	GCATC	2	10	13180	13189	20 %	20 %	20 %	40 %	262193335
6	NC_013440	GACGG	2	10	13818	13827	20 %	0 %	60 %	20 %	262193336
7	NC_013440	CGGCG	2	10	14399	14408	0 %	0 %	60 %	40 %	262193337
8	NC_013440	CGCTG	2	10	14773	14782	0 %	20 %	40 %	40 %	262193337
9	NC_013440	GCTGC	2	10	17340	17349	0 %	20 %	40 %	40 %	262193339
10	NC_013440	CGGGG	2	10	18001	18010	0 %	0 %	80 %	20 %	262193340
11	NC_013440	TGCTC	2	10	18518	18527	0 %	40 %	20 %	40 %	262193341
12	NC_013440	GCCGC	2	10	18822	18831	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13	NC_013440	AGGCC	2	10	19564	19573	20 %	0 %	40 %	40 %	262193342
14	NC_013440	AATCG	2	10	22324	22333	40 %	20 %	20 %	20 %	262193345
15	NC_013440	GCCGA	2	10	24341	24350	20 %	0 %	40 %	40 %	262193347
16	NC_013440	AGCCG	2	10	26026	26035	20 %	0 %	40 %	40 %	262193347
17	NC_013440	AGCCG	2	10	27425	27434	20 %	0 %	40 %	40 %	262193349
18	NC_013440	TGCTC	2	10	27602	27611	0 %	40 %	20 %	40 %	262193349
19	NC_013440	GCCCA	2	10	27733	27742	20 %	0 %	20 %	60 %	262193349
20	NC_013440	CGGCG	2	10	31134	31143	0 %	0 %	60 %	40 %	262193349
21	NC_013440	GGGCG	2	10	32193	32202	0 %	0 %	80 %	20 %	262193349
22	NC_013440	CGGCG	2	10	32481	32490	0 %	0 %	60 %	40 %	262193349
23	NC_013440	GCGTC	2	10	32833	32842	0 %	20 %	40 %	40 %	262193349
24	NC_013440	ACTTC	2	10	34022	34031	20 %	40 %	0 %	40 %	262193350
25	NC_013440	GCGCG	2	10	35546	35555	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
26	NC_013440	GCTCG	2	10	35805	35814	0 %	20 %	40 %	40 %	262193351
27	NC_013440	CCGGC	2	10	36386	36395	0 %	0 %	40 %	60 %	262193351
28	NC_013440	CGGCG	2	10	36524	36533	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
29	NC_013440	GCGCG	2	10	37202	37211	0 %	0 %	60 %	40 %	262193351
30	NC_013440	CCGAC	2	10	39587	39596	20 %	0 %	20 %	60 %	262193352
31	NC_013440	CGAGC	2	10	39883	39892	20 %	0 %	40 %	40 %	262193352
32	NC_013440	CGGCG	2	10	42139	42148	0 %	0 %	60 %	40 %	262193355
33	NC_013440	GACCG	2	10	44798	44807	20 %	0 %	40 %	40 %	262193356
34	NC_013440	GGCGC	2	10	45915	45924	0 %	0 %	60 %	40 %	262193357
35	NC_013440	CGCGC	2	10	45933	45942	0 %	0 %	40 %	60 %	262193357
36	NC_013440	CGGTC	2	10	46623	46632	0 %	20 %	40 %	40 %	262193357
37	NC_013440	GAACA	2	10	47892	47901	60 %	0 %	20 %	20 %	262193358
38	NC_013440	GAACA	2	10	48734	48743	60 %	0 %	20 %	20 %	262193359
39	NC_013440	AGCCC	2	10	49368	49377	20 %	0 %	20 %	60 %	262193359
40	NC_013440	CGGCC	2	10	50050	50059	0 %	0 %	40 %	60 %	262193360
41	NC_013440	AGCGC	2	10	53138	53147	20 %	0 %	40 %	40 %	262193360
42	NC_013440	TCGCC	2	10	53452	53461	0 %	20 %	20 %	60 %	262193360
43	NC_013440	GCCGC	2	10	59810	59819	0 %	0 %	40 %	60 %	262193361
44	NC_013440	GCCAG	2	10	61963	61972	20 %	0 %	40 %	40 %	262193362
45	NC_013440	GCCAG	2	10	64733	64742	20 %	0 %	40 %	40 %	262193363
46	NC_013440	CGAAG	2	10	67038	67047	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_013440	CGGCC	2	10	70328	70337	0 %	0 %	40 %	60 %	262193365
48	NC_013440	GCCCG	2	10	76816	76825	0 %	0 %	40 %	60 %	262193371
49	NC_013440	GCCGG	2	10	79917	79926	0 %	0 %	60 %	40 %	262193375
50	NC_013440	GCGCC	2	10	80841	80850	0 %	0 %	40 %	60 %	262193376
51	NC_013440	CGGCG	2	10	83095	83104	0 %	0 %	60 %	40 %	262193377
52	NC_013440	GCGCG	2	10	84416	84425	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_013440	CGAGC	2	10	85549	85558	20 %	0 %	40 %	40 %	262193380
54	NC_013440	CGGCG	2	10	86858	86867	0 %	0 %	60 %	40 %	262193381
55	NC_013440	CCGCG	2	10	86927	86936	0 %	0 %	40 %	60 %	262193381
56	NC_013440	CAGCG	2	10	87534	87543	20 %	0 %	40 %	40 %	262193382
57	NC_013440	GCTGG	2	10	90036	90045	0 %	20 %	60 %	20 %	262193384
58	NC_013440	CGGCG	2	10	90796	90805	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_013440	GCGCG	2	10	91770	91779	0 %	0 %	60 %	40 %	262193385
60	NC_013440	CGACG	2	10	93482	93491	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_013440	GCGCC	2	10	93742	93751	0 %	0 %	40 %	60 %	262193388
62	NC_013440	CGCGA	2	10	95077	95086	20 %	0 %	40 %	40 %	262193390
63	NC_013440	CAGCT	2	10	101305	101314	20 %	20 %	20 %	40 %	262193393
64	NC_013440	ACGCG	2	10	106500	106509	20 %	0 %	40 %	40 %	262193395
65	NC_013440	TCCGT	2	10	108874	108883	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
66	NC_013440	GCCCG	3	15	114621	114635	0 %	0 %	40 %	60 %	262193399
67	NC_013440	CCAGG	2	10	115713	115722	20 %	0 %	40 %	40 %	262193400
68	NC_013440	GCGCC	2	10	115935	115944	0 %	0 %	40 %	60 %	262193400
69	NC_013440	CCAGC	2	10	117814	117823	20 %	0 %	20 %	60 %	262193402
70	NC_013440	CCGCC	2	10	118683	118692	0 %	0 %	20 %	80 %	262193402
71	NC_013440	GGACG	2	10	119940	119949	20 %	0 %	60 %	20 %	262193403
72	NC_013440	AGAGC	2	10	121572	121581	40 %	0 %	40 %	20 %	262193403
73	NC_013440	CGCGC	2	10	123964	123973	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
74	NC_013440	GGGTC	2	10	124403	124412	0 %	20 %	60 %	20 %	262193405
75	NC_013440	CAGCG	2	10	125337	125346	20 %	0 %	40 %	40 %	262193405
76	NC_013440	CGCAG	2	10	126643	126652	20 %	0 %	40 %	40 %	262193405
77	NC_013440	GCTGG	2	10	126719	126728	0 %	20 %	60 %	20 %	262193405
78	NC_013440	GCTCC	2	10	129244	129253	0 %	20 %	20 %	60 %	262193406
79	NC_013440	GCGCT	2	10	129580	129589	0 %	20 %	40 %	40 %	262193407
80	NC_013440	GCGCG	2	10	131286	131295	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_013440	GTGGC	2	10	131814	131823	0 %	20 %	60 %	20 %	262193408
82	NC_013440	GCGCC	2	10	131888	131897	0 %	0 %	40 %	60 %	262193408
83	NC_013440	AGCGC	2	10	131908	131917	20 %	0 %	40 %	40 %	262193408
84	NC_013440	GCGCC	2	10	132778	132787	0 %	0 %	40 %	60 %	262193409
85	NC_013440	GCGCC	2	10	135568	135577	0 %	0 %	40 %	60 %	262193410
86	NC_013440	CGGGC	2	10	136515	136524	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
87	NC_013440	AGGGC	2	10	136567	136576	20 %	0 %	60 %	20 %	262193412
88	NC_013440	CGGCG	3	15	137290	137304	0 %	0 %	60 %	40 %	262193412
89	NC_013440	GCCGA	2	10	138192	138201	20 %	0 %	40 %	40 %	262193412
90	NC_013440	GGCGC	2	10	138446	138455	0 %	0 %	60 %	40 %	262193412
91	NC_013440	CCGCA	2	10	138556	138565	20 %	0 %	20 %	60 %	262193412
92	NC_013440	AGGCC	2	10	140450	140459	20 %	0 %	40 %	40 %	262193414
93	NC_013440	AGCGC	2	10	147307	147316	20 %	0 %	40 %	40 %	262193420
94	NC_013440	GGATG	2	10	147434	147443	20 %	20 %	60 %	0 %	262193420
95	NC_013440	GATCG	2	10	148117	148126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_013440	GCCGC	2	10	148941	148950	0 %	0 %	40 %	60 %	262193421
97	NC_013440	CCTGG	2	10	150168	150177	0 %	20 %	40 %	40 %	262193423
98	NC_013440	TCACC	2	10	150945	150954	20 %	20 %	0 %	60 %	262193424
99	NC_013440	GGCGC	2	10	151002	151011	0 %	0 %	60 %	40 %	262193424
100	NC_013440	GGCGC	2	10	151206	151215	0 %	0 %	60 %	40 %	262193424
101	NC_013440	CGAGG	2	10	154082	154091	20 %	0 %	60 %	20 %	262193425
102	NC_013440	CTTTC	2	10	155960	155969	0 %	60 %	0 %	40 %	262193426
103	NC_013440	ACGCC	2	10	157186	157195	20 %	0 %	20 %	60 %	262193427
104	NC_013440	CGCGC	2	10	158048	158057	0 %	0 %	40 %	60 %	262193427
105	NC_013440	GGGGC	2	10	158255	158264	0 %	0 %	80 %	20 %	262193427
106	NC_013440	GCGCC	2	10	158519	158528	0 %	0 %	40 %	60 %	262193427
107	NC_013440	TCGCG	2	10	162348	162357	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
108	NC_013440	TCAGC	2	10	162582	162591	20 %	20 %	20 %	40 %	262193429
109	NC_013440	CGGCG	2	10	163898	163907	0 %	0 %	60 %	40 %	262193430
110	NC_013440	AGCGC	2	10	166916	166925	20 %	0 %	40 %	40 %	262193432
111	NC_013440	GCGCC	2	10	167178	167187	0 %	0 %	40 %	60 %	262193432
112	NC_013440	GCAAC	2	10	168182	168191	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_013440	TCGCC	2	10	168286	168295	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_013440	TCGTG	2	10	172519	172528	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_013440	GAGGC	2	10	173319	173328	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
116	NC_013440	GCTGA	2	10	173554	173563	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
117	NC_013440	CGAGC	2	10	177563	177572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_013440	GGGTC	2	10	177577	177586	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
119	NC_013440	GCGCC	2	10	177904	177913	0 %	0 %	40 %	60 %	262193438
120	NC_013440	GGTCG	2	10	178796	178805	0 %	20 %	60 %	20 %	262193438
121	NC_013440	CGGCG	2	10	179540	179549	0 %	0 %	60 %	40 %	262193439
122	NC_013440	ACGGC	2	10	180833	180842	20 %	0 %	40 %	40 %	262193440
123	NC_013440	GCTCA	2	10	181164	181173	20 %	20 %	20 %	40 %	262193440
124	NC_013440	TTGCC	2	10	181808	181817	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
125	NC_013440	AGGCG	2	10	181906	181915	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
126	NC_013440	AGCTG	2	10	183528	183537	20 %	20 %	40 %	20 %	262193443
127	NC_013440	GCGTG	2	10	185269	185278	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_013440	GAGCT	2	10	188942	188951	20 %	20 %	40 %	20 %	262193445
129	NC_013440	AGCTC	2	10	192769	192778	20 %	20 %	20 %	40 %	262193450
130	NC_013440	GGTCG	2	10	192968	192977	0 %	20 %	60 %	20 %	262193450
131	NC_013440	GCCCA	2	10	193788	193797	20 %	0 %	20 %	60 %	262193450
132	NC_013440	GCGCC	2	10	194981	194990	0 %	0 %	40 %	60 %	262193450
133	NC_013440	GCGCC	2	10	195244	195253	0 %	0 %	40 %	60 %	262193450
134	NC_013440	GGCCA	2	10	195515	195524	20 %	0 %	40 %	40 %	262193450
135	NC_013440	GGGAT	2	10	198565	198574	20 %	20 %	60 %	0 %	262193453
136	NC_013440	GGCCG	2	10	200916	200925	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
137	NC_013440	AGGCC	2	10	203285	203294	20 %	0 %	40 %	40 %	262193457
138	NC_013440	CGGCG	2	10	206285	206294	0 %	0 %	60 %	40 %	262193460
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141	NC_013440	GGTCT	2	10	209513	209522	0 %	40 %	40 %	20 %	262193464
142	NC_013440	GCCGC	2	10	209886	209895	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
143	NC_013440	CCCGG	2	10	209946	209955	0 %	0 %	40 %	60 %	262193465
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175	NC_013440	TGCGT	2	10	257633	257642	0 %	40 %	40 %	20 %	262193494
176	NC_013440	CGGCC	2	10	257795	257804	0 %	0 %	40 %	60 %	262193494
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263	NC_013440	CGCTG	2	10	385715	385724	0 %	20 %	40 %	40 %	262193585
264	NC_013440	CGCGG	2	10	386888	386897	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
265	NC_013440	AGCTC	2	10	386963	386972	20 %	20 %	20 %	40 %	262193586
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